В 1945 году пятидесятникам было предложено зарегистрироваться в составе Всесоюзного Совета Евангельских христиан-баптистов (ВСЕХБ), своего религиозного центра им не разрешили создать. Условием регистрации был отказ от проповеднической, миссионерской и благотворительной деятельности, а также от «говорения на иных языках». Поэтому большая часть общин пятидесятников отказалась от регистрации и продолжила деятельность в подполье.
Конец 1950-х и начало 1960-х годов ознаменованы систематическими преследованиями пятидесятников в СССР, о чём подробно пишет А.И Солженицын в своей книге «Архипелаг ГУЛАГ». В это время многие руководители общин и рядовые члены церквей были осуждены на длительные сроки заключения. В средствах массовой информации предпринимается попытка всячески очернить деятельность пятидесятников, им приписывались самые чудовищные злодеяния. Начиная с 1968 года некоторые общины пятидесятников получают разрешение на государственную регистрацию, но большинство церквей пятидесятников находилось в положении незарегистрированных до начала 1990-х годов.
В СССР деятельность незарегистрированных религиозных общин была запрещена и преследовалась как уголовное преступление. Рядовые члены незарегистрированных общин постоянно подвергаются преследованиям, чаще всего штрафам, за участие в молитвенных собраниях. Частные дома, в которых собирались пятидесятники для общей молитвы, в ряде случаев конфисковывались или даже разрушались.
На судебных процессах против руководителей незарегистрированных общин пятидесятников им предъявлялись различные уголовные обвинения, в том числе по статьям 190 или 70 Уголовного кодекса, то есть о клевете на советский строй и об антисоветской пропаганде. Руководителей пятидесятников обвиняли и в нанесении вреда здоровью верующих изуверскими обрядами.
Советская пропаганда использовала для дискредитации пятидесятников два основных приёма. Их обвиняли в крайнем фанатизме, доходящем до человеческих жертвоприношений. Распространялась и версия, что пятидесятники лишь прикрывают религиозностью корыстные побуждения и «служат мировому империализму» за доллары.
После вступления в силу Закона РСФСР от 25 октября 1990 года «О свободе вероисповеданий» незарегистрированные общины пятидесятников стали легализировать свою деятельность. Указ Президента Российской Федерации «О мерах по реабилитации священнослужителей и верующих, ставших жертвами необоснованных репрессий» от 14 марта 1996 года №378 осудил «многолетний террор, развязанный большевистским партийно-советским режимом в отношении священнослужителей и верующих всех конфессий». Все ранее осуждённые пятидесятники были реабилитированы.
Антикультисткие мифы, которые используются в последние годы против пятидесятников, по сути дела воспроизводят стереотипы советской антирелигиозной пропаганды и способствуют расколу общества по религиозному признаку.
Усиление влияния протестантизма, в том числе и пятидесятничества, в современной России — объективно закономерный процесс. Российские протестанты — неотъемлемая часть формирующегося среднего класса. Именно они наиболее активно и эффективно проводят социальную работу: занимаются возвращением наркоманов и пьяниц к нормальной жизни, помогают попавшим в трудную жизненную ситуацию детям, в том числе усыновляют сирот. Протестанты соблюдают законы, платят налоги, занимаясь предпринимательством, следуют христианским нравственным принципам. Добросовестно работают, не пьют и не курят.
Знаковое событие — избрание 18 марта 2012 года протестанта мэром города Тольятти. Большинство избирателей (во втором туре — около 57%) отдали свои голоса за Сергея Игоревича Андреева, который не скрывал своей принадлежности к протестантизму, вопреки развязанной его оппонентами «антисектантской» кампании[16]
.Давно назрели решительные меры по нормализации взаимоотношений государства с протестантами, включая налаживание регулярных встреч руководителей страны с Консультативным советом глав протестантских церквей России.
Свидетели Иеговы и их религиозная литература остаются одним из приоритетных объектов «противодействия экстремизму»
Свидетели Иеговы — одно из поздних течений протестантизма, появившееся в США в 1870 году. Впервые появляются в России в конце XIX века, в 1913 году получают официальное признание в Финляндии, входившей в тот период в состав Российской империи.
В СССР Свидетели Иеговы подвергаются жестоким репрессиям, руководители общин и активные проповедники приговариваются к длительным срокам заключения. Рядовых верующих и членов их семей ссылают в Сибирь.
Так, в 1949 году всех выявленных властями в Молдавии Свидетелей Иеговы, отказавшихся отречься от своих убеждений, высылают в Сибирь и на Дальний Восток. В 1951 году все известные органам власти Свидетели Иеговы из Западной Украины, Белоруссии, Латвии, Литвы и Эстонии, сохранившие верность своим убеждениям (более 8,5 тысяч человек) сосланы в Сибирь.