С 13 июня началось развертывание военно-морских сил противника. На первом его этапе полностью подготовленные к минным постановкам в устье Финского залива корабли перешли в базы Финляндии, где находились вплоть до вечера 21 июня, соблюдая все меры маскировки и предосторожности. Непосредственно перед нападением развертывание произвели корабли, базировавшиеся на немецкие порты в южной части театра. В 11:53 (здесь и далее время - московское) 21 июня был получен сигнал, что нападение на СССР произойдет в ближайшую ночь в 03:30 утра. В 14:28 корабельные соединения приняли сигнал, подтверждавший необходимость установки всех ранее запланированных минных заграждений.
Опишем все постановки, выполненные в рамках операции, последовательно - с востока на запад и с севера на юг.
Между 03:37 и 03:55 19 самолетов Ju-88 из группы KFGr 806 сбросило 19 бомб-мин ВМ1000 в районе Кронштадта: три в Ленинградском морском канале и 16 в западной части внешнего рейда в районе банки Олега.[* В различной исторической литературе часто указывается неверное число мин - 16 или 28.] Вылет самолетов осуществлялся с аэродрома Проверен в Восточной Пруссии, посадка для дозаправки после постановки - на финском аэродроме Утти. В налете принимал участие финский офицер связи при штабе 1-го Воздушного флота Германии капитан Поли Эрви. После дозаправки бомбардировщики вылетели в направлении Восточной Пруссии, где без потерь приземлились в утренние часы.
Несмотря на то, что с 02:40 Кронштадская ВМБ считалась перешедшей на боевую готовность №1, о чем ее командир контр-адмирал Иванов доложил в штаб флота, воздушная тревога во время налета не объявлялась, а зенитный огонь был открыт лишь вслед последней группе самолетов-заградителей. В связи с полным отсутствием противодействия, один из немецких летчиков обстрелял пулеметным огнем входивший на Красногорский рейд транспорт «Луга». В надстройке судна насчитали 20 пулевых пробоин, ранение получил второй помощник капитана.
Вопреки написанному в послевоенной литературе и мемуарах, цель налета сразу установлена не была. Сброшенные самолетами боеприпасы были классифицированы как торпеды, о минной постановке говорилось лишь в предположительном ключе, к тому же ее район ограничивался банкой Олега и Толбухиным маяком. Когда в 11:30 на выходе из морского канала на мине подорвался эстонский транспорт «Рухно» командование базы посчитало причиной взрыва диверсию со стороны членов экипажа, которые таким образом, якобы, попытались заблокировать канал. 30 июня транспорт был поднят и специально обследован на предмет причин взрыва, что явно говорит о том, что даже спустя неделю после начала войны в наших штабах не знали, что противник ставит неконтактные мины с самолетов. В июле на этой минной постановке (в ночь на 23 июня она была дополнена еще 13 минами ВМ-1000, при этом немцы потеряли два самолета и один экипаж) погиб тральщик, в августе - плавучая мастерская.
Между 07:38 и 10:25 22 июня финские подлодки «Ветехинен», «Ику-Турсо» и «Весихииси» выставили три минных заграждения по 20 мин в советских территориальных водах между островом Мохни и бухтой Кунда. Все они имели своей целью нанесение потерь кораблям и судам, которые с начала войны должны были начать плавание по прибрежному фарватеру. Что бы ни писали финские историки в своей послевоенной литературе о «параллельной войне» (якобы Финляндия воевала против СССР не под немецким руководством, а самостоятельно, параллельно с немцами), фактический замысел этих постановок исходил из неосуществленных немецких планов постановок «Рудольшатдт» и «Гера», которые планировалось осуществить силами двух немецких субмарин. Правда, с учетом того, что немецкие субмарины должны были ставить донные неконтактные мины, а финские ставили якорные гальваноударные, районы заграждений были скорректированы и перенесены от островов Лавенсари и Сескар к побережью Эстонии.
Хотя сами постановки были осуществлены финнами скрытно, плохое качество шведских мин типа S/36 привело к тому, что все три заграждения были обнаружены по всплывшим минам в ближайшие дни. Тем не менее, из-за неудовлетворительной организации движения судов и траления, на этих минах подорвались три транспорта (один затонул, один выбросился на отмель и был позже разрушен торпедами германских «шнелльботов», третий смог после заделки пробоин уйти в Ленинград). Лишь к середине июля два из трех заграждений были полностью вытралены, третье же сохранялось до окончания использования нашей стороной прибрежного фарватера в начале августа.