Еще до нападения на Перл-Харбор американцы сумели разгадать систему дипломатического кода японцев. Сообщения, перехваченные незадолго до 7 декабря 1941 года, свидетельствовали, что на Тихом океане готовится какая-то крупная военная акция, однако ее цель либо обозначалась неопределенно, либо игнорировалась американскими военными по большей части из-за национального самомнения, а также соперничества между различными службами. Японцы, в свою очередь, предприняли ряд мер для обеспечения внезапности атаки. Один американский военно-морской атташе в Японии сообщал, что видел в одном из главных портовых городов страны сотни отпущенных в увольнение японских моряков. Следовательно, делал он вывод, осуществление какой-либо военной акции в ближайшее время маловероятно. На самом же деле, отправив авианосный флот к Гавайям для нанесения удара, японцы просто одели в морскую форму своих солдат, чтобы создать у иностранных шпионов впечатление, что все идет как обычно.
В 1937 году японцы создали новую шифровальную машину Номер 97, носившей кодовое название «Перпл». На протяжении 19 месяцев американские специалисты бились над его расшифровкой, и в конце концов Уильяму Фридману и его коллегам из SIS (Secret Intelligence Service, — британская разведка. — Прим. ред.) удалось раскрыть секрет «Перпла».
Американцы уже создавали в свое время копии японских шифровальных устройств, чтобы справиться со старым «Красным кодом», таким же способом, каким британцы моделировали «Энигму»— шифровальную машину нацистов. После долгого анализирования коллега Фридмана, Гарри Лоуренс Кларк, предположил, что японцы используют в своей новой машине пошаговые переключатели вместо прежних дисков. В соответствии с предположением Кларка была сконструирована копия машины Номер 97 (прозванная ее создателями «Мэджик»), с помощью которой можно было раскодировывать послания «Перпла». (Еще не один год после войны японцы отказывались верить, что американцы сами создали это устройство, — они считали, что американцы похитили какую-то из их машин во время одного из своих рейдов в Азии.)
Система кодов JN 25, применявшаяся на японском флоте, была раскрыта слишком поздно, чтобы предотвратить нападение на Перл-Харбор. Подразделение радиосвязи флота на Тихом океане, базировавшееся в ПерлХарборе и возглавлявшееся капитаном 3-го ранга Джозефом Рочефортом, «взломав» JN 25, получило, таким образом, возможность читать все отправляемые японским флотом сообщения и приказы. Полученная благодаря этому информация обеспечила американцам победу в сражении при Мидуэе.
Рейд летчиков генерала Дулиттла на Токио побудил Ямамото разработать новый военный план: он решил атаковать остров Мидуэй, втянув американцев в бой с частью своего флота. Одновременно для отвлечения внимания противника и распыления им своих сил адмирал собирался произвести бомбардировку Алеутских островов. После того как американцы ввяжутся в сражение, Ямамото хотел выпустить остальную часть своего значительно превосходившего американский флота, которую он предполагал укрыть в 200 милях от передовой части кораблей у Мидуэя. Разгромив флот Соединенных Штатов, адмирал надеялся, наконец, остановить американцев. Однако благодаря «Мэджику», план Ямамото стал известен американцам, иони, не поддавшись на отвлекающий маневр, отбили нападение и выиграли одно из самых тяжелых и самых важных сражений на Тихом океане. Отныне японцы уже не могли иметь секретов от своего противника.
Поражение у Мидуэя сильно деморализовало японцев. Ввиду нарастающей мощи американцев Ямамото должен был теперь заботиться о поддержании духа своих людей. Он планировал посетить удаленные тихоокеанские базы, чтобы вдохновить находившихся там моряков и летчиков на новые великие победы. На 18 апреля был намечен вылет из Рабаула в Буин.
Сообщение об этом поступило с американских станций радиоперехвата в Датч-Харборе на Алеутских островах и на Гавайях, подвергавшихся прежде неоднократным бомбардировкам Ямамото. В беспечно переданной радиограмме перечислялись базы на Соломоновых островах и предполагаемое время их посещения. Информацию немедленно передали в Перл-Харбор адмиралу Нимицу и начальнику разведки Эдвину Лейтону. Если бы Ямамото удалось перехватить в полете и убить, Япония лишилась бы своего прославленного героя и военного лидера.
Морской министр Фрэнк Нокс одобрил эту идею. (В «Спаймастере» Ладисласа Фараго Нокс изображен колеблющимся, взвешивающим пользу от смерти Ямамото и аморальность убийства, при том что подготовка германских и японских шпионов предполагала и возможность убийства военных лидеров как эффективной формы военного противодействия. Чтобы защититься от возможного общественного осуждения в будущем, Нокс поручил своим сотрудникам подготовить список исторических политических убийств.)