В третью волну вошли две группы бомбардировщиков из 57-го БАП (восемь СБ и шесть ДБ-3), а также семерка Ар-2 капитана Сыромятникова, которая за день выполняла уже второй вылет. Они атаковали немецкие войска ближе к вечеру и имели меньше встреч с вражескими истребителями. Ведущий группы ДБ-3 капитан Ефремов, учтя опыт своих товарищей, сделал круг и зашел на цель с тыла, потеряв в результате лишь один самолет. Группа Сыромятникова, увеличившая высоту бомбометания, вновь обошлась без потерь, и лишь группа СБ из 57-го БАП была основательно потрепана. Из ее восьми бомбардировщиков два пропали без вести, еще три совершили вынужденную посадку на своей территории из-за полученных повреждений, два заблудились и сели на другом аэродроме, и лишь один вернулся назад.
В итоге в течение дня авиация Балтийского флота потеряла 31 бомбардировщик, в том числе 1-й МТАП — 11 самолетов, 57-й БАП — 9 и 73-й БАП — 11. Из вернувшихся машин большинство имели повреждения и требовали ремонта. Таким образом, Манштейн вдвое завысил советские потери над Западной Двиной. Однако и пилотам люфтваффе победы над бомбардировщиками дались достаточно нелегко. Даже по западным данным II и III группы JG 54 30 июня лишились девяти «мессершмиттов».
Самолеты 53-го и 200-го полков ДБА также с раннего утра сделали несколько вылетов на бомбардировку мостов и переправ. К цели они подходили скрытно, на большой высоте, и поэтому понесли незначительные потери. В этих налетах эффективно использовались специальные ротативно-рассеивающие бомбы (РРАБы), которые подвешивались на двух внешних подвесках под крылом ДБ-3. Они представляли собой толстые каплеобразные бочки, заполненные мелкими бомбочками осколочного и фугасного действия. На боковых ободах этой бомбы оружейники перед вылетом делали надрезы, а в задней ее части монтировался стабилизатор в виде гребного винта. В момент падения бомба начинала вращаться, мелкие бомбочки под действием центробежной силы начинали давить на оболочку, в конце концов ее разрывали и разлетались, накрывая большую площадь.
Хотя экипажи советских бомбардировщиков докладывали 30 июня об уничтоженной технике и живой силе врага, существенного влияния воздушные налеты на немецкие планы не оказали. Сосредоточив у плацдармов свои войска и перебросив туда дополнительные подкрепления, гитлеровское командование продолжило наступление 2 июля в 5 часов утра. Прорвав фронт ослабленных частей 27-й армии и двигаясь в общем направлении на Остров, 4-я танковая группа вермахта к концу дня почти достигла Резекне. 3 июля немцы наступали уже по всему фронту. На борьбу с ними были брошены почти все наличные силы ВВС Северо-Западного фронта, а также авиационные соединения Северного фронта, в частности с начала месяца удары по немецким войскам наносили два полка бомбардировщиков СБ из 2-й САД, а с 4 июля к боевым действиям были привлечены также 41-я смешанная авиадивизия под командованием полковника И.Я. Новикова и 39-я истребительная дивизия Е.Я. Холзакова. К этому времени погода стала еще хуже, и в условиях низкой сплошной облачности и частых дождей советским бомбардировщикам пришлось летать на задания преимущественно в одиночку и парами. Бомбы на немецкие механизированные колонны сбрасывались с небольшой высоты, и в результате самолеты попадали под сильный огонь зенитной артиллерии. Многие экипажи возвращались на свой аэродром пешком. С 4 января за шесть суток 2-я и 41-я САД потеряли около 60 бомбардировщиков, однако до 10 июля они выполнили почти 1200 самолето-вылетов и сбросили на врага более 500 т бомб.
Чтобы воспрепятствовать беспокоящим налетам, командование 1-м воздушным флотом люфтваффе предприняло ряд атак советских аэродромов, расположенных в районе Пскова, Луги и Старой Руссы.
Между тем немецкие войска 4 июля с ходу форсировали реку Великая по невзорванным мостам, а 6 июля захватили город Остров. 9 июля фашисты ворвались в Псков и теперь уже угрожали непосредственно Ленинграду. Для защиты своего города сотни тысяч ленинградцев, в основном женщин, вышли на строительство оборонительных рубежей. Главный рубеж сооружался по реке Луге и далее до озера Ильмень. Второй рубеж создавался по линии Петергоф — Красногвардейск — Колпино, а третий планировался по линии Автово — окружная железная дорога.
Широким кольцом Ленинград опоясали зенитные батареи, которые располагались не только на подступах к городу, но и внутри него: на площади Декабристов, на Марсовом поле, у Смольного и в других районах. Со стороны Финского залива Ленинград прикрывали баржи с установленными на них зенитными орудиями. Всего в Северную зону противовоздушной обороны (Ленинградский, Лужский, Выборгский и Свирский районы) входили 1035 зенитных пушек разного калибра, 300 зенитных пулеметов, 151 зенитный прожектор-искатель и 264 сопроводителя, 341 аэростат заграждения и 8 радиолокационных станций РУС-1. Полосу предупреждения о вражеских налетах образовали на удалении 120–140 км от Ленинграда развернутые посты ВНОС.