В Советском Узбекистане власть делилась между представителями трех мощных кланов: самаркандским, ферганским и ташкентским. Ш. Рашидов был представителем первого и вот уже на протяжении 24 лет стоял во главе компартии Узбекистана, являя собой уникальное явление подобного рода. Ни в одной союзной республике такого не было. И не случайно столь долгое пребывание Рашидова на высоком посту породило такое количество недоброжелателей его как в самом Узбекистане, так и за его пределами. И главный среди них – Юрий Андропов. И особенно обострились их отношения после событий 1982 года, когда команда Брежнева намеревалась провести на ноябрьском Пленуме ЦК КПСС кардинальные кадровые перестановки. Согласно этим планам, Брежнев должен был отойти от ведения ежедневных дел, став этаким патриархом – занять новый пост Председателя партии. Генеральным секретарём ЦК КПСС должен был стать Владимир Щербицкий, а два мусульманских лидера – Шараф Рашидов (Узбекистан) и Гейдар Алиев (Азербайджан) должны были стать полноправными членами высшего партийного ареопага – Политбюро. Не случайно две свои последние дальние поздки по республикам в 1982 году Брежнев осуществил именно туда – в Узбекистан (март) и Азербайджан (сентябрь).
В планах Брежнева было отдать Рашидову афганское направление (для скорого вывода советских войск из Афганистана), а Алиеву – иранское (для нормализации отношений с Ираном). Но когда Брежнев внезапно скончался, Андропов и Ко эти планы отменили. После чего надо было нейтрализовать опасных соперников. Поэтому Алиева перевели из Баку в Москву (под присмотр Андропова) и ввели в Политбюро, бросив на хозяйственные дела. А Рашидову предложили подать в отставку, но он отказался, надеясь на то, что в Москве у него найдутся сторонники. И они действительно нашлись в лице членов команды Брежнева – Черненко, Тихонова и др. Вот почему против Рашидова было затеяно «узбекское дело». Пользуясь поддержкой ферганского и ташкентского кланов, Андропов и Ко в конце апреля 1983 года начали в Узбекистане первые чистки в среде самаркандцев и их союзников – бухарцев. В итоге первой должна была «пасть» Бухара. 27 апреля 1983 года (когда Рашидов находился с официальным визитом в Афганистане) на пыльной дороге в райцентр Ромитан в своей служебной «волге» был арестован начальник областного ОБХСС Ахат Музаффаров. За несколько минут до этого некая Турсуна Адиева («подсадная утка») передала ему в здании областного УВД взятку в размере 1000 рублей за содействие в деле освобождения одного осужденного. Перед этим бдительная Адиева побывала в областном КГБ и возмутилась порядками, царившими в бухарской милиции, когда даже начальник ОБХСС открыто вымогает у посетителей взятки. Чекисты внимательно отнеслись к заявлению женщины и предложили ей взятку Музаффарову дать. А о дальнейшем ходе событий обещали позаботиться. И позаботились. Музаффаров был арестован. Вскоре, по его рассказам, начали арестовывать и других высокопоставленных взяточников Бухары и области. Так, уже в начале мая 1983 года к Музаффарову присоединились директор Бухарского горпромторга Шоды Кудратов, несколько высокопоставленных милиционеров и торговых чиновников. Дело, ясно, шло к аресту самого первого секретаря Бухарского обкома партии, члена ЦК КП Узбекистана, ближайшего соратника Ш. Рашидова Абдувахида Каримова.
В июле того же года КГБ Узбекистана провел аресты среди лиц, занимавшихся хищением нефтепродуктов в особо крупных размерах. Преступники поддерживали связи с отдельными руководителями правоохранительных органов и Госкомитета по нефтепродуктам. Были арестованы: директор автозаправочной станции Закиряев, начальник отдела ГАИ УВД Ташкентского облисполкома Мадаминов и 13 работников нефтебаз и АЗС. Нити от них потянулись к самому министру внутренних дел Узбекистана К. Эргашеву. Рикошетом от него и к Ш. Рашидову. Понимая все это, Рашидов со своей стороны предпринял ответные меры, заручившись поддержкой в Москве у Черненко и Ко.
В узбекистанском КГБ была создана спецгруппа, которая затеяла контригру – завела «дело» на окружение председателя тамошнего КГБ Левона Мелкумова. Его супруга была крупным торговым работником в Ташкенте, а сфера торговли – это лакомое место для всяческих махинаций. Когда стало понятно, что следственная группа может «нарыть» серьёзный компромат и предоставить его в Москву, Андропов предпринял ответный ход: он прислал в Ташкент нового главу КГБ – Владимира Головина (человек Ф. Бобкова), а Левона Мелкумова отправил подальше из Союза – в представительство КГБ в Чехословакии. Однако сворачивать «узбекское дело» Андропов вовсе не собирался, поскольку главная цель не была достигнута – Рашидов оставался у власти.