В Йене центром протеста стал всемирно известный завод точной оптики «Карл Цейс». Вышедшие из его ворот рабочие направились к центру города и уже в 10 часов утра стали штурмовать тюрьму, которую защищали всего пять полицейских (двое из них — женщины). Присланная на подмогу машина полиции была перевернута демонстрантами, а находившиеся в ней полицейские избиты. Вооруженные монтировками и сварочными аппаратами люди ворвались в тюрьму, освобождая заключенных. Дорогу им показывала бывшая служащая народной полиции, ранее уволенная из органов. Тюрьму захватили очень быстро, что свидетельствует о хорошей организации нападавших. Те явно спешили, так как рядом с тюрьмой находился советский лазарет с вооруженной охраной. Почти одновременно с тюрьмой были захвачены райком СЕПГ (подоспевшая вскоре полиция задержала там 13 человек), районное управление МГБ и райком ССНМ. Нападению подверглись также штаб-квартиры местных отделений ССНП, Общества германо-советской дружбы, Демократического союза женщин. Сотрудники МГБ и райкома СЕПГ были ранены, и их пришлось доставить в больницу. В 16.00 в центре Йены появились советские танки. Манифестанты пытались распропагандировать танкистов, крича, что являются их друзьями. Люди взбирались на танки и совали в стволы разные предметы. Тем не менее, к вечеру ситуация стабилизировалась.
Если в Гере насильственные акции осуществляли практически только шахтеры «Висмута», то в Йене налицо были действительно массовые и хорошо организованные волнения. Конечно, полиция, имея на весь округ всего 320 исправных карабинов, не смогла бы восстановить контроль без помощи советских войск.
Демонстрацию в Лейпциге начали строительные рабочие, выражавшие солидарность с берлинскими коллегами. Манифестанты требовали в частности, повышения зарплаты на 30 % и отмену сдельной системы оплаты труда как таковой. Появились и политические лозунги (отставка правительства, свободные выборы, освобождение политзаключенных, масло вместо пушек и т. д.). К обеду в центре города собрались более 40 тысяч человек. Все государственные и партийные здания были взяты в осаду. Разгрому подверглись радиодом, райком ССНМ и окружной суд. Положение полиции осложнялось тем, что 330 человек из ее состава накануне были отправлены в Берлин, и в Лейпциге оставались 1100 стражей порядка. На некоторых предприятиях под руководством народной полиции были образованы отряды самообороны, вооруженные мелкокалиберными винтовками. С самого начала столкновения в Лейпциге отличались особым ожесточением. Когда при обороне тюрьмы полицейские начали стрелять в воздух, нападавшие стали забрасывать их горящими бутылками с бензином и спиртом. Пришлось стрелять на поражение, в результате чего был убит один рабочий и 64-летняя пенсионерка. 60–80 человек ворвались на вокзал и захватили в помещении транспортной полиции 32 пистолета. Этой акцией руководил уволенный ранее именно из этого подразделения бывший полицейский. В 15.00 на площади у вокзала начался митинг, разогнанный позднее советскими войсками и полицией.
Несмотря на объявленное в 16.00 военное положение, беспорядки в Лейпциге не прекращались. К концу дня погибли еще пять демонстрантов и прохожих, случайно попавших под пули. 60 человек получили огнестрельные ранения. Со стороны народной полиции был убит один и ранены 35 сотрудников. Всего силы правопорядка произвели в Лейпциге 17 июня 3200 выстрелов. К 21.00 небольшой гарнизон советских войск с помощью полиции нормализовал обстановку, а ночью в Лейпциг вошли переброшенные из летних лагерей крупные силы Советской Армии. В отчете Семенова о событиях 17 июня отмечается, что партийная организация Лейпцига показала свою полную несостоятельность. На некоторых заводах организации СЕПГ были даже распущены, а работники райкомов боялись появляться на предприятиях. Только слабой политической агитацией можно объяснить то обстоятельство, что 20 тысяч забастовщиков в Лейпциге (из 120 тысяч рабочих) смогли стать в городе полными хозяевами положения.
Но в тот трагический день 17 июня кровь пролилась не только в столице округа. В райцентре Делицш забастовку, переросшую в демонстрацию, начали рабочие железнодорожных мастерских. К ним на помощь подъехали на поезде рабочие из Биттерфельда. Совместными усилиями был захвачен райсовет, где были выбиты окна и повреждена телефонная связь. С помощью советских войск полиция отбила райсовет, но демонстранты напали теперь уже и на райотдел полиции. Их пытались образумить уговорами, но помогла только стрельба на поражение. Двое нападавших (19-летний ученик слесаря и 20-летний каменщик) были убиты.