Из 27 самолетов второй партии 13 поступило в 462-ю эскадрилью и по семь - в 461-ю и 466-ю. Последняя в 1978 г. была передислоцирована в Церклье, откуда действовала совместно с 467-й эскадрильей. Помимо боевой подготовки, летом 1978 г. самолеты J-20 привлекались для участия в съемках художественного фильма «Партизанская эскадрилья», посвященного событиям Второй мировой войны. В нем «Крагуй» изображали югославские самолеты, а SOKO 522 - немецкие. Съемки велись с огромным для условий Югославии размахом - в частности, в одной из сцен для реалистичности изображения налета партизанских самолетов на немецкий аэродром на земле была сожжена целая эскадрилья списанных SOKO 522.
Служба «Крагуев» в большинстве легких боевых эскадрилий продолжалась до начала 80-х гг.: в 1981 г. сними распрощалась461-я эскадрилья, а в 1982 г. - 460-я, 466-я и 467-я. На смену «партизанским» самолетам пришли вертолеты HN-42M («Газели», строившиеся в Югославии по лицензии).
Все «Крагуи» были сосредоточены в 462-й эскадрилье, продолжавшей подготовку резервистов. В середине 80-х гг. были списаны последние J-20 первой серии, но и так 462-я эскадрилья имела сверхкомплект, располагая 24-25 «Крагуями». Среднегодовой налет на одну машину составлял 70 часов.
Осенью 1988 г. состоялся последний выпуск SROA на «Крагуях» - теперь офицеров резерва готовили на реактивных самолетах G-2 «Галеб». 462-ю эскадрилью расформировали, а J-20 передали 399-й резервной эскадрилье в Тузле. Но и там они задержались недолго - ВВС и ПВО Югославской народной армии уже не нуждались в этих самолетах. Поэтому «Крагуи» попали в эскадрильи Территориальной обороны (ТО) - своеобразного аналога американской Национальной гвардии. В отличие от ЮНА, подчинявшейся союзному правительству, части ТО находились в ведении министерств обороны республик. Авиационные эскадрильи ТО в угрожаемый период предполагалось комплектовать легкими самолетами, взятыми, главным образом, из аэроклубов. Теперь же две из них получили «настоящие» штурмовики: 12 J-20 передали эскадрилье ТО Словении (аэродром Брник), а 11 - Черногории (Титоград, нынешняя Подгорица).
Мирная служба «Крагуев» в Территориальной обороне продолжалась недолго. В 1990 г. резко обострились отношения между союзным правительством и властями Словении. В воздухе запахло порохом, и 14 мая был отдан приказ частям Югославской народной армии разоружить формирования словенской ТО. Это касалось и авиационной эскадрильи. Однако о добровольной сдаче самолетов не могло быть и речи - аэродром Брник находился под контролем частей ТО. Поэтому пришлось организовать дерзкую спецоперацию. Шесть пилотов из 252-й эскадрильи, летавшей на реактивных «Ястребах», 10-13 июня 1990 г. прошли ускоренное переучивание на J-20 на базе черногорской эскадрильи ТО. 20 июня на аэродроме Брник приземлилась пара вертолетов Ми-8, доставивших этих пилотов, а также группу бойцов 63-й парашютно-десантной бригады. Под прикрытием последних, летчики завели моторы шестерки «Крагуев», благополучно взлетели и перегнали самолеты на аэродром Церкпье, находившийся под контролем союзных войск. В руках последних оказалась и вторая шестерка словенских «Крагуев», но когда и при каких обстоятельствах - неизвестно.
23 июня «Крагуи» из Церклье перелетели в Бихач, а затем - в Тузлу, и, наконец, в Батайницу. Там их включили в 252-ю эскадрилью, но в боевой состав не вводили - эскадрилья летала на более современных реактивных машинах. Несколько J-20 передали для усиления эскадрильи ТО Черногории, летом-осенью 1991 г. активно участвовавшей в боевых действиях. В частности, она обеспечивала поддержку войск 2-й оперативной группы в ходе обороны от хорватских войск полуострова Превлака (у входа в бухту Бока Которская), а затем - в ходе наступления к Дубровнику. Ежедневно на боевые задания вылетало до четырех J-20. 2 октября 1991 г. была потеряна машинасс/н 30141, по ошибке сбитая у села Гунйине зенитчиками черногорской Территориальной обороны. По состоянию на конец 1991 г. ВВС и ПВО располагало 18 J-20, из них в исправном состоянии находилось всего семь машин. Их общий налет составил 95 часов.
К началу 1992 г. Югославская армия, лишившаяся эпитета «народная», была сосредоточена на территории новой Союзной республики Югославии, объединявшей Сербию и Черногорию. Имевшиеся «Крагуи» получили новые опознавательные знаки и были распределены между 252-й эскадрильей (11 самолетов) и 172-й авиабригадой, дислоцировавшейся в Подгорице (семь машин). В течение 1992 г. самолеты этого типа совершили 33 вылета, проведя в воздухе в общей сложности менее 10 часов.