Вскоре значимость этого фактора возросла для Исламабада многократно. В конце марта в Восточном Пакистане разразилась настоящая гражданская война. Фактически ее спровоцировало правительство страны, не признавшее итоги парламентских выборов, на которых победила партия «Авами Лиг» и ее руководитель шейх Муджибур Рахман. Он был арестован, регулярная армия и полувоенные формирования т.н. «раззакаров» развязали необузданный террор против «восточников» вообще и сторонников «Лиги» – в частности. В ответ началось вооруженное сопротивление повстанческих и партизанских отрядов бенгальцев, получивших название «Мукти Бахини». Для борьбы с ними пакистанская армия стала использовать танки и авиацию. Например, города Силхет, Рангпур, Раджшахи, Пабна, Ишрухи правительственные войска захватили после ожесточенных боев и многократных бомбардировок с воздуха.
За март-апрель 1971 г. «Сейбры» из 14-й эскадрильи, а также прикомандированные к ней разведчики RT-33 и вертолеты Aluette III совершили около 170 боевых вылетов. Кроме того, были вооружены и брошены в бой аэроклубовские «поршневики», такие как Pilatus РС-3. Существенный объем работы выполнила BTA. Пожалуй, наиболее заметным стало участие 3 и 8 апреля двух «Геркулесов» в операциях по освобождению от сил «Мукти Бахини» аэродромов Лал-Мунирхат и Силхет, ВПП которых повстанцы забросали бревнами, чтобы не позволить самолетам приземлиться. Однако в обоих случаях оставшихся свободных участков оказалось достаточно, чтобы летчики одного С-130 смогли посадить свою машину, после чего высадившиеся десантники под огнем разбирали завалы, и второй «Геркулес» садился уже на расчищенную полосу.
18 апреля Исламабад заявил, что основные очаги сопротивления подавлены. Мирное население, спасаясь от репрессий, устремилось в Индию, и вскоре число беженцев достигло 10 млн. человек. Содержание этих «гостей» ложилось тяжким бременем на экономику страны, и волей-неволей Дели начал втягиваться во внутрипакистанский конфликт. Единственный путь решения проблемы виделся в оказании военной помощи бенгальцам, а затем – в непосредственном силовом вмешательстве, разгроме местной группировки пакистанских войск и создании независимой республики Бангладеш с дружественным режимом. В приграничных районах Индии, где находились лагеря беженцев, начали действовать военно-тренировочные лагеря для подготовки партизан «Мукти- Бахини». Достаточно быстро были созданы весьма боеспособные формирования, в состав которых вошло и авиационное крыло. Надо сказать, что в ВВС Пакистана (PAF) насчитывалось до 30% бенгальцев. После начала гражданской войны среди них нашлось немало сторонников независимости, и 645 авиаспециалистов, в т.ч. около 20 летчиков, ушли к повстанцам. Вскоре появилась и первая матчасть – приобретенные на «черном рынке» «Оттер», «Дакота» и два «Апуэтт-Ш». Сначала их использовали для связи между лагерями на индийской территории и занятыми партизанами районами в Восточном Пакистане, а затем начали готовить к боевой работе, для чего оснастили внешними узлами подвески НАР и мелких бомб, а также стрелково-пушечным вооружением.
С каждым днем напряженность нарастала. Бойцы «Мукти-Бахини» с территории Индии совершали вылазки в Восточный Пакистан и возвращались обратно. Преследовавшие их пакистанцы все чаще стали пересекать границу, а также принялись обстреливать из орудий предполагаемые места расположения лагерей повстанцев на сопредельной территории. Индийский «бог войны» отвечал. Апофеозом приграничных инцидентов стали события двух ноябрьских дней. 21 числа пакистанские войска при поддержке легких танков М-24 атаковали небольшие силы «Мукти- Бахини» в районе деревни Бойра. На помощь бенгальцам пришел индийский пехотный батальон, усиленный плавающими танками ПТ-76. Пакистанцы запросили помощи у авиации. По индийской версии, 22 ноября над полем боя появилась четверка «Сейбров», наперехват которой поднялось звено «Нэтов» из 24-й эскадрильи. Индийцы атаковали решительно и сразу же сбили три самолета. Победы одержали флайт-лейтенанты Р. Месси и М. Ганапати, а также флаинг-офицер Д. Лазарус. Один «Сейбр» упал на своей территории, два других – на индийской. Там же приземлились катапультировавшиеся летчики – флайт-лейтенант П. Куреши и флаинг-офицер X. Ахмед. Согласно пакистанской версии, в инциденте участвовала тройка «Сейбров» из 14-й эскадрильи, которая штурмовала позиции противника в районе деревни Чаугхача. Когда это звено готовилось выполнить четвертый заход, внезапно появилась пара «Нэтов», занявшая позицию за машиной ведущего А. Чодри. Однако он не только мастерски увернулся из-под удара, но зашел в хвост одному «Нэту» и сбил его. Тут подошли еще два истребителя противника. Чодри приказал ведомым немедленно уходить, но было поздно: индийцы уже заняли очень выгодные позиции и быстро их сбили. При этом катапультировавшийся Ахмед приземлился по свою сторону границы, но бойцы «Мукти-Бахини» захватили его и доставили на индийскую территорию.