Афера против Фрича еще не пришла в своему неудовлетворительному, с точки зрения вермахта, концу: генерал-полковник был оправдан, однако без действительной реабилитации, когда вступление войск Гитлера в Австрию отвлекло внимание общественности и вермахта от внутренних трудностей к сфере внешней политики. Решение австрийского вопроса в той форме, в какой это произошло 11 марта 1938 г., явилось неожиданностью и для Канариса. Возможно, его внимание, как и внимание других военных начальников, в февральские недели было слишком занято кризисом внутри вермахта и было отвлечено от обострения отношений с Австрией. Но это совсем не значит, что он не учел развитие событий в этом регионе весной 1938 г. Он даже выполнял служебные поручения в период между визитом австрийского канцлера в Оберзальцберг и вступлением войск. Гитлер, для того чтобы оказать давление на австрийское правительство, распорядился провести некоторые отвлекающие маневры, в результате которых должно было сложиться впечатление о концентрации войск на германо-австрийской границе. Кроме того, сюда относилось также распространение слухов об усилении пограничных сторожевых постов и даже усиленная работа военных радиостанций в пограничном районе Баварии, которая должна была создать впечатление о подходе войсковых подкреплений. В этом должна была принимать участие и разведка, и Канарис получал от Кейтеля соответствующие приказы и давал необходимые указания. Можно сразу отметить, что планируемый обман не удался. Об этом Канарис узнал после введения войск в Вену в отделе разведки министерства обороны. Там маневр сразу разглядели. Только позже, когда вступление войск действительно произошло, обманный маневр вначале имел косвенное действие, поскольку австрийские командные посты сначала не хотели верить, что этот обман оказался действительностью.
То, что Канарис был до некоторой степени изумлен развитием событий в начале марта, связано, очевидно, с тем, что сам Гитлер из-за референдума, проведенного в Австрии под руководством Шушнига, был вынужден действовать быстрее, чем это вначале планировалось.
Канарис сразу после вступления немецких войск отправился в Вену. Там он встретился, между прочим, также с Лахоузеном, который в чине подполковника служил в отделе разведки министерства обороны. По предложению полковника Мароньи из мюнхенского отдела разведки Лахоузен, как уже упоминалось, был принят в абвер. Уже после первого разговора со своим новым начальником он получил ясное представление об установке, которая существовала в руководстве разведки по отношению к партии. Речь зашла о том, какие еще офицеры из австрийской службы разведки могут годиться для службы в абвере. Канарис в присутствии майора Гроскурта заявил: «Не приводите, особенно в берлинский центр, нацистов, приводите австрийцев». Еще более ясно высказался полковник Остер, когда Лахоузен нанес ему первый визит в бюро. Остер прямо сказал Лахоузену, которого видел впервые: он должен знать, что во главе государства стоит преступник.
Канарис уже во время этого визита в Вену вскоре после происшедшего «аншлюса» пришел к выводу, что удачное осуществление этого первого бескровного захватнического нашествия Гитлера, которому не было оказано никакого серьезного сопротивления со стороны западных держав, таило в себе большие опасности для будущего. В речи Гитлера при вступлении войск в Вену он уже отчетливо различал признаки будущей мании величия. Легкий успех должен был толкнуть Гитлера на новые и более опасные авантюры. Это чувствовал Канарис с абсолютной уверенностью, а он знал, что его интуиция никогда его не подводит. И тогда сопротивление в руководстве вермахта будет еще слабее, чем прежде. Вера в то, что «фюрер это сумеет» и что «другие не осмелятся помешать», похоже, начала подтверждаться. Такие размышления объясняют резкое замечание Канариса одному офицеру австрийского генерального штаба, который был ему представлен в эти дни: «Вы, австрийцы, сами во всем виноваты. Почему вы не стреляли?!»
При этом было бы неверно говорить, что Канарис был противником присоединения Австрии к рейху. Напротив, он очень сожалел, что в 1919 г. союзные власти помешали добровольному объединению обоих немецких государств. Он и сегодня считал объединение на основе свободного решения обеих сторон и без давления со стороны могущественной империи желанной целью немецкой военной политики. Но он, противник всех насильственных методов как в отношениях между людьми, так и в отношениях между государствами, не мог одобрить смесь насилия и лживой пропаганды, с которой Гитлер положил конец австрийскому государству, даже если восторженный прием, с которым население Австрии встречало вступающие немецкие войска, казалось, задним числом оправдывало государственный переворот, совершенный Гитлером.