Республика в Египте была провозглашена 19 июня 1953 года. Спешно преобразованная в Директорат генеральных расследований (Эль Мубахат Эль-Аммах), Государственная служба безопасности объединяет и направляет борьбу против оппозиции под руководством Рафата эль-Нахаса, а затем генерала Абд эль-Азима Фахми. После провозглашения республики она зависит от министерства внутренних дел, другими словами, от Насера.
Несмотря на официальные заявления, «сионистский враг» не является самым страшным врагом режима Насера. Главным врагом остается внутренняя оппозиция. Все это потому, что «Братья-мусульмане» продолжают угрожать. 26 октября 1954 года они попытаются разделаться с Насером. Но их ожидает неудача и в качестве ответа будущий президент устроит грандиозную облаву. Шесть исламских руководителей, приговоренных к смерти, будут повешены. Этим событиям уже сорок лет. Так что можно сказать, что борьба между «Братьями-мусульманами» и египетским режимом, которая сегодня достигла наивысшей точки, началась не вчера…
Эта расправа расколола на некоторое время исламское движение. Воспользовались случаем, чтобы отстранить от должности Негиба, обвиненного в пособничестве и подвергшегося шантажу: Махмуд Халил и Шериф Фарид Шакер, бывшие служащие разведслужбы военно-воздушных сил при короле Фаруке, представили, кстати, объемистое досье о его безнравственном поведении. Под руководством Али Сабри разведслужба воздушной армии становится главной пружиной в механизме разведки «Свободных офицеров».
Отныне пространство для Насера расчищено. Вскоре он получает прозвище Раис (Глава). Его приход к власти знаменует глубокую реформу структуры египетских разведслужб.
Первыми ее шагами является образование в конце 1955 года Директората генеральной гражданской разведки, руководство которым выпадает на долю Закарии Мохеддина, ставшего министром внутренних дел и считающегося человеком, который пользуется особым доверием Насера. Ему помогает Али Сабри, бывший шефом Службы военно-воздушной разведки и смененный на этом посту Махмудом Халилом, и Камель эль-Дин Рифаат.
Генеральная разведка — это своего рода сердце нового режима: новоявленная супецслужба курирует одновременно Директорат военной разведки в армии и директорат Генеральных расследований в министерстве внутренних дел. Это — здание, в котором приоритет отдан гражданским спецслужбам (руководимым, впрочем, военными чинами) над собственно военными спецслужбами.
Главенство при Насере гражданского над военным в сфере разведки полностью укладывается в традиции египтян. Эта традиция будет упрочняться. Совсем напротив дело обстоит у сирийских коллег, там военные первенствуют над гражданскими.
Итак, механизм налажен и можно наращивать деятельность за границей. Насер рассматривает спецслужбы одновременно как опору режима внутри страны и как одно из самых надежных средств в проведении своей внешней политики. К тому же, кроме Закарии Мохеддина, Али Сабри или Анвара Садата, некоторым другим специалистам в секретных делах режима пообещает более высокие посты.
Принципиально главной целью является еврейское государство. Будут стараться поразить его всеми возможными способами.
В секторе Газа, уже заселенном палестинскими беженцами, но еще не находящемся под контролем израильтян, египтяне подполковника Мустафы Хафеза (убит в 1956 году агентами Моссада) контролируют группы «смертников» — федаинов. Му-хабарату недостаточно их вооруженных акций. С помощью египетских военных атташе, по совместительству территориальных агентов, Генеральная разведка с переменным успехом пытается внедрить агентов в Израиль.
В Париже подполковник Сарует Укаша и его заместитель, майор Иса Юссуф Сараг эль-Дин, вербуют в 1955 году бывшего лейтенанта Цахаля, израильской армии, Александра Юлина. В августе 1956 года, после длительной подготовки, Юлин отправится в еврейское государство. Он будет раскрыт израильской контрразведкой, арестован и осужден.
Египетский военный атташе в Риме, Мохаммед Шукри, вербует в 1956 году в Афинах Алсибиадиса Коскаса. Этот грек, после предоставления в несколько приемов интересной документальной информации о Цахале, будет арестован в августе 1957 года израильской контрразведкой.
В Аммане и в Бейруте агенты Мухабарата вербуют главу коптской церкви в Яффе, отца Иоахима эль-Антони, который будет арестован в октябре 1956 года.
Кроме того, происки секретных служб направлены против арабских режимов, оппозиционных Насеру.
Король Ирака Фейсал II оказывается ценным союзником Запада, в частности англичан. Военный атташе, подполковник Камаль эль-Дин эль-Хинави, и его заместитель Мохаммед Али Исса поддерживают подпольную оппозиционную группу, Национальный комитет союза офицеров и солдат, который планирует, помимо прочего, убийство пробританского премьер-министра Нури Саида.