При наличии специальных условий доктор может назначить посев материала в культурные среды для точной идентификации патогенного микроорганизма, вызвавшего или осложнившего течение язвы. После капельной анестезии из области роговицы, находящейся в непосредственной близости от язвы, нежно соскребается небольшое количество роговичной ткани, которую затем высевают в культуру. Тут нужно отметить, что результаты посева становятся доступными очень поздно (обычно через неделю), поэтому врач назначает лекарственную терапию, как говорят, эмпирически, т. е. на основе разумного предположения, какая группа бактерий вызвала патологический процесс.