Не был благостным и 1940-й год. Опубликованные данные о репрессиях этого года имеются только по Архангельской, Мурманской и Камчатской областям, Приморскому и Красноярскому краям (не более половины сведений), Якутской АССР и отчасти – по Москве, но вряд ли в Ленинграде и Салехарде чекисты были менее «бдительны». 5 января ОСО НКВД за шпионаж (!) приговаривает к пяти годам лагерей заведующего транспортом Оймяконской торговой конторы ГУСМП в Якутии В.С.ГОТОВЦЕВА. В январе-феврале было расстреляно по приговору ВКВС трое ответственных работников НКВТ: 21 января – начальник Центральных управлений морского пассажирского и сухогрузного флота и морскими портами В.М.ЛАЗЕБНЫЙ, обвинение – террористические намерения и участие в контрреволюционной заговорщицской организации, 25 января – заместитель начальника Центрального управления морского флота Т.С.ХОЗЯИНОВ (КРО) и 2 февраля – заместитель наркома Е.Г.ЕВДОКИМОВ (терроризм, контрреволюционная заговорщицская организация). 21 февраля 1940 года ОСО НКВД приговаривает к пяти годам высылки в Якутию ответственного исполнителя отдела снабжения Дальневосточного управления ГУСМП М.И.ОЗЕРАНА (он обвинялся в измене родине и провёл в заключении полтора года), к пяти годам запрещения проживания в режимных местностях – радиста Дальневосточного пароходства Г.Г.СТАХЕЕВА («изменник родине», пробыл в заключении более полутора лет) и к трём годам заключения радиста парохода «Дальстрой» одноименного треста НКВД В.А.ЛИСИЦЫНА («шпионаж», в заключении почти два с половиной года). В Мурманске 26 февраля областной суд приговаривает за АСА старшего помощника капитана гидрографического судна «Масштаб» А.И.ПАТЬКОВА к трём годам заключения, а старшего механика Н.Х.ЛОБОДУ – к семи годам. 16-го марта Корякский окружной суд выносит приговор – семь лет ИТЛ по ст. 58–10 (АСА) – мастеру Корфского рыбокомбината С.В.ЛОМАКИНУ, от его ареста до осуждения проходит всего восемь дней. В этот же день в Москве Военная Коллегия ВС СССР приговаривает к расстрелу начальника финансового отдела Акционерного Камчатского общества В.А.СЕЛИВАНКИНА; участника «вредительской контрреволюционной организации», арестованного ещё в августе 1937-го года, его привезли для следствия в Москву, здесь он и был расстрелян. 26 марта Таймырский окружной суд приговорил за АСА к двум годам лагерей старшего бухгалтера Хатангской конторы ГУСМП П.Г.КОЛЧИНА. Однако 31 марта Приморский краевой суд освобождает обвинённого в антисоветской пропаганде 2-го механика парохода «Волга» Дальневосточного пароходства З.К.ЗАХАРОВА. 1-го апреля Верховный Суд ЯАССР выносит приговор за «дежурную» АСА заведующему торговой системой территориального управления ГУСМП А.Н.ИВАНОВУ, с учётом заключения под следствием он освобождается через полтора месяца. А 11-го апреля прекращено дело против члена контрреволюционной вредительской организации исполняющего должность начальника Владивостокской конторы Акционерного Камчатского общества С.В.ВОРНИКА. Зато 25 апреля Верховный Суд ЯАССР вспоминает свои прошлые «подвиги» и приговаривает к высшей мере наказания начальника Якутского территориального управления ГУСМП Г.И.ИВАНОВА. Ему при аресте в июле 1938 года был предъявлен «букет» обвинений: измена родине, участие в организации, которую даже трудно произнести – повстанческо-вредительско-террористическо-диверсионная контрреволюционная. ВКВС, поменявшая с 1938-го года ориентацию, приговор отменила, направив дело на новое рассмотрение, и страж справедливости – внесудебное ОСО НКВД – в сентябре 1941 года заменяет расстрел восьмью годами лагерей.
1 апреля 1940 года были арестованы когда-то работавшие инструкторами Политического управления ГУСМП М.И.ЕРЁМИН и А.А.ЖИЛКОВ, судя по всему – сотрудники НКВД. Первый обвинён в том, что участвовал в «заговоре Бергавинова» и не разоблачил деятельность «заговорщиков» на Мурманском заводе Севморпути, а второй – в том, что, работая после ГУСМП в Алтайском УНКВД, «лепил» десятками расстрельные дела. Судьба обоих неизвестна, но им явно грозили от коллег приговоры к ВМН.