К концу апреля 1945 г. немецкие войска окончательно были выведены из Югославии. Аналогично им поступило и командование Хорватских вооруженных сил, которые, чтобы не попасть в плен к НОАЮ, отступили в Австрию, где между 15 и 17 мая 1945 г. сдались в плен англичанам. Ниже представлен их последний боевой порядок, состоящий, как и прежде из пяти корпусов. Следует отметить, что хотя корпуса со 2-го по 5-й и назывались усташскими, не все их бойцы были усташами:
Дивизия охраны поглавника
1-я Ударная дивизия
2-я пехотная дивизия
5-я пехотная дивизия
16-я усташская учебная и запасная дивизия
12-я пехотная дивизия
14-я пехотная дивизия
18-я пехотная дивизия
3-я пехотная дивизия
7-я пехотная дивизия
9-я пехотная дивизия
4-я пехотная дивизия
6-я пехотная дивизия
15-я пехотная дивизия
10-я пехотная дивизия
11-я пехотная дивизия
13-я пехотная дивизия
Трудно судить об окончательной численности хорватских вооруженных сил на момент капитуляции, так как вместе с армией отступало и гражданское население. В целом, по подсчетам хорватских историков, в мае 1945 г. австрийскую границу перешли 200 тыс. солдат и столько же гражданских лиц[47]
.Наименее развитыми по сравнению с сухопутными силами и Усташской войницей были военно-морские и военно-воздушные силы НГХ.
Сразу же после принятия в НГХ закона об армии и флоте, итальянское правительство, войска которого оккупировали Адриатическое побережье Хорватии, запретило последней использовать в своих ВМС суда водоизмещением более 50 тонн. Поэтому хорватские ВМС
Главным руководящим органом, который осуществлял командование ВМС и подчинялся Министерству Хорватского Домобрана, было Главное командование ВМС
В отличие от сухопутных сил, хорватские ВМС не подвергались никаким реорганизациям вплоть до сентября 1943 г. Капитуляция Италии аннулировала запрет на тоннаж боевых кораблей, и позволила Хорватии захватить несколько удобных гаваней на Адриатическом побережье. Это существенно повлияло на структуру ВМС, которая после 1943 г. выглядела следующим образом:
Главная военно-морская комендатура «Северный Ядран» (штаб в Црквенице, с 1943 г. в Сушаке) — ей подчинялись комендатуры в Кралевице (базы в Бакаре и Святом-Якове) и Сеньи (базы в Святом-Юрае, Ябланеце, Карлобаге, Оброваце и Паге)
Главная военно-морская комендатура «Средний Ядран» (штаб в Макарске, с 1943 г. в Сплите) — ей подчинялись комендатуры в Омише (база в Крило), Супетаре (базы в Милане, Сувитане, Постире, Боле, Повлиме и Сумартине), Макарске (базы в Башка-Воде, Подгоре, Играни, Заостроге и Граце), Метковиче (базы в Опузене и Неуме) и Хваре (базы в Стариграде, Йелсе, Врбоско и Сучурье)
Главная военно-морская комендатура «Южный Ядран» (штаб в Дубровнике) — ей подчинялись комендатуры в Трпанье (база в Драге), Оребиче (база в Трстенике) и Дубровнике (базы в Стоне, Слано, Шипане, Лопуде и Затоне), а также подкомендатура в Кавтате
Кроме главных военно-морских комендатур Главному командованию ВМС также подчинялись следующие военно-морские базы: 1-го класса (Црквеница, Сенья, Макарска, Хвар и Дубровник), 2-го класса (Карлобаг и Шипан) и 3-го класса (Кралевица, Обровац, Сучурье, Омиш и Кавтат)
Комендатуры в Сисаке, Бродна-Саве, Хрватске-Митровице, Земуне, Петроварадине, Вуковаре и Осиеке