Венецианцы с особой любовью относились к мозаичному искусству. Первоначально они приглашали мастеров из Византии, но уже с XII–XIV вв. их мастерство переняли венецианские художники, и в Венеции сложилась собственная школа мозаичного искусства.
Мозаики на стенах собора расположены в строгом порядке, начиная с образа Христа и сцен из жизни двенадцати апостолов и заканчивая образами всех святых и покровителей Венеции.
Самая ранняя мозаика – изображение святого Марка и святого Николая – датируется IX в. В XII в. выполнены композиции сцен сошествия Святого Духа на апостолов. В XIII в. начинается расцвет искусства мозаики. В это время появилась мозаика «Христос в Гефсиманском саду», в которой сохранился византийский золотой фон, но присутствует венецианское конкретное мировосприятие. Сохранила византийские черты и мозаика в центре купола (XIII в.) под названием «Вознесение Христа».
На опорных арках купола – сцены из Нового Завета: детство Христа, чудеса, творимые им, Распятие и Воскресение. Венецианское в этих композициях проявилось в стремлении к красочности и праздничности. Красота мозаик и мрамора стен сочетается с орнаментом пола, который особенно поражает блеском красок после паводка, когда вода поднимается до уровня пола атриума.
В центре в пол вделана красная плита, у которой тоже своя легенда. Плита указывает место, где 23 июля 1177 г. произошла встреча папы Александра III (1159–1181) и императора Фридриха I Барбароссы. Папа Александр III был врагом императора, который противопоставлял ему другого папу – Пасхалия III (1164–1168). В 1176 г. император, потерпев поражение в битве при Леньяно, оказался вынужденным вступить в переговоры с Александром III.
Летом 1177 г. в Венеции противники заключили мир, а около собора Святого Марка Фридрих I преклонил колени перед папой-победителем. Император сказал при этом, что падает ниц не перед папой, а перед святым Петром, на что папа рассудительно ответил: «И предо мною, и пред Петром».
Пол храма выложен разноцветными мраморными плитками. Из разноцветных мраморов выполнена и пересекающая пространство собора алтарная преграда, украшенная колоннами и скульптурами.
Над ней возвышается массивное бронзовое распятие, украшенное серебром, – работа венецианского мастера Джакопо ди Марко Беннато.
В алтарной части храма находится одна из главных святынь Венеции – «Золотой алтарь». Привезенный в Венецию из Константинополя и хранящийся в соборе Сан-Марко, алтарь является одним из самых выдающихся шедевров византийской перегородчатой эмали, квинтэссенцией византийского искусства. Алтарь был заказан в X в. дожем Пьетро Орсеоло I (годы правления 991-1008) константинопольскому мастеру и впоследствии неоднократно переделывался. Центром алтаря является величественная фигура Христа, возвещающего миру: «Аз есмь Свет». Створки алтаря украшают медальоны с эмалевыми изображениями византийских императоров и святых в сиянии золота и многочисленных драгоценных камней (всего их насчитывается 1927, в том числе 320 изумрудов, 255 сапфиров и 75 рубинов). Алтарь собора Сан-Марко отличают роскошь, красочное великолепие, и вместе с тем монументальность и внутренняя значительность образов в сочетании с непревзойденной по тонкости ювелирной работой.
Слева от главного алтаря находится алтарь с иконой «Мадонна Никопея» («Приносящая победу»). Некогда эта икона, относящаяся к X в., принадлежала монастырю Иоанна Богослова в Константинополе. В 1234 г. она была перенесена в Венецию. Икона обрамлена богатым золотым окладом, украшенным византийскими эмалями и драгоценными камнями.
Как и все другие католические храмы, собор Сан-Марко за столетия своего существования оброс часовнями-капеллами. В одной из них, капелле Святого Исидора, находится мраморная гробница, в которой погребен сам святой. А в крещальне-баптистерии находится надгробие дожа Андреа Дандоло (годы правления 1343–1353), одного из самых выдающихся деятелей венецианской истории, друга Петрарки. Своды баптистерия, как и самого собора, покрывает сплошной ковер мозаик, а в центре находится мраморная купель, созданная в начале XVI в. скульптором и архитектором Якопо Сансовино (1486–1570).
Но самое прославленное из хранящихся здесь изображений – это фигура Саломеи в красных одеждах, с головой Иоанна Крестителя на блюде. Это произведение вдохновило А. А. Блока на такие строки:
Рядом с алтарем расположена капелла Исидора. В ней помещен саркофаг, в котором находятся реликвии этого святого.