В 1962 году бывший испанский дипломат, пресс-атташе в Лондоне Анхель Алькасар де Веласко сообщил журналистам, что принимал участие в переправке в 1947 году Эйхмана и в 1946 году Бормана из Испании в Латинскую Америку. По его словам, в 1945 году Борман прибыл в Испанию, а в мае 1946 года отплыл в Аргентину. Позднее Борман сделал себе пластическую операцию, что позволило ему посещать Европу. А в 1958 году Веласко видел Бормана в Аргентине.
Всё это время прокуратура земли Гессен (ФРГ) продолжала следствие по делу Бормана, занимаясь опросом свидетелей и лиц, которые якобы видели его после войны. В связи с этим в 1963 году генеральный прокурор Бауэр заявил журналистам, что прокуратурой собран целый ряд данных, свидетельствующих о том, что Борман жив. Однако в 1972 году во время строительных работ в Берлине были найдены останки человека в солдатской шинели. Обнаруженный скелет имел большое антропологическое сходство с физическими параметрами Бормана.
Экспертная комиссия, изучавшая их, пришла к выводу, что они действительно принадлежат Борману. Это подтвердил и Эхтман, бывший зубной врач Бормана, который опознал зубной протез, сделанный им для рейхсляйтера. Как сообщила комиссия, Борман покончил жизнь самоубийством: в ротовой полости найденного черепа были обнаружены следы цианистого калия. На основании этого заключения в 1973 году суд ФРГ вынес вердикт: Мартин Борман мёртв и умер он 2 мая 1945 года.
Впрочем, даже заключение суда не остановило появление новых предположений о том, что Борман жив. Среди них выделяется версия некоего Бориса Тартаковского, выпустившего в 1992 году в Москве брошюру «Мартин Борман — агент советской разведки». Автор утверждает, что в первой половине 1920-х годов начальник советской военной разведки Берзин попросил лидера немецких коммунистов Тельмана подобрать подходящего товарища для внедрения в окружение Гитлера. Тельман просьбу выполнил, и через некоторое время в Ленинград из Германии приехал немецкий коммунист Карл. После основательной спецподготовки Карл получил задание в течение 3–4 лет внедриться в окружение Гитлера. Задание было настолько секретным, что настоящее имя Карла — Мартин Борман — знали только Берзин, Тельман и руководящие сотрудники ОГПУ-НКВД Артузов и Пиляр.
2 мая 1945 года, оставшись в бункере рейхсканцелярии, он передал по рации следующее сообщение: «Прошу помощи. Нахожусь в западной стороне рейхсканцелярии. Ближайший вход северный. Движение по коридору на восток. Помещение 114». В 14 часов 2 мая к рейхсканцелярии подошли танки под командованием генерала Серова. Они окружили указанный вход, и через 30 минут Серов в сопровождении автоматчиков вывел человека с синими мешком на голове. Этим человеком был Борман. В дальнейшем он жил в СССР, где передал известную ему сверхсекретную информацию советскому руководству. Умер Борман в 1972 году и похоронен на старинном кладбище в Лефортово. Разумеется, никаких доказательств в пользу своей версии Тартаковский не приводит.
А в 1993 году появилась другая версия смерти Бормана, на этот раз — в Латинской Америке. Её автором стал директор парагвайской газеты «Нотисиас» Нестор Лопес Морейра, в руки которого попал найденный в архивах бывшего парагвайского диктатора Стресснера документ, датированный 1961 годом. Этот рапорт, написанный начальником отдела внешних сношений МВД Парагвая Педро Прокопчуком и адресованный техническому отделу МВД. В нём говорится, что Мартин Борман прибыл в Парагвай в 1956 году и проживал в местечке Хоэннау департамента Итапуа, что находится в 350 километрах к югу от Асунсьона, в доме некого Альбана Круга. 15 февраля 1959 года он умер от рака желудка в доме Вернера Юнга, генерального консула Парагвая в ФРГ, и два дня спустя был похоронен на кладбище посёлка Ита в 35 километрах от столицы. Впрочем, как и Тартаковский, Морейра не приводит ни каких доказательств, кроме копии рапорта Прокопчука.
В 1996 году на страницах аргентинской газеты «Маньяна дель сур», издаваемой в городке Барилоче, появилось сообщение о том, что Борман на самом деле умер в Аргентине от банального гепатита. В качестве доказательства в газете была опубликована фотокопия паспорта на имя гражданина Уругвая Рикардо Бауэра, под которым, оказывается, и жил всё это время Борман. Этот документ, как пояснили журналисты газеты, принёс в редакцию «человек немецкого происхождения, проживающий в Чили». Он будто бы купил в Чили дом у того самого Бауэра, а потом на ферме нашёл и паспорт, выданный в 1948 году консульством Уругвая в Генуе. При этом «человек немецкого происхождения», пожелавший остаться неизвестным, уверенно заявил, что Борман — Бауэр прожил в Чили более 25 лет, а перед самой смертью перебрался в Аргентину.