На совещании представителей служилого дворянства в Москве весной 1471 г. был разработан план похода на Новгород. В походе приняли участие войска целого ряда княжеств. Казимир IV не оказал новгородскому боярству помощи. Согласно данным польского летописца Длугоша, Казимир IV боялся своих собственных подданных из числа русского населения в Литве, которые рассчитывали на помощь Москвы в борьбе с литовским панством. Михаил Олелькович также уехал из Новгорода. Бояре наскоро собрали ополчение, в котором оказалось большое количество ремесленников, не владевших оружием и не желавших сражаться с московским войском, защищая боярские интересы. В битве на реке Шелони новгородское войско потерпело полное поражение.
По договору, заключённому в местечке Коростыни, новгородские бояре обязались быть «неотступными» от Московского княжества и не переходить под власть Литвы. В последующие годы московские правители стремились ещё более подорвать значение новгородских бояр и тем самым подготовить включение Новгорода в состав централизованного государства. Для этого Иван III попытался использовать в желательном для него направлении вражду новгородских «чёрных людей» к местному боярству. В 1475 г. Иван III совершил поездку в Новгород. Во время пребывания там он принимал жалобы крестьян и ремесленников на бояр. После разбора этих жалоб он осудил видных представителей новгородского боярства, связанного с Литвой, и отправил их в ссылку в Москву и в другие города. Этим московский князь подрезал корни новгородской боярской оппозиции и приобрёл на время поддержку «чёрных людей», наивно полагавших, что в лице великокняжеской власти они получат защиту от притеснения бояр.
В 1477 г. был организован новый поход московских войск на Новгород. Новгородское правительство было вынуждено просить Ивана III о мире. Последний согласился на мир лишь под условием введения в Новгородской земле порядков, существовавших во всех областях, уже вошедших в состав централизованного государства. В начале 1478 г. это условие было официально принято новгородскими властями. Вечевой колокол — символ независимости Новгорода — был снят и отправлен в Москву. Значительная часть земель Новгорода (в том числе и новгородские земли на Северной Двине) перешла под власть Москвы.
Карелия
Вместе с Новгородом в состав единого Русского государства вошла Карелия. Основным занятием карельского населения было земледелие, причём наряду с подсекой там получило распространение и трёхполье. Большое значение в хозяйстве карел имели рыбные промыслы и охота. Из ремёсел были развиты кузнечное дело, судостроение и ткачество. На Беломорском побережье производилась выварка соли. Значительную часть карельских земель захватили крупные новгородские феодалы. Местных карельских землевладельцев было немного. Часть крестьян, не попавших в частновладельческую зависимость, эксплуатировалась непосредственно Новгородским государством. В связи с ростом общественного разделения труда в Карелии развивались города, из которых наиболее крупными были Корела и Орехов.
Исторические судьбы карельского народа были тесно связаны с судьбами русского народа. Карельские крестьяне и ремесленники жили и трудились вместе с русскими, воспринимали у них технические навыки. Происходило и культурное взаимодействие карел с русским народом. Общими мотивами были проникнуты русские былины и карело-финский эпос («Калевала»).
Присоединение земель Прикамья и Северного Приуралья
В 1472 г. была присоединена к Москве «Великая Пермь» (область, населённая коми, в верховьях Вычегды и Камы) и тем самым открыт путь в Зауралье, в Югорскую землю, где жили вогулы (манси) и остяки (ханты). В 1483 г. была отправлена экспедиция во главе с Фёдором Курбским, побывавшая на Тоболе, Иртыше, Оби и приведшая к установлению зависимости от Москвы ряда югорских князьков. В 1489 г. московские войска взяли главный город Вятской земли — Хлынов (Вятку). Эти мероприятия отвечали интересам господствующего класса, нуждавшегося в новых территориях и доходах. В то же время за Урал шло колонизационное движение русских «чёрных людей» и беглых частновладельческих крестьян, там распространялись земледелие, промыслы, торговля и местные народы приобщались к более высокой экономике и культуре Руси.
Ликвидация самостоятельности Тверского княжества