Еще большие неприятности ожидали Э. Шеварднадзе на фронтах грузино-абхазской войны. Английский военный журнал «Мир Кавказа» (Caucasus World) опубликовал пространную статью «Абхазы. Военные аспекты войны: поворотный момент» (автор — Георг Хевитт), посвященную сражению за Гагры. Она представляет исключительный интерес для истории военного искусства. Перед началом наступления абхазские силы не имели превосходства ни в живой силе, ни в технике, но абхазские отряды контролировали все высоты над городом. Стратегия абхазов и северокавказских добровольцев состояла в том, чтобы пересечь реку Бзынь к югу от Гагр и занять стратегически важную деревню Колхида. Само вторжение в Гагры осуществлялось атакой в трех направлениях, с южных проходов к городу. Одна группа следовала вдоль береговой линии и атаковала город со стороны пляжа и болотистой территории через туристический лагерь, расположенный в южной черте города. Другие два абхазских отряда пробивали свой путь через город по параллельным осям (по Старому и Новому шоссе). Абхазские отряды, прорывающиеся по Старому шоссе, должны были пробиться к центру города и объединиться с отрядами, продвигающимися вдоль побережья. Отряды, продвигающиеся по Новому шоссе, должны были сократить дорогу в Гагры, направляясь к северному краю города, чтобы блокировать любое грузинское подкрепление, которое могло прибыть с севера. Таким образом, абхазские отряды стремились заманить в ловушку картавелинские силы, защищающие Гагры. Нападение пошло по плану. Оба отряда абхазов сошлись в бою против грузинских сил, защищавших железнодорожную станцию. Борьба за нее продолжалась три часа (с 6.00 до 9.00). 2 октября абхазские отряды продолжали наступать в течение всего дня. Следующим местом решительного сопротивления был санаторий напротив универсама. Но к 17.35 эта позиция была окружена и разрушена. Другие отряды абхазов проследовали вниз вдоль Старого шоссе через центр города, и к 16.00 все главные опорные пункты грузинской обороны были под полным контролем абхазов, включая отель «Абхазия» и полицейский участок. Спустя полтора часа Гагра была полностью под контролем абхазов.
Чрезвычайно жестокой была битва за полицейский участок, так как его защищали местные грузинские милиционеры и члены элитного отряда «Белый Орел». В районе Центра реабилитации абхазы взяли 40 пленных.
В ранние утренние часы 3 октября из Сухуми прибыли грузинские вертолеты, но их было слишком мало, чтобы остановить абхазское наступление.
В дальнейшем грузинская оборона Гагр превратилась в крупномасштабное отступление. Грузинское население тысячами бежало в сторону российской границы.
В полдень 3 октября грузинский бомбардировщик СУ-25 атаковал абхазские позиции на пересечении старого и нового шоссе в санатории «Украина». Грузины силами формирования «Белый Орел» стали готовиться к контрнаступлению. 60 отрядов должны были обойти санаторий через горы и напасть на него с высоты. В то же время часть грузинских сил (военная полиция, батальоны «Кутаиси», «Тетри арциви») продвигалась к югу от шоссе, захватывая Старые Гагры и атакуя санаторий. Но это наступление провалилось после того, как грузины увидели на побережье два корабля и высаживающихся из них на побережье абхазов.
На следующий день, 5 октября, абхазы загоняют «Белый Орел» в очень сложную горную местность. К 18.00 эти элитные грузинские силы были разбиты. После этого грузинские формирования были рассеяны по окрестным деревням, а в 8.40 6 октября абхазы вышли на границу с Россией и подняли свой флаг.
Остатки грузинских формирований в течение последующих двенадцати дней понесли тяжелейшие потери, в том числе погиб Гоги Каркарошвили, брат главкома грузинских войск. Сам руководитель Госсовета чудом спасся на вертолете, который сделал два рейса и забрал 62 боевика.
Абхазские формирования захватили 2 танка, 25 БМП, радиостанцию, катер и тысячи пленных.
Под Гагрой были разгромлены отборные грузинские батальоны: дидгорский, цхалтубский, руставский, 101-й гагрский и другие элитные части «Мхедриони». Поражение грузинских частей предвещало, в конечном счете, поражение в войне.
Абхазия получила возможность получать вооружения и добровольцев через горные перевалы и свои северные границы.