Как уже упоминалось, в боевой состав входили вооруженные пароходы и катера, ранее принадлежавшие гражданским владельцам. При этом создатели Речного Боевого Флота были в худшем положении, нежели их противник. В распоряжении Волжской военной флотилии красных находились мощные промышленные предприятия, в частности, заводы Нижнего Новгорода, а также все запасы Балтийского флота. У белых же были лишь вооруженные (первоначально – только пулеметами) пароходы.
Первым был вооружен артиллерией колесный буксир «Фельдмаршал Милютин» (один из самых мощных волжских пароходов). На его носу установили армейское трехдюймовое орудие на деревянной поворотной платформе, сооруженной за три дня. Несмотря на то, что сделана платформа была «на глазок», установки в бою не подвели. Таким же кустарным способом были изготовлены и вращающиеся пулеметные башни – «они состояли из двух телескопических железных цилиндров с залитым между ними асфальтом». В качестве «брони» использовали кипы прессованного хлопка. Также использовался и такой специфический тип «речного боевого корабля», как плавбатарея – несамоходная баржа, вооруженная артиллерией. Называлась эта плавбатарея «Чехословак», она была оборудована в конце июля 1918 года, вскоре после взятия Симбирска. Ее вооружение состояло из двух шестидюймовых орудий Шнейдера. В составе Флота находилось и переоборудованное из парохода «Орлов» госпитальное судно, которое должно было обслуживать не только Флот, но и части Народной Армии. Корабли первоначально воевали под черно-желтым Георгиевским флагом, лишь в июле, после образования 2-го дивизиона, на кораблях были подняты Андреевские флаги.
За весь период своего существования Речному Боевому Флоту приходилось действовать против кораблей и сухопутных войск противника почти постоянно. Кампания на Волге и Каме длилась начиная с середины июля и вплоть до двадцатых чисел октября. В число задач Флота наряду с боевыми действиями входили перевозка сухопутных частей и эвакуация мирного населения. Иногда корабли выполняли и не совсем обычные задания, например, они развозили по населенным пунктам свежую прессу и агитационную литературу.
Первой боевой операцией, произведенной в самом начале июня, был захват баржи, груженной хлебом, которая стояла в двадцати верстах от Самары. Захват был произведен взводом чехов на буксирном пароходе, вооруженном тремя пулеметами. 12 июня на пароходе «Мефодий» под город Ставрополь были переброшены части отряда подполковника В. О. Каппеля и ряд чешских подразделений, которые высадились в 15 верстах от города и вскоре выбили из него противника. После занятия Ставрополя Флот оказал мощную артиллерийскую поддержку сухопутным войскам при взятии села Климовка. По дороге к Ставрополю вооруженный пароход «Фельдмаршал Милютин» протаранил и утопил небольшой винтовой пароход противника.
Первые успехи моряков вдохновили командование Народной Армии, и оно выделило для Флота часть личного состава и два трехдюймовых орудия. Самыми мощными боевыми единицами стали буксиры «Фельдмаршал Милютин» и «Вульф».
После взятия Ставрополя и Климовки в районе Климовки был оставлен один вооруженный пароход, а корабли «Фельдмаршал Милютин» и «Вульф» отправились в район Сызрани. У села Батраки им удалось отбить у противника и увести несколько барж с нефтью – жизненно важным для флота топливом. При взятии Сызрани в середине июня Флот исполнял роль «завесы» на случай возможного появления кораблей противника. В этот период к Флоту присоединился отряд пароходов, ушедший из Вольска после неудачно проведенного там антибольшевицкого выступления. Вооружив два из новоприбывших пароходов, командующий Флотом оставил их в районе Сызрани, а сам с остальными кораблями отбыл в Самару для получения дальнейших распоряжений от командования.
После взятия Симбирска следующим направлением для командования Народной Армии стало казанское. Флот в предстоящей операции должен был играть весьма важную роль: предстояло перебросить войска от Симбирска до Казани на расстояние более 200 верст, высадить десант и оказать поддержку огнем высаживающимся частям. В пути кораблям неоднократно приходилось вступать в боевое соприкосновение с кораблями противника. 1 августа, южнее села Тетюши, три вооруженных парохода красных вступили в бой с шестью кораблями Речного Боевого Флота, но, ввиду явного превосходства последних, отошли к Казани. К 4 августа войска экспедиционного отряда полковника А. П. Степанова и каппелевцы заняли все населенные пункты вплоть до устья Камы.