Как следует из «Катехизиса», офицеры и рядовые с самого начала существования отрядов коммандос проживали не в казармах, а на съемных квартирах в прибрежных городках Южной Англии, рядом с местом службы. Ценность этого нововведения для каждого солдата было трудно переоценить: отсутствие кухонных нарядов, поверок и других неудобств в сочетании с весьма неплохим жалованьем (солдаты обычных частей денег за ненадобностью не получали) сделало службу в спецчастях очень престижной. При этом каждый военнослужащий был обязан содержать свое оружие и снаряжение в образцовом порядке, чтобы выступить по тревоге в любой момент. После того как стал очевидным крах германского «воздушного наступления» на Британию, англичане начали подготовку коммандос к выполнению их главных задач — диверсионных рейдов. Значительное число бойцов бригады особого назначения были направлены в школу диверсионной войны, открывшуюся в мае 1940 года в Шотландии. Последняя была расположена в безлюдной горной местности: это позволяло обеспечить секретность и вместе с тем обучать коммандос в условиях сложного рельефа и суровых погодных условий. Курсанты школы проходили горную подготовку, обучались плаванию в обмундировании и с оружием, рукопашному бою, владению огнестрельным и холодным оружием, ведению разведки, ориентированию на местности в ночных условиях, чтению карты, выживанию и другим дисциплинам. В программу входило и знакомство с управлением десантными кораблями и баржами. Вместе с коммандос обучение проходили десантники из САС, в том числе знаменитый Дэвид Стерлинг (Sterling) и Фредерик Спенсер Чепмен (Chapman) — командир диверсионного отряда, действовавшего в тылу японцев в Малайе.
Несмотря на столь обширные масштабы подготовки к предстоящим боям, заметно напоминал о себе скрытый саботаж армейского командования. Кроме того, было совершенно неясно, каким образом следует использовать отряды специального назначения. Начальник Управления объединенных операций адмирал Киз не верил в способность своих подопечных самостоятельно решать серьезные задачи, считая крупные рейды не более чем «большим шоу». Обстановка в Управлении оставалась весьма нездоровой: этому способствовал авторитарный стиль руководства Киза. К сожалению, многие планировавшиеся операции коммандос остались на бумаге, поскольку ни один из командиров армии, ВВС и ВМФ не хотел добровольно сотрудничать с адмиралом.
Пока в штабах решали дальнейшую судьбу отрядов коммандос, последние периодически проводили различные мелкомасштабные рейды, нанося немцам «комариные укусы» вполне во вкусе английских представлений о «малой войне». Впоследствии такие операции, как правило, стали поручать подразделениям SOE, а не Управлению объединенных операций (например, Отряду катеров особого назначения).
В 1941 году в связи с тяжелым положением, сложившимся на Североафриканском театре, часть подразделений бригады особого назначения была направлена в Египет. В это же время создано специальное соединение «Layforce» (3000 человек), дислоцированное с ноября 1940 года в Северной Африке. Бригада особого назначения оказалась ослабленной, но это не помешало ее бойцам провести ряд небольших операций, оказавшихся несколько более удачными, чем это происходило в прошлом году.
Так, в июле 1941 года 17 солдат 12-го отряда коммандос был высажен на французском побережье к юго-западу от Кале, у городка Амблетез, с задачей провести разведку. Рейд прошел без контакта с противником, но на обратном пути на борту десантного корабля начался сильный пожар и многие члены группы получили ожоги. В августе того же года 30 коммандос из 5-го отряда пересекли Па-де-Кале еще южнее, также не добившись результатов. В сентябре на берег Нормандии высадилась разведгруппа 1-го отряда. В засаду, устроенную диверсантами, попал немецкий патруль на мотоцикле: добычей англичан стал труп одного из патрульных с комплектом документов. Наконец, в ноябре взвод 9-го отряда предпринял неудачную попытку взять штурмом береговую батарею 150-мм орудий в устье Сены.
В марте 1941 года состоялся и первый крупномасштабный рейд на четыре порта Лофотенских островов — проба сил перед последующими акциями. Архипелаг находился в Заполярье, у северо-западного побережья Норвегии, почти в 900 милях от шотландских берегов. Целью рейда стали заводы по производству рыбьего жира, который поставлялся в Германию как важнейшее составляющее глицерина — стратегического сырья для производства взрывчатых веществ.