Поначалу этих ученых игнорировали, над ними подсмеивались. Но усовершенствованные методы молекулярных исследований позволили более детально осуществлять изучение микробиома, а растущие возможности компьютеров облегчили сортировку и анализ гигантских баз данных. В первую очередь было необходимо провести картирование микробов: какие микроорганизмы живут рядом с нами и в каком количестве? На поверхности тела человека сразу после рождения начинает собираться характерная флора из бактерий и грибков. Как и на любой клумбе, сочетание их видов будет индивидуальным. Здесь почвопокровные однолетники, там многолетние травы, в тени немного мха, смесь из гиацинтов и гербер, чуть-чуть тысячелистника и вдобавок пару кустов — цветник готов. Что касается человеческой бактериальной флоры, то разнообразие просто огромно: в кишечнике и на коже живет около 10 тысяч различных видов бактерий. У каждого человека в организме больше бактерий, чем собственно клеток: 39 триллионов бактерий и 30 триллионов клеток. Общий вес бактерий составляет примерно 2 процента от веса тела! Давно известно, что вмешательство в эту флору может стать причиной развития болезней. Лечение антибиотиками вносит изменения во флору слизистых оболочек и может привести к возникновению грибковых заболеваний во рту, кишечнике или влагалище, а в тяжелых случаях — вызвать воспаление кишечника из-за неконтролируемого размножения вредных бактерий. Но до сих пор эти побочные эффекты считались острыми и временными расстройствами: как только заканчивался прием антибиотиков, во флоре восстанавливалось равновесие.
Новые веяния в микробиологии заставили исследователей копнуть глубже. В чем заключается долговременное влияние бактериальной флоры? Есть ли у человека своя уникальная, наподобие отпечатка пальца, микрофлора? И если да, то за счет чего это получается? Какую роль играют бесчисленные бактерии, не входящие в перечни обычных возбудителей заболеваний? Влияют ли доброкачественные бактерии на нашу иммунную систему? И главное, может ли изменение микрофлоры вызвать или, наоборот, предотвратить развитие хронических заболеваний?
И действительно, с началом нового тысячелетия стало появляться все больше сведений о взаимосвязях между нарушениями микробиома и хроническими болезнями. Постепенно начали вырисовываться определенные закономерности. У здоровых людей бактериальная флора стабильна и разнообразна, а у больных ее состав беднее, но зато доминируют отдельные виды. Появился такой термин, как «дисбиоз» — нарушение нормального состава бактериальной флоры, которое не вызывает каких-то определенных жалоб, но способствует развитию хронических заболеваний и даже может их вызывать.
Однако многие врачи продолжали проявлять скептицизм, интерпретируя изменение состава микрофлоры как следствие основного заболевания, а не как его причину. Однако вскоре один клинический эксперимент произвел сенсацию в мире медицины. С помощью трансплантации кала врачи пересадили кишечную микрофлору здорового человека пациенту с воспалительным заболеванием кишечника, после чего состояние больного резко улучшилось. Так впервые была подтверждена прямая связь между дисбиозом и хронической болезнью. Реализация проекта Национального института здоровья «Микробном человека» открыла новую эру в медицинской науке. Для начала ученые определили, от каких частей тела можно ожидать наибольшего прогресса в подобных исследованиях: кишечник (ясно), кожа (логично), рот (понятно), влагалище (ну, так и быть). Что еще? Да ничего, вообще ничего. Вы не ослышались: за легкие не было подано ни одного голоса. Что это? Заговор кардиологов, которые таким способом попытались отвоевать у пульмонологов славу (и деньги на исследования)? Промашка самих пульмонологов, которые затянули со сроками подачи заявки или собрали не все нужные документы? Ответ прост: еще несколько лет назад легкие считались стерильными, в них вообще не было микрофлоры. Зачем же исследовать микробном органа, которого не существует?
Правда, в скором времени это решение пришлось признать неправильным, и с сегодняшней точки зрения оно действительно представляется слегка наивным. Уже в 2007 году начали раздаваться голоса, в которых звучало сомнение относительно «стерильности» легких. С какой стати им вдруг быть стерильными? Через этот орган каждый день прокачивается более 10 тысяч литров воздуха. Если в каждом литре содержатся сотни бактерий, то какие-то из них должны же оседать в легких? Однако, как ни пытались ученые выращивать бактериальные посевы из слизи дыхательных путей здоровых людей, ничего не вырастало: почва продолжала быть бесплодной, несмотря на старательный полив и удобрение, — ни стебелька, ни листка. Легкие оставались последним оплотом чистоты.
До поры до времени.