На заседании Секретариата Коминтерна 23 ноября 1939 года было признано, что руководство КПЮ своей деятельностью смогло завоевать доверие членов партии. Данное заседание сыграло важную роль в окончательном позитивном разрешении так называемого вопроса о КПЮ, поскольку на нем фактически была не только одобрена деятельность Тито, но и подтвержден его мандат как Генерального секретаря ЦК КПЮ. Тем не менее и в этот приезд ему пришлось заниматься опровержением компрометирующих материалов, подброшенных его недоброжелателями. На этот раз он был объявлен «югославским немцем из Осиека, работавшим в Компартии Германии», и обвинен в троцкистском искажении при переводе им на хорватско-сербский язык IV главы «Краткого курса истории ВКП(б)». Но при обсуждении этого вопроса в Контрольной комиссии Коминтерна была доказана абсурдность обвинения. Неприязнь к Тито его оппонентов проявилась и в том, что они ему стали приписывать «склонность к буржуазным манерам» на том основании, что он носил перстень.
Сформированное И. Броз Тито Временное руководство состояло в основном из молодых, глубоко преданных делу коммунистов. Большинству из них еще не было и 30 лет, но они уже имели за плечами богатый опыт революционной работы. В знак уважения к И. Броз Тито, а также признания старшинства его соратники пользовались в обиходе кличкой «Старик», которая прочно закрепилась за ним на всю жизнь.
После фашистского нападения на Югославию, совершенного 6 апреля 1941 года, только КПЮ заявила о непризнании оккупации и расчленения страны, высказалась за продолжение сопротивления захватчикам.
В ответ на призыв коммунистов под лозунгами «Смерть фашизму — свободу народу», «Братство и единство» по всей стране начали объединяться антифашистские силы, формировались многочисленные партизанские отряды, руководство которыми стал осуществлять созданный 27 июля вместо прежнего Военного комитета Главный штаб народно-освободительных партизанских отрядов Югославии во главе с И. Броз Тито. Вслед за поднявшимися на борьбу 7 июля сербскими партизанами 13 июля восстала Черногория, 22 июля — Словения, 27 июля — Хорватия, а также Босния и Герцеговина и, наконец, 11 октября — Македония.
Тито носил тогда советскую пилотку, прозванную впоследствии «титовкой», ставшую составной частью военной формы, введенной в народной армии новой Югославии. По его словам, у всех на головных уборах были пришиты красные звезды, сделанные из плотной материи, в то время как на пилотке у Тито сверкала кем-то подаренная ему эмалированная советская звездочка с серпом и молотом.
В западной печати фамилия Тито стала появляться только с конца 1942 года При этом строились самые невероятные догадки по поводу того, кто же в действительности скрывается за этой фамилией: венгерский коммунист, бывший советник посольства СССР в королевской Югославии Лебедев и т. д. 4 декабря 1944 года газета «Нью-Йорк таймс» поведала: «Относительно личности Тито имеется много теорий. По одной из них, которую многие югославы считают достоверной, до сих пор было три Тито. Как только погибает один из них, другой занимает его пост, подчеркивая тем самым свое бессмертие, подобно легендарной птице феникс».
Некоторые западные газеты договаривались до того, что слово «Тито» происходит от первых букв организации, называющейся «Третья интернациональная террористическая организация», другие утверждали даже, что Тито — женщина.
Когда же выяснилось, что Иосип Броз — видный хорватский коммунист, — командующий немецкими войсками в Сербии пообещал за голову лидера югославских партизан 100 000 рейхсмарок золотом. В листовке Тито назывался «большевистским агентом», вознамерившимся установить «советскую республику» в Югославии, в связи с чем «прошел подготовку в гражданской войне в Испании, а также в Советском Союзе, где освоил все террористические методы ГПУ».
Гитлеровские войска провели в течение войны семь генеральных наступлений против Народно-освободительной армии и партизанских отрядов, сковывавших на протяжении всей войны от 30 до 55 вражеских дивизий. Но им не удалось ни в ходе этих наступлений, ни в крупнейших боях за Ужице (1941), на Козаре (1942), на Неретве (1943), а также в битве на Сутьеске (1943), к участию в которой «немецкие оккупанты вынуждены были привлечь больше сил, чем в известном сражении у Эль-Аламейна», сломить народно-освободительное движение. В ходе одного из ожесточенных боев 9 июня от осколка разорвавшейся рядом бомбы получил ранение в левую руку Тито. Он уцелел только благодаря тому, что его собака по кличке Люкс закрыла хозяина своим телом.