В районе Прахова, в маленьком рыбачьем поселке, стали выгружать раненых. 1600 раненых пришлось разместить прямо под открытым небом на кукурузных полях. Затем с помощью двух сохранившихся плавучих мастерских начали устранять повреждения, полученные кораблями. Одновременно с этим вышедшие на берег солдаты стали устанавливать выгруженные легкие пушки на позициях на ближайших высотах и вдоль дороги на Неготин. Район Прахова и его гавань были подготовлены к обороне. На БДБ возложили задачу охранения водного района. В это время с левого берега Дуная румынская артиллерия вела артиллерийский огонь по немцам, пытаясь помешать их действиям.
Вечером контр-адмирал Циб вылетел на самолете «Шторьх» в Белград к генерал-фельдмаршалу Вайхсу. Тот ему сообщил, что район Железных Ворот уже занят русскими и для того, чтобы двигаться дальше, необходимо сначала взять Железные Ворота. В этих целях к району Железных Ворот с севера идет группа войск под командованием генерала Батцинга. С юга атака будет производиться частями майора Рее. Одновременно по Дунаю в район Железных Ворот будет прорываться 7-я десантная флотилия. Эта атака состоялась 5 сентября 1944 г. 7-я флотилия, усиленная паромами Зибеля, под командованием капитана 3 ранга Шелтерса предприняла попытку атаковать румынские позиции. При этой попытке было потеряно много саперных катеров. Атаки обеих сухопутных боевых групп окончились безрезультатно. После этого усиленный батальон Рее и его многочисленные танки пришли на усиление обороны Прахова. Тем временем контр-адмирал Циб прилетел из Белграда. С этого момента оборона Прахова перешла к майору Рее. Началась эвакуация раненых, женщин и детей через Неготин.
Вскоре после начала атак в районе Железных Ворот в Прахово прибыл начальник инспекции минно-тральной службы на Дунае капитан 1 ранга Лаутеншлегер. После того как выяснилось, что пройти Железные Ворота невозможно, он приказал потопить все корабли. При выполнении этого приказа пришел противоположный по своему характеру новый приказ, согласно которому следовало прекратить не только затопление судов, но и отправку 1200 гражданских лиц, в том числе женщин и детей. Этот последний приказ оказался чистейшей глупостью. Контр-адмирал Циб послал на самолете свою секретаршу в Белград, где она должна была добиться отмены этого приказа. Тем временем очередная партия эвакуированных была отправлена на поезде, а следующая была задержана. Вышедший поезд впоследствии подорвался на мине, подложенной партизанами, и сошел с рельсов, в результате чего было убито 30 человек. Оставшихся в живых переправили в ближайший город, который в ту же ночь был взят партизанами. Майор Рее в своем докладе в Белград, переданном через секретаршу Циба, предлагал эвакуировать Прахово. Не получив в ближайшие два дня ответа, контр-адмирал Циб 7 сентября снова вылетел в Белград, где ему стало известно, что полк «Бранденбург» в ближайшие дни прибудет в Прахово и обеспечит затопление кораблей и отправку людей. Действительно, через несколько дней этот полк появился, но расквартировался в Неготине. Тем временем русские и румынские войска перешли Дунай и стали сосредоточиваться на южном берегу. Затопление всех кораблей оказалось уже невозможным. Русские захватили 12 груженых судов. Полк «Бранденбург» и остатки группы Циба в течение пяти недель в условиях постоянных атак партизан и авиации пешком добирались до Белграда.
На этом и закончилась операция, в результате которой погибло свыше 200 немецких судов. Тем не менее удалось спасти от русского плена большое количество экипажей и беженцев.
Как во время Гражданской войны в США 1861–1865 годов, вели бои тихоходные, почти не бронированные суда на малой дальности против сильных береговых укреплений, часто в окружении противника, постоянно продвигаясь по сложному фарватеру.
Отход почти 200 судов соединения выявил многочисленные необычные проблемы командного, психологического и тактического характера, большинство из которых удалось решить, несмотря на неблагоприятные условия.
Контр-адмирал (инженер) П.В. Циб искусно управлял действиями громоздкого соединения. Наряду с этим ему пришлось импровизировать и организовывать снабжение быстро разраставшейся группы продовольствием и горючим.
Поскольку немецкие корабли, находившиеся на Черном море, не вошли своевременно в Дунай, как это было предусмотрено ранее, их боевой мощи и командования не оказалось в распоряжении, что значительно повлияло на малоподвижность «группы Циба».