Именно розыскные мероприятия приобретали решающее значение в работе военной контрразведки. В этом направлении ГУКР НКО «СМЕРШ» предпринял в 1944 г. серьезные организационные меры. Еще осенью 1943 г. центральный аппарат военной контрразведки разработал специальную инструкцию по организации розыскной работы, в которой удалось аккумулировать накопленный за предыдущий период войны опыт. Значение данной инструкции нельзя переоценить – она сродни боевым уставам Красной Армии, так же, как они, написана, что называется, «потом и кровью». Инструкция явилась одним из важнейших директивных документов, предопределивших работу военных контрразведчиков до конца Великой Отечественной войны. Текст ее был предельно конкретен. В нем, в частности, давались методика организации местного розыска, порядок использования перевербованных агентов разведки противника, раскрывалась требуемая работа оперативно-розыскных групп, описывалась процедура заградительных мероприятий и т. д.
Для проверки состояния розыскной работы во все фронтовые управления контрразведки весной 1944 г. были командированы специальные группы во главе с помощниками В. Абакумова. Им поручалось убедиться в правильности и эффективности агентурно-оперативных мероприятий, предпринятых во исполнение разосланной еще в сентябре 1943 г. специальной инструкции по розыску и иных указаний по данному вопросу. Как показали результаты обследования деятельности управлений контрразведки ряда фронтов, в том числе Белорусских, при наличии реальных успехов в деле розыска агентов разведывательных и контрразведывательных органов противника, а также изменников родины и активных пособников оккупантов эффективность усилий, предпринимаемых в этом направлении, следовало существенно повысить. Для дополнительного инструктажа в конце марта 1944 г. в ГУКР НКО «СМЕРШ» были вызваны ответственные за розыскную работу начальники отделов и отделений управлений контрразведки фронтов.
С объемным и насыщенным конкретными примерами докладом перед ними выступил комиссар госбезопасности 2-го ранга, начальник ГУКР В. Абакумов. По итогам совещания и состоявшегося обмена опытом во все органы «СМЕРШ» в действующей армии и в тыловых военных округах направлялись директивные указания и приказы. Следует подчеркнуть, что эти документы постоянно дорабатывались с учетом предстоящих наступательных операций Красной Армии. К примеру, до начала Белорусской стратегической наступательной операции советских войск был издан приказ начальника ГУКР НКО «СМЕРШ» от 29 марта 1944 г. № 10591. Инспекторская бригада ГУКР НКО «СМЕРШ» с 19 мая по 1 июня проверяла ход реализации данного приказа в управлении контрразведки 2-го Белорусского фронта. Как докладывал руководитель группы – помощник начальника главка генерал-майор К. П. Прохоренко, они сосредоточили свое внимание именно на организации розыска. В акте о проверке были указаны следующие недостатки: 1) слабо изучаются каналы проникновения немецкой агентуры через линию фронта; 2) чекистам не удалось добиться у командования фронта и армий наведения порядка в вопросе прикрытия разрывов в полосах обороны некоторых подразделений, что позволяло разведгруппам противника проникать в наш тыл; 3) явно недостаточно привлекалась к розыску агентурно-осведомительная сеть оперуполномоченных в полках и отдельных военных объектах; 4) слабыми были оперативные возможности в окружении воинских частей и в населенных пунктах за пределами 25-километровой прифронтовой зоны; 5) новый оперативный состав, прибывающий взамен убитых и раненых сотрудников, слабо представлял, как на практике реализовывать основные положения инструкции по розыску
Наряду с недостатками отмечались определенные положительные сдвиги. К примеру, только в полосе действий 49-й армии работали до 60 подвижных оперативно-розыскных групп и до 70 постоянных заградительных постов на перекрестках дорог, в больших селах и городках. В крупных городах, таких как Рославль, действовали опергруппы численностью до 25 человек. Опергруппа в Рославле, в частности, только за май 1944 г. задержала 113 подозрительных лиц, из которых после тщательной проверки были выявлены и разоблачены 2 агента немецкой разведки и 29 дезертиров. Еще 7 человек были взяты в изучение, поскольку их документы имели признаки подделки.
Неплохих результатов добились и контрразведчики 50-й армии. Они сумели разыскать и арестовать в мае 1944 г. 6 агентов (разведчиков и диверсантов) германских спецслужб, 63 дезертира, а также взять в оперативную проверку 954 человека с сомнительными паспортами, красноармейскими книжками и наградными документами.