Самой насущной задачей Черноморского флота в 1789 году было объединение трех его частей: Лиманской флотилии, Севастопольской эскадры и фрегатов из Таганрога в единый кулак. Марко Иванович понимал, что прошлогодний успех у Фидониси – это не более чем счастливая случайность. Хотя соотношение в линейных кораблях на море стало уже не таким разительным, но все-таки еще оставалось неблагоприятным: до 17 турецких против 5 севастопольских. Выстроив боевую линию кораблей по всем правилам, турки в следующий раз свой шанс вряд ли бы упустили (правда, Потемкин по этому поводу занял своеобразную позицию, он изложил ее Войновичу: «Искусством и храбростью можете Вы заменить превосходство оных в числе!»). Лелеемые князем надежды, что капудан-паша разделит свой флот на мелкие эскадры и их можно будет разбить поодиночке, вскоре исчезли. Только соединив все морские силы в крупную флотилию, численно сопоставимую с турецкой, можно было всерьез рассчитывать на благополучный исход баталии. Но соединению наших эскадр и препятствовал неприятельский флот, уже второй год блокировавший выход из Лимана.
…Флот Турецкий так стоит, что нашим, естли бы итить, то должно на самой ближней дистанции всю проходить их линию между их судов и подводной банкой. Но риску столь большого не зделаю, а буду искать иных средств.
В августе русские войска вышли к небольшой крепости Хаджибей (впоследствии Одесса), где после потери Очакова базировался флот турок и через которую в Константинополь шли поставки хлеба. Турецкий флот наконец-то вынужден был покинуть позицию у входа в Лиман и оттянуться на поддержку Хаджибея. Пользуясь моментом, Потемкин в конце месяца приказал Войновичу провести гребную флотилию из Лимана к Хаджибею, на который уже направлялась колонна войск Гудовича. Заодно из Лимана выводились и парусные суда для последующего соединения их с эскадрой в Севастополе.
Войнович, державший флаг на 80-пушечном корабле «Иосиф II», стоявшем в Лимане, 10 сентября отправил в Севастополь ордер Ушакову с приказом выйти в море на соединение с ним.
К середине сентября Войновичу удалось провести из Лимана до Хаджибея гребную флотилию и передать ее под командование де Рибаса. 14 сентября русские войска, несмотря на стоявшие поблизости турецкие корабли, взяли Хаджибейскую крепость.
Учтя направление ветров и расположение турецких эскадр, контр-адмирал Войнович счел момент благоприятным для соединения Черноморского флота и 22 сентября повел Лиманскую парусную эскадру к берегам Крыма.
Контр-адмирал Ушаков вышел из Севастополя днем раньше с 5 кораблями, 8 фрегатами, 1 бомбардирским судном, 2 вооруженными крейсерами и 3 брандерами. Дойдя вдоль крымского берега до оконечности мыса Тарханкут, эскадра взяла курс на Очаков. 22 сентября в час дня увидели берег острова Тендра, а спустя 3 часа на горизонте показались 10 турецких судов. Еще через полтора часа Ушаков насчитал уже 32 вымпела. Ушаков решил отходить и приказал палить из пушек, чтобы наблюдатели на Тендре смогли заметить его и сообщить Войновичу.
23 сентября в семь утра, находясь в 52 милях от Хаджибея, Ушаков увидел 11 турецких судов, следующих за ним. Вскоре у Тарханкута ему удалось оторваться от неприятеля. Несмотря на противный ветер, утром 27 сентября эскадра благополучно вернулась в Севастополь.
На обратном пути от эскадры Ушакова из-за сильного ветра отделилось бомбардирское судно «Полоцк» и пошло ближе к берегу. Вдруг командир «Полоцка» увидел эскадру Войновича, стоявшую на рейде Евпатории: 4 линейных корабля во главе с «Иосифом II» и 13 корсарских судов.
29 сентября эскадра контр-адмирала Войновича прибыла в Севастополь. При входе в гавань из-за сильного ветра корабль «Александр» не смог войти в бухту, пытался стать на якорь, но его сорвало и выбросило на камни. В тот же день корабль сумели снять с камней и провести в порт. По этому случаю Марко Иванович отмечал в рапорте: «Сие приключение послужило нашим капитанам в пример и в науку, доказав им, что морскому человеку не надобно лениться, ничего не пренебрегать, не избегать малых трудов, дабы не навести больших с вредом, а иногда и гибелью».
Вскоре из Таганрога были приведены в Севастопольскую бухту еще два новых корабля. В Севастополе собралась внушительная эскадра из 11 линейных кораблей и 9 фрегатов. Командующий Войнович, разделив флот на авангард контр-адмирала Ушакова, арьергард бригадира Голенкина и кордебаталию под своим флагом, доносил Потемкину: «Теперь Турецкий флот, кажется, имеет с кем поговорить на Черном море».