1885 — персональные выставки в Берлине и Варшаве. Избран членом Совета ИАХ. Написаны картины «У берегов Кавказа», «Буря у берегов Ниццы», «Штиль» (в двух вариантах), «Лунная ночь. Берег моря», «Берег Ялты», «Гора Арарат».
1886 — персональные выставки в Санкт-Петербурге, Одессе, Москве, Константинополе. Написаны картины «Чесменское сражение», «Зов о помощи», «Буря», «Парусник в бурю», «Смотр Черноморского флота в 1849 году», «Закат на море», «Ночной Константинополь», «Морской пролив с маяком».
1887 — в Императорской академии художеств Санкт-Петербурга праздновалось пятидесятилетие творческой деятельности художника, состоялась выставка его произведений, в честь юбилея Академией выбита золотая медаль. Избран почётным членом ИАХ. Персональные выставки в Санкт-Петербурге, Киеве, Стокгольме. Во Франции удостоен командорских знаков ордена Почётного легиона. «Портрет И. К. Айвазовского» написан К. Е. Маковским. Преподнёс в дар феодосийцам Субашский источник питьевой воды, находящийся в его имении Шах-Мамай, близ Феодосии. По инициативе И. К. Айвазовского проложен городской водопровод от Субашского источника в город. На набережной Феодосии по его проекту построен фонтан с питьевой водой, бесплатной для горожан. Написаны картины «Прощание А. С. Пушкина с морем», «Пушкин на берегу Чёрного моря» (исполнена совместно с И. Е. Репиным), «Ночь в Феодосии», «Штиль», «Волнующееся море», «Корабль в бурю», «Волга у Жигулёвских гор».
1888 — персональные выставки в Киеве, Константинополе. Награждён турецким султаном орденом «Меджидие» 1-й степени. В имении Шах-Мамай художника посетил А. П. Чехов. Поездка в Берлин. Написаны картины «Гнев морей», «Закат в степи», «Вид Петербурга», «Утро после бури»; исполнен графический «Набросок морского пейзажа».
1889 — поездка во Францию. Написаны картины «Волна», «Облака над морем. Штиль», «Морской пейзаж. Коктебель», «Ной спускается с горы Арарат».
1890-е, начало — на личные средства художника в Феодосии открыт фонтан, посвящённый памяти градоначальника А. И. Казначеева.
1890 — персональные выставки в Париже и Берлине. Награждён французским орденом Почётного легиона. Поездка во Францию и Италию. Создано полотно «Черноморский флот в Феодосии».
1891 — персональные выставки в Санкт-Петербурге, Ялте, Одессе. Принял участие в иллюстрировании юбилейного издания собрания сочинений М. Ю. Лермонтова. Написаны картины «Дарьяльское ущелье», «Переход евреев через Красное море».
1892 — персональные выставки в Берлине, Одессе. По инициативе И. К. Айвазовского ведётся строительство железной дороги в Крыму — от Феодосии до Джанкоя, пущен первый поезд в Феодосию, началась реконструкция феодосийского порта. Написаны картины «Ниагарский водопад», «Бриг “Меркурий”, атакованный двумя турецкими кораблями», «Прибой у крымских берегов», «Корабль “Императрица Мария” во время шторма», «Морской вид», «От штиля к урагану», «Лунная ночь. Неаполь», «Буря на море», «Марина», «Первый поезд в Феодосию», «Свадьба на Украине», «Крещение армянского народа. Григор Просветитель», «Клятва перед Аварайской битвой», «Автопортрет», создана графическая композиция «Парусный корабль в море».
1892—1893 — посетил Соединённые Штаты Америки вместе с супругой. Персональная выставка в Нью-Йорке. Чикаго, Сан-Франциско, Вашингтоне; принял участие в «Колумбовой выставке» в Чикаго.
1893 — персональная выставка в Санкт-Петербурге. Написаны картины: «Малахов курган», «Неаполитанский залив ранним утром», «В волнах», «Буря на море», «Прибой», «Айвазовский в кругу друзей».
1894 — персональные выставки в Санкт-Петербурге, Лондоне. Под курированием И. К. Айвазовского завершена реконструкция феодосийского торгового порта, ставшего крупнейшим в Крыму. Написаны картины «Дорога на Ай-Петри», «Лунная ночь на Босфоре», «Путешествие Посейдона по морю», «Перед Алупкой в Крыму (Лодка в море)».
1895— посетил Нахичевань-на-Дону, где встречался с Мкртичем Хримяном (1820—1907), верховным патриархом и католикосом армян.
12 апреля — возвращаясь в Феодосию, посетил в Таганроге Я. М. Серебрякова, преподнёс в дар таганрогскому паломническому приюту картину «Хождение по водам».
Написаны картины «Туман на море», «Неаполитанский залив ночью», «От штиля к урагану», «Золотой рог», «Волна», «Буря на море ночью», «Корабль в бурю», «Море», «Прибой», «Встреча Венеры на Олимпе», «Католикос Хримян Айрик в окрестностях Эчмиадзина».
1895—1896 — персональная выставка в Санкт-Петербурге.
1896 — созданы полотна «Океан», «Корабль в бурю».
1897 — персональные выставки в Москве, Санкт-Петербурге. Написаны картины «Неаполитанский залив ранним утром», «Прибой», «Остров Крит», «А. С. Пушкин на берегу Чёрного моря», «Наполеон на острове Святой Елены», «Ночь. Трагедия в Мраморном море», «Во время жатвы на Украине»; создано графическое произведение «Сошествие Ноя с Арарата».
1897—1898 — персональные выставки в Копенгагене, Одессе, Харькове.