Лётчики полка в сентябре месяце также проводили успешные полёты на разведку. Особенно отличился на этом поприще зам. командира 2-й АЭ ст. л-т Птицын А.И., который выполнил 8 успешных вылетов на разведку 21, 25, 26, 27, 28 (2 вылета), 29 и 30 сентября. Командир звена л-т Лякишев А.Ф. выполнил 6 успешных вылетов на разведку, ст. летчик л-т Возный А.М. - 7. По два успешных вылета на разведку имели л-нт Прокопович Э.И. и мл. л-нт Нырков М.А.
В итоге за сентябрь месяц полк произвёл 324 боевых вылета (налет 283 ч. 10 мин), из них на прикрытие переправ через р. Висла и боевых переправ в Праге, восточнее и северо-восточнее Праги - 162 вылета (140 ч. 05 мин); на сопровождение бомбардировщиков в район ст. Утрата - 30 вылетов (29 ч. 45 мин); на свободную охоту - 26 вылетов (23 ч. 30 мин); на бомбометание - 44 вылета (43 ч. 45 мин); на разведку войск и техники противника - 62 вылета (46 ч. 05 мин).
Проведено 11 групповых и 1 одиночный воздушный бой. Сбито 7 самолётов: 2 Ju 87, 4 FW 190, 1 Bf 109. Снова отличились лётчиков 1-й АЭ, одержавшие 5 воздушных побед.
Боевые потери полка за месяц составили 3 лётчика и 4 самолёта. Кроме того, 28 сентября в авиационной катастрофе погиб мл. л-нт Евсеенко Евгений Никифорович - в воздухе у самолёта разрушился мотор.
2-я АЭ капитана Лисовского с сентября 1944 г. являлась разведывательной эскадрильей дивизии. В течение сентября-октября месяца разведчики 2-й АЭ ежедневно, несмотря на плохую погоду, летали в тыл противника в районы: Радом, Илжа, Островец, Вежбник, Анелин, Тарлув, Солец, неизменно держа под контролем передвижения войск противника, вскрывая интенсивность движения по железным и грунтовым дорогам, а также вскрывая систему обороны перед передним краем. Разведчики производили не только разведку, но и попутное бомбометание по обнаруженным скоплениям войск и отдельным объектам противника, уничтожив до 30 автомашин, до роты солдат противника, 2 паровоза и до 15 вагонов.
К 1 октября полк имел в своём составе 36 боевых экипажей, готовых к выполнению боевых заданий в составе пары, четвёрки и группами до АЭ включительно. В начале октября на фронте наступило затишье, число боевых вылетов резко снизилось, изредка лётчики полка летали только на воздушную разведку. Так, 13 октября пара ст. л-та Птицина А.И., проводя воздушную разведку в районе Зволень, обнаружила скопление войск и техники противника, о чём ведущий немедленно передал по радио. Тут наши разведчики были атакованы группой FW 190. В ходе этого боя был подбит самолёт ст. л-та Птицина - самолёт получил 40 пробоин, был повреждён руль поворота и руль высоты. Несмотря на повреждения, наш лётчик довёл израненную машину до своего аэродрома и произвёл посадку.
Для отражения атак противника на плацдарме в районе Пултуска, где был захвачен плацдарм на западном берегу реки Нарев, с 4 по 14 октября в условиях ограниченно летной погоды 16-я воздушная армия произвела 1100 самолето-вылетов.
Активная фаза боёв в октябре месяце наступила 14 октября. В этот день истребительная авиация 16-й ВА прикрывала свои войска и наносила удары по аэродромам вражеской авиации.
На рассвете 14 октября командир 6-го ИАК генерал И.М. Дзусов по приказу командарма организовал налет истребителей на аэродром Модлин, где было обнаружено до 35 самолетов противника. В воздух были подняты три шестерки 352-го ИАП под командованием капитанов Б.Г. Деева, И.Е. Лисовского и лейтенанта В.К. Корзуна. По докладу экипажей, на аэродроме сгорело 11 самолетов противника (по другим данным, было уничтожено на земле 5 самолетов, 7 повреждено и уничтожено 3 зенитных орудия). При выполнении этого боевого задания зенитным огнём был сбит самолёт л-та Возного Анатолия Марковича из 3-й АЭ. Ему удалось покинуть горящий самолёт, но приземлился он на территории противника и пропал без вести (погиб).
На следующий день группа из 16 Р-39 под командованием зам. к-ра АП капитана Елисеева Г.К. произвела повторный налёт на аэродром противника Модлин, где находилось ещё более 20 самолётов противника. В результате удара был сожжен склад ГСМ и уничтожено 4 самолёта противника, повреждена бетонная ВПП. В итоге аэродром Модлин был очищен от немецкой авиации.
После этого наступила жаркая пора для лётчиков полка, которые выполняли в день по несколько боевых вылетов, в основном на сопровождение бомбардировщиков и воздушную разведку. Так, 24 октября, выполняя боевое задание по сопровождению 8 наших бомбардировщиков в район Н1аревского плацдарма, капитан Деев, будучи ведущим шестерки наших истребителей, в районе цели встретил 8 FW 190, которые попытались атаковать наши бомбардировщики. Капитан Деев тут же атаковал вражеские истребители противника и в 15-минутном воздушном бою сбил один "фоккер". Все наши бомбардировщики, выполнив свою боевую задачу, благополучно вернулись на свой аэродром.