Всего из предсерийной двадцатки разбилось 5 машин. Один из таких случаев был заснят и попал в газету Daily Mirror под броским заголовком: «Джордж Эйрд падает в томаты…». 13 сентября 1962 г. летчик Джордж Эйрд (George Aird) совершал облет Р.1 В (борт XG332) после замены двигателей. При заходе на посадку на аэродром Хатфилд самопроизвольно включился форсаж. Пилот решил все же произвести посадку, но после касания ВПП самолет вновь оторвался от земли. Поскольку топлива на второй круг не осталось, то на высоте 45 м Джорджу пришлось катапультироваться. Парашют раскрылся, но при приземлении пилот сломал обе ноги. Самолет рухнул на оранжереи близ аэродрома.
Если во время испытаний P. 1А и первых Р.1 В основные усилия инженеров были направлены на устранение конструктивных недостатков самолета и силовой установки, то на предсерийных машинах главный упор делался на доводку оборудования и вооружения. Поначалу много проблем принес радиолокатор. В ходе испытаний вооружения отрабатывались и наиболее эффективные методы его применения. Точность стрельбы при использовании коллиматорного прицела во время полета с большими перегрузками оставляла желать лучшего. При стрельбе из бортовых пушек летчиков слепило пламя выстрелов, а оборудование страдало от вибраций. Применение УР «Файрстрик» было эффективно лишь на дальностях 1200-8000 м, причем для уверенного поражения цели (заявленная вероятность попадания – 85%) требовался одновременный пуск двух ракет. Выяснилось, что использование НАР по воздушным целям малоэффективно, и контейнер с ними в строю почти не применяли.
29 октября 1959 г. состоялся первый полет серийного «Лайтнинга» F.Mk 1 (ХМ 134), выпущенного на авиазаводе EEC в Семлс- бери. По сути, самолет был идентичен опытным Р.1 В со всеми их недостатками. Каждый последующий F.Mk 1 ввиду массы текущих доработок и «сырой» технологии сборки являлся индивидуальным продуктом со своими специфичными особенностями. Кроме того, при существовавшем запасе топлива самолет годился разве что для защиты пространства вокруг аэродрома. Посему срочным образом пришлось разрабатывать съемную штангу для дозаправки истребителя в воздухе. Ее внедрили, начиная со следующей серийной версии F.Mk 1А. На варианте «А» вместо бортовой КВ-радиостанции использовали УКВ. Внешним отличием этой модификации от предыдущих стали обтекатели жгутов электропроводки, расположенные снизу вдоль фюзеляжа. Всего до 28 июля 1961 г. выпустили 19 F.Mk 1 и 28 F.Mk 1А.
Учебно-боевой вариант «Лайтнинга», имевший вначале обозначение Р.11, стали проектировать еще в октябре 1953 г., однако до апреля 1957 г., когда был подписан контракт на постройку двух опытных «спарок», эти работы велись с низкой интенсивностью. Вскоре Р.11 переименовали в Т.Мк4. В апреле 1958 г. был подписан новый контракт на 20 серийных самолетов. Необычный вид кабины «спарки» вызван двумя факторами. Во-первых, в конце 1950-х гг. в RAF считали оптимальным расположение инструктора рядом с курсантом. Прежде всего, это давало «чувство локтя», так необходимое и обучаемому, и инструктору. По подобной схеме ранее строились учебно-боевые модификации «Вампира» и «Венома», а также удачный реактивный УТС Jet Provost. Вторым фактором, определившим конфигурацию Т.Мк 4, стала компоновка самого «Лайтнинга». Поскольку пилот сидел над воздуховодом, чтобы разместить за ним инструктора, который должен был хоть что-то видеть из своей кабины, потребовалось бы кардинально увеличить высоту фюзеляжа либо существенно удлинить его носовую часть, модифицировав воздуховод сразу за входом из круглого в сечении в уплощенный. Первый вариант был неприемлем по соображениям аэродинамики, а второй – центровки и унификации с уже существующей конструкцией.
Специалисты EEC расположили пилотов рядом, создав очень аккуратного «головастика». За исключением верха носовой части и отсутствия встроенных пушек «спарка» была идентична базовой машине. Первый «Лайтнинг» Т.Мк 4 (XL628) поднялся в воздух 6 мая 1959 г., а уже 1 октября этот самолет был потерян в летном происшествии. В ходе выполнения «бочки» на сверхзвуковой скорости разрушилось вертикальное оперение. Летчик скуадрон-лидер(4*) Дж. Сквайер (Sqn. Ldr. J. Squier) смог благополучно катапультироваться. 21 октября вместо этой машины на испытания вышел борт № XL629. Серийные «спарки» строились уже на основе одноместных F.Mk 1А и могли оснащаться штангой дозаправки в воздухе.