2 ноября 1992 года президент Ельцин ввел на территории Пригородного района чрезвычайное положение. В тексте его указа содержалась сентенция о «прямой вооруженной атаке на конституционный строй России, ее безопасность и территориальную целостность» со стороны «воинствующих националистов». В район вошли федеральные войска, которые к 6 ноября разделили противоборствующие стороны. Но к этому моменту примерно 38,7 тысячи ингушей, постоянно живших в Пригородном районе, уже подверглись этнической чистке и были вынуждены покинуть его территорию.
В результате столкновений погибло 546 человек — из них 105 осетин и 407 ингушей. Уголовные дела по фактам гибели и похищения мирных граждан были позднее сведены в одно производство и прекращены.
Согласно данным ингушской стороны российская бронетехника и артиллерийские подразделения шли в первом эшелоне (выдвигаясь от Владикавказа к границе с Ингушетией). За российскими войсками следовали отряды «республиканской гвардии» и «народного ополчения» Северной Осетии, которые блокировали села и изгоняли ингушское население. Третьим эшелоном двигались югоосетинские добровольцы из бригады «Ир»
В общей сложности в этой операции участвовало с российско-осетинской стороны около 68 тысяч человек. В числе российских войск находились части и подразделения дивизии им. Дзержинского внутренних войск МВД России (в том числе спецназ), два полка псковской дивизии ВДВ, подразделения гарнизона и курсанты военных училищ Владикавказа. Кроме «республиканской гвардии» и «народного ополчения», осетинская сторона была представлена ОМОНом республиканского МВД Северной Осетии. Помимо этого, в событиях на осетинской стороне участвовали два казачьих полка и югоосетинские добровольцы.
В зоне ликвидации последствий конфликта погибло 66 и ранено почти 130 российских военнослужащих, принимавших участие в разведении воюющих сторон и последующем обеспечении режима безопасности. По разным оценкам, от 30 до 60 тысяч жителей ингушской национальности были вынуждены покинуть территорию Пригородного района и г. Владикавказ и в большинстве своем осели в соседней Ингушетии.
В последующий период в ходе имевших место вооруженных столкновений между осетинами и ингушами, обстрелов и подрывов, в том числе воинских и милицейских постов и нарядов, а также в результате найденных единичных и массовых захоронений периода вооруженного конфликта численность убитых в зоне конфликта увеличилась на несколько сот человек.
В силу того, что конфликт в значительной мере развивался на этнической основе, противостояние происходило также между осетинским и ингушским населением внутри Северной Осетии.
Федеральный центр проводит политику на нахождение компромисса между Осетией и Ингушетией, который затруднен различной интерпретацией сторонами закона «О репрессированных народах», наличием в законодательстве обеих республик норм, ограничивающих возможные компромиссы. После избрания президентом Республики Ингушетия М. Зязикова определилась тенденция к большему взаимопониманию со стороны руководства обеих республик.
20 октября 2006 года российский премьер М. Фрадков подписал постановление, которое установило окончательные сроки урегулирования осетино-ингушского конфликта. Согласно документу вынужденные переселенцы, претендующие на государственную поддержку, должны были до 1 декабря 2006 года представить в Федеральную миграционную службу соответствующее заявление, а прием всех сопутствующих документов ФМС прекратил с 1 июля 2007 года.
Решение ограничить сроки осетино-ингушского урегулирования объяснялись политическими причинами. Переселение стало разменной монетой в спорах между ингушскими властями и федеральным центром: до тех пор, пока оставалась неурегулированной проблема беженцев, ингушское руководство объясняло бедственное положение экономики республики именно этим.
По согласованию с североосетинской стороной под поселки для ингушских беженцев (Новый-1 и Новый-2) на территории Северной Осетии в 200 м от границы с Ингушетией были выделены плодородные земли, однако сами беженцы настаивали на возвращении в закрытые населенные пункты.
Постановление Фрадкова было инициировано полпредом Д. Козаком, который занимался урегулированием последствий осетино-ингушского конфликта с 2004 года, когда Владимир Путин расформировал спецпредставительство по вопросам урегулирования, передав его функции полпредству в Южном округе, а вопросы обустройства беженцев — Федеральной миграционной службе. Совместно с ФМС полпредство в начале 2005 года подготовило «Первоочередные совместные действия по урегулированию осетино-ингушского конфликта октября — ноября 1992 года». В этом документе подробно расписывалось, кто, куда и как должен вернуться, а также ответственные за процесс ведомства.