Единственный корабль обслуживания больших летающих лодок специальной постройки японского флота был спущен на воду 25 июля 1941 г. на верфи Кавасаки в Кобэ. 29 апреля 1942 г. «Акицусима» вошла в строй и была приписана к ВМБ Йокосука. В тот же день в должность командира корабля вступил капитан 1-го ранга Маюдзуми Харуо. При этом с 1 мая 1942 г. корабль вошёл в состав 25-й воздушной флотилии 11-го воздушного флота. Его задачей в составе этого соединения было обеспечение действий больших летающих лодок-разведчиков из состава авиагруппы авиации флота «Йокогама» (1 ноября 1942 г. переименована в 801-ю авиагруппу).
15 мая корабль вышел из Йокосука в Рабаул, где располагался штаб флотилии. По дороге он доставил припасы на остров Сайпан. Прибыв в Рабаул 24-го числа, «Акицусима» стояла там до 7 августа 1942 г., когда ей выпала честь выйти в свой первый боевой поход для обеспечения операции японского флота против американских сил, высадившихся на острова Гуадалканал и Флорида.
Вопреки популярному мифу о том, что японские адмиралы своих подчинённых за людей не считали и не заботились об их спасении, даже если это были элитные лётчики морской авиации, первый боевой поход «Акицусима» имел только одну цель - спасение экипажей самолётов. Особую важность этой задаче придавал тот факт, что задействованные в атаке американских кораблей у Гуадалканала пикировщики D3A1 из состава базировавшейся на Рабаул 2-й авиагруппы авиации флота не имели запаса топлива, достаточного для возвращения в Рабаул после атаки Гуадалканала. Более того - опасались, что топлива может не хватить даже до используемой японцами якорной стоянки у острова Шортленд (к югу от острова Бугенвиль). Именно поэтому «Акицусима» была отправлена в пролив Гизо между островами Велья-Лавелья и Коломбангара, находившийся почти на полдороге от Гуадалканала до Шортленда. Несмотря на опасность уничтожения корабля американцами, японские командование предпочло рискнуть, но обеспечить спасение лётчиков.
Подобрав всего один экипаж из состава 2-й АГ, 10 августа плавбаза вернулась в Рабаул. Но уже 15-го числа корабль снова отправился в район Соломоновых островов, где с 16 августа по 13 ноября 1942 г. [18 За исключением короткого выхода на расположенный неподалёку о-в Бука (30 августа - 3 сентября).] «Акицусима» обеспечивала действия японской гидроавиации на базе Шортленд. При этом с 25 сентября её перевели в непосредственное подчинение 11-му воздушному флоту, командовавшему всеми силами морской авиации на Соломоновых островах. Скорее всего, причина заключалась в том, что он был единственным кораблём обеспечения авиации специальной постройки.
13 ноября 1942 г. корабль отправился на докование в Йокосука, куда прибыл 12 декабря. По дороге во время стоянки в Рабауле (14 ноября - 4 декабря) в должность командира корабля вступил капитан 1-го ранга Такао Ёсими. Пройдя докование (23-30 декабря), корабль оставался в Японии до 15 января 1943 г., когда снова отправился на базу Шортленд (прибыл 28 января), по дороге завезя самолёты и личный состав в Кавиенг и Рабаул.
Но на базе Шортленд «Акицусима» не пробыла и месяца - уже 21 февраля 1943 г. она отправилась к японским Мандатным островам, перевозя базовое имущество 201-й истребительной авиагруппы, личный состав которой был отправлен в Японию на переформирование. После этого с марта по июнь 1943 г. корабль находился на атоллах Джалуит и Макин, обеспечивая действия больших летающих лодок-разведчиков 802-й авиагруппы. 6 июня «Акицусима» покинула Джалуит и отправилась в Йокосука (прибыла 25 июня), но не прямо, а с заходом на Шортленд и в Рабаул.
По прибытии в Японию корабль ожидало новое задание - он должен был обеспечивать действия летающих лодок 801-й авиагруппы в операции по эвакуации гарнизона с острова Кыска. Быстро погрузив на борт имущество авиагруппы, 30 июня 1943 г. «Акицусима» покинула Йокосука и уже 6 июля прибыла в залив Касивабара (ныне - Северо-Курильский) на острове Парамушир. При этом по дороге корабль на сутки (2-3 июля) зашёл в Хакодатэ.
«Акицусима» обеспечивала действия 801-й авиагруппы на алеутском направлении до 29 августа 1943 г., когда корабль повёз имущество авиагруппы обратно в Йокосука (прибыл 2 сентября). Там в командование кораблём наконец смог вступить капитан 1-го ранга Фудзимаки Ёсинори, назначенный ещё 26 августа.