Вирусы: Скорее друзья, чем враги

триплет, состоящий из трех нуклеотидов, кодирующих одну аминокислоту; триплетов больше, чем аминокислот («принцип избыточности»); «кодирующая ДНК или РНК» означает, что с них может осуществляться трансляция в белок, а с некодирующих ДНК/РНК – не может.

(Cold Spring Harbor)  лаборатория, издательство и место проведения конференций; находится недалеко от Нью-Йорка; на базе данной лаборатории проводятся симпозиумы по количественной биологии.

наследование приобретенных качеств, заявленное ботаником и философом Жаном Батистом Ламарком.

лимфома Буркитта. Также см. ВЭБ (EBV)

разрушение бактерии-хозяина фагом, который лизирует бактерию-хозяина в силу стресса и других факторов среды, вызывает дерепрессию и продуцирует большое количество потомков – вирусных частиц. Противоположностью разрушению является «лизогенная фаза», при которой фаговая ДНК интегрируется, становясь постоянной или устойчивой.

сумма всех геномов организма, любого образца, экосистемы, канализационных стоков, фекалий, легких и т.д.

опухолевая клетка, выходящая за пределы клеточной массы опухоли и размещающаяся на других участках организма; рост переместившихся клеток приводит к развитию опухоли в других локациях; поздняя стадия рака.

 Малая регуляторная или сайленсорная РНК возникает из информационной мРНК или вирусных двухцепочечных РНК-интермедиатов путем процессинга и расщепления при помощи фермента  (молекулярных «ножниц»); она экспортируются из ядер, далее подвергается обработке при помощи RISC, и получается двухспиральная цепочка примерно из 22 нуклеотидов, затем происходит удаление одной цепочки РНК, а другая связывается в РНК-мишени с соответствующей последовательностью, расщепляет ее и таким образом прекращает трансляцию и экспрессию белка, обуславливая сайленсинг или полное выключение какого-либо гена. Известны два эффекта сайленсинга – во-первых, транскрипционный сайленсинг гена (ТСГ), действующий на промотор путем РНК-индуцированного метилирования, а во-вторых, посттранскрипционный сайленсинг гена (ПТСГ), при котором происходит связывание siРНК с транскрибированной мРНК гена и ее расщепление, что приводит к сайленсингу генной экспрессии и прекращению трансляции.

описание коллективного генома всех микроорганизмов в образце; у человека бактериальных клеток в 10 раз больше, чем клеток организма, в том числе около 5 млн бактериальных генов в дополнение к 20 000 оригинальных генов человека; это наш второй геном.

сообщество микроорганизмов, ранее называвшееся микрофлорой; микробиота населяет определенные места обитания в организме, в частности, кишечник, влагалище, кожу; чаще всего гомологична микробиому.

 – «электростанция» эукариотических клеток; является поставщиком клеточной химической энергии; появилась из бактерии, «захваченной» при симбиозе; при этом потеря генов составляет до 90% и наблюдается высокая степень специализации.

 Микро-РНК получается из предшественника двухцепочечной РНК, процессированного белковым комплексом RISC при помощи молекулярных «ножниц» (вышеупомянутый  содержит домены Paz и PIWI), которые разделяют цепочки; одна цепочка уничтожается, а другая специфически связывает последовательность с целевой (таргетной) РНК, подлежащей уничтожению. RISC – это РНК-индуцированный комплекс сайленсинга.

 – мозговой нейротрофический фактор, сигнальная молекула, играющая роль в коммуникации между кишечником и клетками головного мозга.

группы ВИЧ, в которых поверхностные белки обладают определенными характеристиками; M (основная группа) – пандемическая, C – преобладает в Южной Африке.

; характеризуется множественной резистентностью и является госпитальным контаминантом, что повышает угрозу для пациентов и показатель смертности.

генетически измененный ген; изменения могут быть спонтанными или приобретенными, а также возникшими в результате экспериментов, проводимых в пробирке, что может сформировать резистентность к противовирусной и противораковой терапии.

 – мыши, окрас которых указывает на средовые эффекты, включая канцерогены; шерсть желтого цвета и ожирение свидетельствуют о том, что мыши едят корм, содержащий канцерогены, что вызывает эпигенетические изменения; генетически они идентичны здоровым худым мышам темного окраса.

Национальное управление по аэронавтике и исследованию космического пространства.

 – нейтрализующие антитела широкого спектра к различным штаммам ВИЧ, которые нейтрализуют вирус, блокируют захват клеткой вируса и инфицирование.

некодирующие ДНК или РНК, не содержащие триплеты, поэтому в них нет информации для белков; не кодируют аминокислоты; зачастую выполняют регуляторные функции, регулируют структурную информацию и осуществляют взаимодействие последовательностей.