Новому командиру и его экипажу быстро нашлась работа: Япония в срочном порядке усиливала гарнизоны на Мандатных островах, используя для перевозки подкреплений любые подходящие корабли. В результате «Акицусима» уже через две недели после возвращения с Парамушира отправилась из Йокосука в Шанхай (вышла 16-го, а прибыла 20 сентября 1943 г.), где приняла на борт армейские части, предназначенные для перевозки на Трук (покинула Шанхай 24 сентября, прибыла на Трук 2 октября). 14 октября корабль вышел с Трука и 21 октября пришёл в Йокосука, откуда 3 декабря снова вышел к Труку. При этом в ноябре 1943 г. корабль переходил из Йокосука в соседний порт Йокогама для докования (10-23 ноября).
«Акицусима» прибыла на Трук 9 декабря 1943 г. и отстаивалась на атолле целых два месяца. Только в начале февраля 1944 г. корабль сделал два транспортных рейса с армейскими подразделениями на остров Понапе.
Во время атаки Трука американской авианосной авиацией (с авианосцев 58-го оперативного соединения) 17 и 18 февраля 1944 г. «Акицусима» была повреждёна. 17 февраля около 03.20 в корабль попали две 454-кг бомбы, сброшенные самолётами с авианосца «Энтерпрайз»: одна поразила корабль перед мостиком, а вторая попала в кормовую оконечность, повредив кран для погрузки самолётов. На следующий день в центральную часть корабля попала ещё одна бомба, вызвавшая сильный пожар.
Впрочем, повреждения не сказались на способности корабля передвигаться и 18 февраля «Акицусима» смогла выйти с Трука на остров Мерейон, перевозя флотский 68-й охранный отряд. Прибыв на Мерейон на следующий день, уже через 3 дня «Акицусима» отправилась в Японию, куда и прибыла 14 марта (в Йокосука; с заходом на Палау и Сай-пан). При этом на самом опасном участке - от Мерейона до Палау - плавучую базу прикрывал эсминец «Харусамэ».
«Акицусима» не покидала вод метрополии до сентября 1944 г. За это время она успела пройти две модернизации, дважды пройти докование и дважды сменить подчинение (с 4 марта - придана 14-му воздушному флоту (скорее всего, в ожидании генерального сражения в центральной части Тихого океана, которая была зоной ответственности этого воздушного флота), с 18 июля - напрямую Объединённому флоту).
5 сентября 1944 г. «Акицусима» вышла из Сасэбо и отправилась в порт Модзи, который она покинула утром 8 сентября в составе конвоя «ХИ-75». 13 сентября конвой прибыл в Такао, который покинул на следующий день, направляясь в Сингапур. 17 сентября «Акицусима» и транспорт «Сайгон-мару» отделились от конвоя и направились в Манилу под эскортом 30-го дивизиона эсминцев («Юдзуки» и «Удзуки»). Правда эскорт не помог защитить конвой от атаки американской подлодки, потопившей «Сайгон-мару» утром 18 сентября недалеко от Манилы. «Акицусима» посчастливилось не нарваться на американскую торпеду и добраться до Манилы без повреждений. Более того: корабль смог пережить без повреждений и мощный налёт на Манилу американской палубной авиации (38-е оперативное соединение), состоявшийся 21 сентября. Но японское командование решило не искушать судьбу, и в тот же день «Акицусима» отправилась на якорную стоянку в бухте Корон, находившуюся в центральной части Филиппинских островов между островами Бусуанга и Кулион.