Также для более оперативной работы внешней разведки 5 октября 1938 года в 5-й отдел ГУГБ были переданы функции и штаты упраздненного Особого бюро при секретариате НКВД СССР. Особое бюро было организовано 15 февраля 1937 года и являлось первым информационно-аналитическим подразделением в системе НКВД. Среди прочего в его функции входили подготовка справочных материалов по формам и методам работы иностранных разведок и контрразведок, составление характеристик на государственных и политических деятелей зарубежных стран, подготовка учебных пособий. Особое бюро возглавляли Валерий Михайлович
25 ноября 1938 года указом ПВС СССР Н. И. Ежов был освобожден от должности наркома внутренних дел СССР, а на его место был назначен Л. П. Берия. А постановлением СНК СССР от 16 декабря и приказом НКВД СССР от 17 декабря 1938 года первым заместителем наркома внутренних дел СССР и начальником ГУГБ был назначен комиссар госбезопасности 3-го ранга В. Н. Меркулов.
Пришедший к руководству Наркоматом внутренних дел Берия Расставил на ключевые посты своих людей, прибывших вместе с ним из Грузии. Кроме того, им была проведена «чистка» ежовских кадров, как в Центре, так и на местах. Все эти перестановки затронули и внешнюю разведку.
22 октября 1938 года был арестован начальник ИНО
Что касается структуры 5-го отдела, то она в 1939–1940 годах выглядела следующим образом: Секретариат;
1-е отделение — Германия, Венгрия, Дания;
2-е отделение — Польша;
3-е отделение — Франция, Бельгия, Швейцария, Голландия;
4-е отделение — Англия;
5-е отделение — Италия;
6-е отделение — Испания;
7-е отделение — Румыния, Болгария, Югославия, Греция;
8-е отделение — Финляндия, Швеция, Норвегия;
9-е отделение — Латвия, Эстония, Литва;
10-е отделение — США, Канада, Мексика, Южная Америка;
11-е отделение — Япония, Маньчжурия;
12-е отделение — Китай, Синьцзян;
13-е отделение — Монголия, Тува;
14-е отделение — Турция, Иран, Афганистан;
15-е отделение-техническая (научно-техническая) разведка;
16-е отделение — оперативная техника;
17-е отделение — визы и учет иностранцев
[170].Однако не имеющий опыта разведывательной работы Владимир Деканозов 13 мая 1939 года был освобожден от должности начальника ИНО и назначен заместителем наркома иностранных дел СССР. А его место занял старший майор госбезопасности Павел Михайлович Фитин
[171].К 1 января 1940 года численность центрального аппарата советской внешней разведки достигла 225 сотрудников.
Согласно постановлению Политбюро ЦК ВКП(б) от 25 сентября 1940 года до конца 1940 года НКВД на «расходы по закордонной работе (в валюте разных стран по заявкам НКВД)» было ассигновано «1 миллион рублей и в монгольских тугриках 420 тысяч рублей»
[172].К концу 1940 года общая численность сотрудников внешней разведки достигла 695 человек (из них 235 сотрудников центрального аппарата).
Структура центрального аппарата в конце 1940 года:
• секретариат;
• три европейских отделения;
• американское отделение;
• ближневосточное отделение;
• дальневосточное отделение;
• информационно-аналитическое отделение;
• оперативно-техническое отделение;
• кадровое отделение;
• финансовое отделение;
• хозяйственное отделение.
На февраль 1941 года за рубежом действовало 45 легальных резидентур, в которых работало 242 разведчика, имевших на связи свыше 600 агентов. Самые крупные резидентуры действовали в США — 18 человек, Финляндии — 17 человек и Германии — 13 человек.
Помимо легальных резидентур действовало 14 нелегальных резидентур. В Германии, Франции и Великобритании работало по 2–4 нелегальных резидентуры.
3 февраля 1941 года состоялось заседание Политбюро, на котором было принято постановление о разделении НКВД СССР на два наркомата: НКВД СССР и НКГБ СССР с выделением всех оперативно-чекистских подразделений из НКВД в НКГБ, а на местах — из НКВД/УНКВД республик, краев и областей в НКГБ/ УНКГБ.