Во второй период Соединенными Штатами впервые были испытаны на точность поражения новые управляемые авиабомбы JDAM, JSOW, WCMD, которые специально сбрасывались с высоты более 23 тыс. метров (носитель стратегический бомбардировщик В-2А) с наведением по сигналам космической навигационной системы Навстар. Возврат в войну прошлого поколения оказался возможным не только после полного завоевания господства в воздухе, но и вероятнее всего после "создания" специальных погодных условий. В порядке натурного эксперимента в течение мая США, похоже, создавали искусственную погоду на театре войны. Известно, что погода в Европе зависит главным образом от физических процессов, происходящих при взаимодействии атмосферы с космосом и поверхностью Атлантического океана в обширном районе между нулевым и 60-м меридианами западной долготы и между 30-й и 70-й параллелями северной широты. Здесь зарождаются циклоны, которые затем перемещаются в основном на восток и оказывают существенное влияние на погоду и климат по всей Европе. Уже давно существуют эффективные способы вызова искусственных осадков из дождевых облаков в том месте, где они не окажут вредного влияния. В СССР и России соответствующие методы применялись в чрезвычайно дождливое лето 1980 года, когда проходили Олимпийские игры, или 9 мая 2000 года, когда в Москве проводился Парад Победы. Погодные условия создавались специальной авиацией, которая рассеивала над дождевыми облаками гранулы серебристого бария, выстреливала патроны с йодистым серебром, рассеивала сухой лед и таким образом провоцировала выпадение осадков за пределами российской столицы. По всей видимости, аналогичные методы были применены и над Атлантикой. Погода на театре войны была превосходной на протяжении всего второго периода операции, когда действовала пилотируемая авиация.
2. Во второй период началась плановая боевая стажировка практически всего основного и резервного летнего составов ВВС США, а также других стран НАТО, участвовавших в операции. На ряде авиабаз, а также на авианосцах США происходила кратковременная подготовка и допуск к боевым вылетам вновь прибывших летчиков-резервистов из стран НАТО. После 10-15 самолетных боевых вылетов, что считалось достаточным для приобретения боевого опыта, происходила их ротация. Затягивание военных действий было искусственным и имело целью приобщить к боевой работе максимально возможное количество резервного летного состава США. Именно этим летчикам придется проходить военную службу в течение 10-15 лет, т.е. в период, который будет переходным к войнам нового поколения. Это означает, что подготовка таких пилотов должна учитывать реалии прежде всего войн прошлого поколения. Для снижения возможных потерь летного состава самолеты НАТО не опускались ниже 15 тыс. футов (5 тыс. м), вследствие чего соблюдение международных норм ведения войны становилось невозможным. В этот период были допущены многочисленные ошибки недостаточно подготовленными пилотами НАТО, которые состояли в неоднократных обстрелах колонн косовских беженцев и бомбардировках гражданских объектов. Именно действия пилотов-резервистов дали некоторым СМИ и экспертам основания говорить о неэффективности операции НАТО и ее слишком большой стоимости.
3. В ходе второго периода операции продолжались эксперименты по применению управляемых авиабомб различных типов с лазерным наведением, а также по применению специальных бронебойных сердечников из обедненного урана. Такой уран практически полностью состоит из изотопа урана-238 и не содержит энергетически ценного изотопа урана-235, применяемого для изготовления ядерных боеприпасов. Кстати, еще в 1987 году во время Женевских переговоров о запрещении ядерных вооружений США и СССР совместными усилиями добились того, что оружие, содержащее слабо обогащенный уран-238, было отнесено в разряд обычных вооружений. О широте эксперимента свидетельствует применение таких урановых снарядов самолетами США: 40 штурмовиками А-10А и 6 самолетами с вертикальным взлетом и посадкой АУ-8. Уже после войны британские специалисты подсчитали, что в результате применения 37 тысяч урановых снарядов Югославия получила примерно 23 тонны распыленного обедненного урана-238, которого достаточно, чтобы лучевое поражение получили около полумиллиона человек. Следует также отметить, что впервые урановые снаряды применялись в ударах по Ираку в 1991 году. Сейчас в этой стране широкое распространение получили раковые заболевания детей и новорожденных.