Как свидетельствует начальник Северной экспедиции Петр Татаринцев, лагерные пункты (он называет их рабочими городками) протянулись вдоль линии будущей трассы до реки Лонгот — Юган. Параллельно велось и строительство временной автодороги. С потеплением начались работы по возведению земляного полотна в местах, где имелись резервы оттаявшего песка и супесей. Были произведены подготовительные работы к строительству моста через реку Харбей.
В конце мая по первой воде из Лабытнаног к причалу на реке Щучья (120 км от станции Обская) было отправлено второе строительное отделение. Караван двигался сначала по Оби, а затем по реке Щучья до места назначения. В районе высадки строители-заключенные увидели многочисленные песчаные холмы — дюны, в которых и вырыли большое количество удобных и теплых землянок. Обустройством базы в районе планируемого перехода через реку Щучья практически исчерпывалась в 1948 г. деятельность второго строительного отделения Обского управления. Кроме обустройства базы строители отсыпали опытную трассу по оси планируемой железной дороги из местных песков длиной около километра.
Значительные трудности выпали в 1948 г. на долю Байдарацкого лагеря Северного управления. База лагеря первоначально находилась в городе Салехарде, там же шло и формирование строительных отделений для их переброски на побережье Обской губы. С открытием в июне 1948 г. навигации началось перебазирование людей, техники и материалов в Новый Порт. Отсутствие достаточного количества судов, частые штормы в Обской губе и мелководье прибрежной полосы максимально усложнили и без того непростую задачу по переброске сотен людей, техники, материалов и продовольствия.
Прибыв в Новый Порт, строители первым делом потеснили местные организации, разместив в немногочисленных зданиях поселка штаб строительства, вспомогательные подразделения и склады. Заключенные, как обычно, отстроили себе жилье в откосах песчаных дюн. Землянки вышли такие же удобные и теплые, как и в лагерях возле реки Щучья.
Летом-осенью заключенные Байдарацкого лагеря сумели сделать немногое: возвели склады для прибывших грузов, построили в Новом Порту грунтовые дороги, отремонтировали причал.
Самая нелегкая доля выпала летом 1948 г. на Портовое управление. Выдвижение в район Мыса Каменного оказалось еще более сложным, чем перебазирование в Новый Порт. Обская губа в районе Мыса Каменного вскрылась только в июле, а значит, навигация сократилась еще на месяц. Лихтеры и самоходные баржи стали прибывать в первых числах августа. Руководящий состав управления и инженерно-технические работники перебрасывались на Мыс Каменный самолетами Северной экспедиции. Заключенные плыли в трюмах барж.
Третье из строительных управлений, призванное выполнить задание партии и правительства, действительно оказалось выброшено на пустынный берег. На Мысе Каменном не было ничего: ни поселка, ни причала, ни даже песчаных дюн. Строителей здесь ждал голый берег, заболоченная тундра, подступающая к самой воде. В таких условиях не оставалось никаких надежд даже на землянки. Рейс первого лихтера к расположению будущего порта оказался неудачен: к берегу судно подойти не смогло из-за мелководья, село на мель во время шторма, а потом и вовсе затонуло.
Остальные рейсы транспортов к побережью полуострова Ямал оказались более продуктивными. За навигацию 1948 г. на Мысе Каменном удалось создать определенный запас строительных материалов, техники и продовольствия, хотя условия их разгрузки были такими же тяжелыми.
В то же время возникшие с транспортировкой грузов водным путем трудности были тщательно изучены и получили должную оценку. Проектировщики к концу 1948 г. стали склоняться к мысли, что крупный морской порт, который смог бы принимать корабли океанского класса, а тем самым стать базой для подводных лодок, на Мысе Каменном построить нельзя.
Причин было несколько, но самая главная — Обская губа в районе п. Мыс Каменный оказалась мелководной. Это исключало возможность прокладки стабильного фарватера: мелкий песок и ил быстро меняли рельеф дна. Гидрографические исследования подтвердили предположения проектировщиков — для обустройства порта неминуемо потребовались бы колоссальные работы по углублению дна, которые в долгосрочной перспективе все равно не гарантировали бы устойчивую безопасность плавания в акватории порта и на подходах к нему.
Несмотря на столь неблагоприятный прогноз, в предполагаемых районах расположения железнодорожных станций на полуострове Ямал — Яр-Сале, Новый Порт и Мыс Каменный — в течение 1947–1948 гг. обустраиваются несколько лагерных пунктов, размещается контингент заключенных, завозятся различные материалы и продовольствие.