5 января 1942 года был также высажен вспомогательный десант в Евпатории (700 чел.). В случае его успеха советские войска получали важный плацдарм, откуда могли нанести удар по Перекопскому перешейку и перерезать коммуникации в Крыму 11-й армии. Решительной атакой десантники с помощью партизан и восставшего населения города овладели большей частью Евпатории. Оценив стратегическое значение данной операции, Манштейн спешно направил против них один пехотный полк и два батальона. 8 января после жестоких уличных боев десант был разгромлен. Защитники Евпатории (десантники, партизаны, восставшие жители города) потеряли, по немецким данным, около 1200 чел. убитыми. Остатки десанта сумели вырваться из окружения и уйти в горы к партизанам.
В январе — марте 1942 года защитники Севастополя провели ряд наступательных операций и частично вернули ранее утраченные позиции. Одновременно на Керченском полуострове накапливалась крупная советская группировка (44-я, 47-я и 51-я армии), входящая в состав Крымского фронта под командованием генерала Д. Т. Козлова. Однако ее попытки в феврале — апреле прорваться к Севастополю не принесли желаемого успеха. К маю численность керченской группировки достигла 300 тыс. человек. В ее распоряжении находилось 1526 орудий и 629 танков. Имея двукратное превосходство в людях, Козлов готовился к широкому наступлению с целью освобождения Крыма. Но Манштейн опередил действия Крымского фронта, проведя одну из самых красивых немецких операций в период Великой Отечественной войны.
8 мая Манштейн нанес неожиданный удар вдоль берега Черного моря. Создав численный перевес на этом локальном участке, немцы в течение дня прорвали советскую оборону. У нее в тылу высадился десант, еще больше дезорганизовавший управление. Несмотря на господство на море Черноморского флота, он не оказал серьезной поддержки береговым частям, что позволило войскам Манштейна беспрепятственно продвигаться вдоль побережья. Пассивность флота объяснялась страхом потерь от ударов «с ясного неба» германской авиации, сумевшей создать на данном участке подавляющее превосходство. Существенную роль в успехе германского прорыва сыграло отсутствие у советских войск серьезной линии обороны. Войска располагались в голой степи, не имея специально оборудованных оборонительных рубежей (сплошных траншей, дзотов и т. п.).
После того как Крымский фронт потерял устойчивость, в прорыв вошли германские танки. Пройдя вдоль моря, немецкие ударные части повернули на север и вышли в район дислокации советских резервов. Те, не успев развернуться в боевые порядки, были разбиты. В результате основная советская группировка на севере Керченского полуострова (47-я и 51-я армии) оказалась отрезанной и прижатой к побережью озера Сиваш. Войска Крымского фронта потеряли управление и начали беспорядочный отход на восток. 15 мая немцы взяли Керчь. Советские войска (до 120 тыс. чел.) эвакуировались на Северный Кавказ. Свыше 170 тыс. бойцов попали в плен или погибли. До 18 тыс. чел. укрылись в Аджимушкайских каменоломнях, где героически оборонялись до конца октября 1942 года. Керченский разгром похоронил советский план освобождения Крыма и фактически решил участь Севастополя.
Блестящий успех под Керчью, открывший немцам путь к новым победам в 1942 году, был во многом предопределен слабой компетентностью командования Крымского фронта, которое позволило Манштейну без особого труда реализовать свой красивый, но весьма рискованный план.
Теперь Манштейн смог сосредоточить все силы 11-й армии (свыше 200 тыс. чел.) против Севастополя. Его к тому времени защищало 106 тыс. чел., имевших в своем распоряжении 600 орудий, 38 танков и 53 исправных самолета. По танкам немцы имели 12-кратное превосходство, по авиации — 6-кратное. 2 июня 1942 года немцы начали обстрел города. По мнению немецкого командующего, это было самое массированное применение германской артиллерии в годы Второй мировой войны. Под Севастополь была даже привезена знаменитая немецкая пушка «Дора» (калибр 800 мм), специально сконструированная для разрушения мощных оборонительных сооружений. Для доставки на позиции этого исполинского орудия-монстра потребовалось 60 железнодорожных составов.