Черным выдался октябрь 1987 года, когда на юге понесли большие потери Кандагарский и Шахджойский отряды. 24 октября разведгруппа 173-го ооспн ночью заняла засаду в 75 км от Кандагара. К утру она была блокирована многочисленной бандой. Вызванная бронегруппа задержалась из-за поломок техники. 20 спецназовцев, засевших в руинах заброшенного кишлака Кобай, пять часов держались под обстрелом. В бою погибли 9 человек, включая замкомбата майора В.М. Удовиченко, все уцелевшие бойцы имели ранения (по злой прихоти судьбы, майор Удовиченко был полугодом ранее переведен в бригаду с должности командира 668-го ооспн «за потери личного состава»).
Через неделю, 31 октября, под Шахджоем 186-й ооспн потерял 12 человек вместе с командиром группы старшим лейтенантом О. Онищуком. Офицеру, имевшему за полгода службы успехи во всех 11 боевых выходах, поначалу везло и в этот раз. Удалось взять грузовик с оружием, возле которого группа осталась дожидаться других машин каравана. Через несколько часов разведчики оказались в кольце. Бой длился недолго, но в живых остались только четверо. Израсходовав патроны, Онищук и младший сержант Исламов подорвали себя гранатами.
В операции у Лашкаргаха спецназ 29 января 1988 года вел разведку, в ходе которой бойцы попали под сосредоточенный огонь гранатометчиков. Выбраться тогда удалось благодаря поддержке с воздуха, трое были ранены, а одному посчастливилось отделаться потерей рюкзака, снесенного гранатой под самые лямки.
С началом вывода войск в мае 1988 года спецназ вместе с остальными частями 40-й Армии покинул прежние места дислокации. 154-й ооспн вернулся в Чирчик, 334-й ооспн также вывели на территорию САВО, а затем — в Белоруссию, покинули Афганистан к концу мая 173-й, 411-й, 370-й и 186-й ооспн. Последние месяцы работы были достаточно насыщены: так, 154-му ооспн удалось выполнить ряд удачных выходов, в том числе со взятием ПЗРК, за что принявший отряд только в январе капитан В.Ф. Воробьев (к слову, самый молодой его командир) был отмечен двумя орденами Красного Знамени. К августу из Афганистана вывели 205-ю и 239-ю «спецназовские» вертолетные эскадрильи. Их опыт в армейской авиации не был востребован и обе эскадрильи расформировали.
Осенью в Афганистане оставались только два отряда, 177-й и 668-й ооспн, действовавшие на севере и вокруг Кабула, причем последний размещался прямо в военном городке штаба 40А. Основной задачей в последние месяцы оставался перехват караванов и пресечение обстрелов столицы и уходящих колонн. Для этого у дорог и на господствующих высотах выставлялись дополнительные блокпосты и опорные пункты, охранявшие места ночевок войск и не допускавшие попыток моджахедов подобраться к дорогам. Всего на восточном направлении от Кабула до советской границы несли охрану 199 сторожевых постов. Зона деятельности спецназа существенно ограничилась, однако и за вторую половину 1988 года силами армии удалось взять 417 караванов, в которых захватили более 30 тыс. PC и 25 тыс. мин. В последние дни 668 ооспн занял блок-посты участка Чаугани-Доши на дороге к границе, а 177-й ооспн охранял режимную пограничную зону у Хайратона.
На западном направлении уход войск из Герата и Шинданда прикрывали разведроты 371-го и 101-го мсп, на восточном, где покидал Афганистан и штаб 40-й Армии, — 701-й орб из состава 108-й мсд и 783-й орб из 201-й мсд. Разведчикам 783-го батальона суждено было стать последними советскими солдатами и офицерами в Афганистане. Сопровождая командующего Армией, они пересекли границу 15 февраля 1989 года.
Список принятых сокращений и обозначений
А
— Армия.Бел ВО
— Белорусский Военный округ.