Учитывая недовольство на Украине, царское правительство в «Глуховских статьях» уменьшило количество воевод, а вместе с тем разрешило иметь гетману наемное войско, которое предназначалось для борьбы против крестьянских восстаний. Столица казачья была перенесена в Батурин. Новый гетман, правивший 4 года, не ладил со старшиной, но царское правительство его поддерживало, тем более что он оказал ему большие услуги при подавлении восстания Степана Разина, которое охватило значительную часть Слободской Украины.
Имея против себя два сильных государства, Петр Дорошенко позвал на помощь турок на следующих условиях:
«Запорожское войско обязывается воевать с врагами Блистательной Порты.
Порта взаимно обязана вспомоществовать Запорожскому войску: крымскими, ногайскими, буджакскими и другими татарами.
Гетман получит от султана знамя и булаву.
Запорожцы имеют быть свободны от всяких податей и налогов, и предводитель их Петр Дорошенко да сохранит по свою смерть гетманское достоинство.
Вспомогательное турецкое или татарское войско не должно разорять Божии храмы и казацкие имения, также брать в плен тамошних жителей.
Духовенство имеет быть под управлением своего митрополита. Оттоманская Порта и хан крымский без согласия и предварительного сношения с гетманом и войском Запорожским да не приступят к миру и не начнут брани с королем польским и царем московским.
Когда Запорожское войско, с помощью турецкою овладеет каким-либо городом или местечком, оные имеют оставаться за гетманом и войском Запорожским».
В конце концов, Москва не отдала Киев Польше, а П. Дорошенко был вынужден скрывать свой договор с Турцией от народа. В 1671 году турецкий султан Магомет IV со стотысячной армией и пятнадцатитысячный корпус П. Дорошенко пошли на Польшу. Турки взяли Каменец-Подольский, а казаки Дорошенко с татарами выгнали польские отряды из Правобережья. 7 октября 1672 года был подписан Бучачский договор, по которому Правобережье переходило к Турции и Дорошенко. Подолия и часть Галичины фактически стали турецкой провинцией. Турки переделывали храмы в мечети, грабили население, брали пленных и уводили к себе. Народ обвинял Дорошенко в обеих бедах, союз с «ненавистными басурманами» уничтожил популярность гетмана и лишил его поддержки народа. Границей Украины он обозначал Перемышль и Ярослав; когда-то до них доходила «держава русская и этих границ тоже должна достичь украинская держава». Его лозунгом стало объединение всех украинских земель, «целостность Отчизны». Он не верил ни Польши, ни Турции, но союз с Турцией и крымскими татарами был главной ошибкой П. Дорошенко. Он хорошо знал украинский народ, «хотя Божьей волей украинцы обеих сторон Днепра раздвоены и считают себя врагами, однако никто чужой нам не поможет, как мы сами себе, друзья». П. Дорошенко опирался в основном на наемное войско сердюков, которых набрал около 20 ООО.
В 1672 году казацкая старшина, ложно обвинив в измене, схватила Д. Многогрешного и отправила его в Москву, из которой он с семьей был сослан в Сибирь.
После ареста Д. Многогрешного в Москву выехал Иван Лысенко, делегат взбунтовавшейся Украины, который вез с собой новые украино-московские «статьи», в которых сама старшина просила Москву ограничить самостоятельность гетмана, в частности, его судебную власть и устранить от выборов гетмана «казацкую чернь и поспольство». Москва сразу согласилась с этим и послала в Батурин боярина Григория Ромодановского, для проведения выборов нового гетмана и подписания новых статей. Выборы гетмана прошли в 1673 году под Конотопом. «Конотопские статьи» были приняты, а гетманом вместо «мужичьего сына» Многогрешного стал «попович» и бывший войсковой судья Иван Самойлович, организатор интриги против бывшего гетмана.
В это время в Польше умер король, и русско-казацкие войска пошли на Правобережье, Самойлович и Ромодановский дошли до столицы Дорошенко Чигирина, но были отброшены с помощью турок и татар. На Правобережье началась резня, оно «обратилось в пустыню, засеянную людскими костями, наполненную развалинами и пожарищами». Убивали все: поляки с новым королем Яном Собесским, турки, крымские татары, казаки П. Дорошенко, московские войска и полки Левобережья.
Турки были разбиты под Хотином поляками. На Правобережье пошли Самойлович и Ромодановский.