В организации засад и боевых выходов на контролируемую противником территорию требовалось проявлять все больше находчивости и изобретательности. В марте 1987 года разведчики 70-й омсбр, получив данные о готовящейся проводке каравана, скрытно перебросили на близлежащую заставу «Труба» разведвзвод старшего лейтенанта АН. Холода. Наблюдение пришлось вести еще три недели, разведчики скрывались от посторонних глаз, и днем никто из них не выходил наружу. Определив маршрут, охранявшийся двумя постами моджахедов, занялись непосредственно организацией засады. Отвлекая внимание, к городу на виду противника ушли три БТР с солдатами заставы. В полночь Нового года по мусульманскому календарю разведвзвод из 26 человек, усиленный отделением АТС-17, пешим ходом двинулся к месту засады. Оставив группу прикрытия в пещере, разведчики замаскировались у дороги, где пришлось провести двое суток. Караван так и не появился, но перехваченная напоследок машина с охранением мотоциклистов дала результат — в ней был убит главарь крупной банды Ока и его советник.
В апреле 1987 года разведрота старшего лейтенанта Ю.Н. Петрова из 108-й мсд для устройства засады была доставлена на заставу «Ближняя» у Баграма на машинах Военторга, а ее бронегруппа изображала охранение трассы. Загодя на путях вероятного отхода душманского каравана выставили мины. Подошедшая ночью вьючная колонна попала в ловушку — артиллерия заставы открыла огонь осветительными снарядами, а разведчики открыли стрельбу из засад, загоняя противника на минные поля, где сработали все мины. На месте остались 38 трупов караванщиков, сама разведрота имела двоих легкораненых.
За первую половину 1987 года (с 1 января по 15 июня) подразделениями спецназа были выполнены 840 вылетов на разведывательно-боевые действия, из которых в 168 удалось перехватить боевиков, оружие и военные грузы. За это время силы спецназа уничтожили 131 караван, 80 машин и 1416 душманов, захватив 69 ПЗРК, 4500 реактивных снарядов, 9000 кг наркотиков и 2,8 млн. патронов — третью часть от всех трофеев 40А.
Все же, по оценке разведотдела 40-й Армии, перехватывать удавалось не более пятой части всех караванов. Случались и просчеты, большей частью из-за неточных разведсведений и ошибок в планировании и тактике. К трагическим последствиям могла привести недооценка сил противника, ведь и без того действовать обычно приходилось при его численном превосходстве. 8 декабря 1987 года патрульный полет пары Ми-8 капитанов Евдокимова и Радаева имел неожиданное завершение: замеченного с воздуха мотоциклиста командир досмотровой группы решил прихватить для допроса. Оказалось, что разведчики высадились в самом «душманском районе», который советники рекомендовали облетать подальше, не то что садиться. Группа оказалась под перекрестным огнем, и подлетевший вертолет Евдокимова был тут же подбит из гранатомета. Экипаж спасла малая высота — просевшая машина покатилась дальше по земле, разгораясь. Его ведомый Радаев пошел на выручку, подобрал экипаж и спецназовцев, но и его Ми-8, не успев набрать высоту, упал рядом. Под огнем вертолетчики и разведчики дожидались помощи, пока Ми-24 прикрывали их огнем пушек. В этом бою погиб один из бойцов, многие были ранены.
Несколько раз группы сами попадали в ловушку и погибали полностью. Подстерегавшие их душманы дожидались, пока уйдут вертолеты, брали засаду в кольцо и накрывали огнем. Иногда впереди каравана пускали машину — приманку, рассчитывая на то, что засада обнаружит себя. К месту боя подтягивались окрестные банды и, если вертолеты задерживались, блокированная группа могла рассчитывать только на свои силы и тающий запас патронов.
В декабре 1986 года большие потери повлек очередной выход разведчиков «Чайки» на взятие «Стингеров», остававшихся самыми ценными трофеями (каждый отбитый у врага ПЗРК означал не только сбереженные самолеты и вертолеты, но и продолжение их нормальной работы, без которой немыслима была деятельность армии). На границе в районе Тарве группа была блокирована на высоте 2801, но вывезти ее не давал плотный туман. Разведчикам пришлось вести бой в окружении под минометным и орудийным огнем. Только через три дня вертолеты комэска 239 овэ подполковника Леонтьева и капитана Максимова смогли пробиться через перевал и забрать 12 оставшихся бойцов и тела погибших.