Да, с годами, по воспоминаниям многих людей и его собственным признаниям, Святейший нередко стал впадать в гнев. Каялся в этом. Мог накричать на кого-то из ближайшего окружения за то, что тот совершил промах, поленился, соврал, недоделал что-либо. Но потом непременно извинялся и что-нибудь дарил обиженному им человеку. Гневливость он признавал своим основным грехом. Но это была не гневливость избалованного и капризного человека. Пожалуй, она сродни гневливости Петра Великого, который изо дня вдень клал самого себя на алтарь Отечества, жаждал ежедневной пользы для России и раздражался, когда видел, что окружающие далеко не всегда точно так же выкладываются в полной мере. Алексий II строил великую и обновлённую Церковь, не жалея себя, совершая титанический подвиг ежедневного труда и молитвы. Верша грандиозные дела, старался как можно чаще совершать Божественную литургию, памятуя, что без этого Господь не воззрит на его труды и не придёт на помощь.
Осенью 2000 года состоялся первый пастырский визит Святейшего Патриарха на Урал — в Екатеринбургскую и Челябинскую епархии. Он посетил монастырь под Алапаевском, возведённый на месте убиения преподобномучениц великой княгини Елизаветы, инокини Варвары и других алапаевских мучеников, побывал в урочище Ганина Яма, где уничтожались тела царственных страстотерпцев, заложил капсулу с памятной грамотой в основание храма-памятника на крови во имя Всех Святых, в земле Российской просиявших, в Екатеринбурге, на месте дома Ипатьева. Посетил он также и духовную столицу Урала — Верхотурье, побывал в Свято-Николаевском Верхотурском монастыре, где почивают мощи святого праведного Симеона Верхотурского. Освятил он и бронзовую статую архангела Михаила, отлитую рабочими Уралмаша и установленную напротив храма Рождества Христова в Екатеринбурге.
В ноябре Святейший руководил Международным миротворческим форумом, собравшимся в московском Свято-Даниловом монастыре, а также трёхсторонней встречей с Католикосом всех армян Гарегином II и духовным лидером мусульман Азербайджана и Кавказа Шейх-уль-исламом Аллах-шукюром Паша-заде, на которой вырабатывались пути урегулирования многолетнего армяно-азербайджанского конфликта. То, что не под силу было политическим руководителям, взяли на себя религиозные предстоятели.
15 декабря в зале Церковных Соборов кафедрального соборного храма Христа Спасителя состоялось юбилейное заседание Епархиального собрания города Москвы. Патриарх Алексий II выступил на нём с большой речью, в целом повторяющей всё то, что он провозглашал на юбилейном Архиерейском Соборе в августе. Огласил статистику, согласно которой к концу 2000 года Русская Православная Церковь имела 130 епархий, её епископат насчитывал 153 архиерея. Количество монастырей достигло 545, из них 265 мужских и 280 женских, не считая 150 монастырских подворий. Общее число приходов (не считая находящихся на Украине) — 19 417, на них служат 15 837 священнослужителей. В Москве количество монастырей практически осталось прежним: 4 мужских и 5 женских монастырей. В ведении Патриарха находились также 24 ставропигиальных монастыря. На конец 2000 года общее количество духовных школ составило 95, в том числе 5 духовных академий, 29 семинарий, 40 духовных училищ, 1 богословский институт, 2 православных университета, 8 подготовительных пастырских курсов (не считая имеющихся на Украине), 2 епархиальных женских духовных училища, 8 школ катехизаторов. Кроме того, имелись регентские и иконописные школы и отделения, а также множество церковно-приходских воскресных школ. В Москве находилось 519 православных храмов и часовен. Богослужения совершались в 410 храмах, не считая 45 часовен и 18 монастырских храмов; в 39 храмах богослужения ещё не были возобновлены; 35 храмов не были освобождены от прежних арендаторов. Всего в непосредственном ведении Патриарха находилось 590 храмов.
Возвращая утраченное и обновляясь, Русская Православная Церковь вступила в XXI век и в третье тысячелетие от Рождества Христова.
«Я ВИЖУ ПРИЗНАКИ ДУХОВНОГО ОБНОВЛЕНИЯ...»
2001
Конечно же, отметив год назад вступление в новое тысячелетие, человечество признало, что оно начинается не в 2000 году, а в 2001-м — чтобы можно было ещё раз отпраздновать столь громкую дату. И Церковь не стала спорить с человечеством.
Начало года ознаменовалось особым событием. Такого никто не мог припомнить! Власть России осыпала представителей Церкви целым дождём государственных наград. 16 января в Екатерининском зале Кремля президент Путин вручил ордена Почёта и Дружбы целому ряду архиереев, священников и мирян. Причём Патриарх Алексий заранее попросил Владимира Владимировича его самого не награждать, и Путин лишь отметил большой вклад Предстоятеля в духовное и нравственное возрождение России и укрепление гражданского мира.