Главной задачей Мао считал сохранение боеспособности китайской Красной Армии, ибо сознавал, что без собственных вооруженных сил влияние КПК быстро сойдет на нет. В конце 1936 года по требованию СССР Мао помирился с Чан Кайши для совместного противодействия японской экспансии в Китае. В августе – ноябре 1940 года Мао предпринял «Наступление ста полков» против японцев, однако основной упор в ходе этого наступления сделал на укрепление позиций КПК в Северном Китае. Он считал крестьянство главной движущей силой революции. Боевые действия не достигали здесь существенного размаха. Мао к тому же получал советское оружие. Чан Кайши же приходилось вести гораздо более тяжелые бои с основными силами японцев на юге Китая, что существенно ослабляло его армию. В апреле 1945 года Мао был избран постоянным председателем ЦК КПК, став тем самым пожизненным руководителем китайских коммунистов. Численность партии с 40 тысяч членов в 1937 году, в начале войны против Японии, возросла до 1,2 млн членов в 1945 году. Коммунистические войска применяли партизанскую тактику, разработанную Мао. Они избегали столкновений с крупными отрядами неприятельских войск, старались нападать врасплох на небольшие подразделения, а при преследовании крупными отрядами японцев или гоминьдановцев смешивались с обычными крестьянами. В 1946 году возобновилась открытая гражданская война. К осени 1949 года маоисты, получавшие массированную советскую военную и финансовую помощь, окончательно разбили армию Чан Кайши, бежавшую на Тайвань. Исход войны был во многом определен тем, что в США решили, что содержать весь Китай будет слишком обременительным, и решили уступить эту обузу Сталину. В ходе Хуйхэйской битвы в ноябре 1948 – январе 1949 года войска Чан Кайши окончательно утратили боеспособность. Более 400 тысяч из них были взяты в плен или добровольно перешли на сторону Мао. 1 октября 1949 года была провозглашена Китайская Народная Республика. В последующие пять лет после победы Мао провел новую чистку партии от своих действительных и потенциальных противников. В деревне было ликвидировано помещичье землевладение и проведена всеобщая насильственная коллективизация крестьянства, объединенного в «народные коммуны».
В ноябре 1950 года Мао послал китайские войска, официально именовавшиеся «народными добровольцами», в Корею на помощь Ким Ир Сену для борьбы с американскими и южнокорейскими войсками. В этой войне, в ходе которой перемирие в 1953 году было заключено примерно на тех же позициях, которые стороны занимали в ее начале, погиб сын Мао Цзэдуна. В 1950–1956 годах в Китае было проведено обобществление экономики. При этом репрессиям подверглись бывшие сторонники Гоминьдана. В ходе насильственной коллективизации было уничтожено до 2 млн человек.
После смерти Сталина Мао стал претендовать на роль самого значительного из числа здравствующих теоретиков-марксистов. В 1957 году он выдвинул лозунг «Пусть расцветут сто цветов, пусть соперничают тысячи школ разных мировоззрений». Мао призывал творческих работников смело критиковать партию, но те, кто слишком буквально понял этот призыв, очень быстро поплатились за собственную политическую наивность. На практике движение «Ста цветов» свелось к борьбе против неосторожно обозначивших себя инакомыслящих и утверждению в стране культа личности «председателя Мао». Одновременно крестьян побуждали вступать в «народные коммуны». За 1953–1957 годы, время осуществления первого пятилетнего плана, промышленное производство возросло в 2,4 раза, с советской помощью было построено около 500 крупных промышленных предприятий. Эти успехи вскружили Мао голову. Летом 1958 года была объявлена программа «большого скачка», в ходе которой за семь лет предполагалось достичь уровня высокоразвитых индустриальных государств и построить основы коммунистического общества. Мао выдвинул лозунг: «Три года упорного труда – десять тысяч лет счастья». Основной упор был сделан на создание «народных коммун» и мелких промышленных предприятий в сельских районах. При этом в коммунах действовал строго уравнительный принцип распределения доходов, а на мелких кустарных предприятиях выплавляли сталь и производили другие изделия столь низкого качества, что путь им был один – на свалку. Были ликвидированы все еще сохранившиеся к тому времени частные предприятия. Эта авантюра провалилась уже к концу 1958 года и вызвала хаос в экономике, усугубленный неурожаем из-за неблагоприятных погодных условий и отвлечения десятков миллионов крестьян на выпуск никому не нужных кустарных чугуна и стали. В ходе голода погибло до 20 млн человек.