Наконец, 31 октября к рифу подошла подводная лодка «Наутилус» с приказом уничтожить «Дартер». Артиллеристы стреляли прямой наводкой и выпустили по цели 55 шестидюймовых снарядов. Закончив артиллерийский обстрел, командир лодки сообщил: «Сомневаюсь, чтобы теперь оборудование «Дартер» представляло какую-то ценность для японцев: оно превращено в металлический лом».
Таков был конец доблестной подводной лодки. Но не одна она была погребена в этих опасных водах около острова Палаван. В нескольких милях от нее на дне моря лежал флагманский корабль командующего японским флотом — тяжелый крейсер «Атаго», потопленный торпедами «Дартер». Недалеко от крейсера «Атаго» лежал тяжелый крейсер «Мая», торпедированный подводной лодкой «Дэйс».
Поврежденный торпедами, выпущенными лодкой «Дартер», третий японский тяжелый крейсер «Такао» с трудом добрался до порта Бруней на западном побережье острова Борнео. Оттуда он направился в Сингапур, где оставался очень долго, так как у него был выведен из строя двигатель.
Впоследствии, чтобы сохранить команду лодки «Дартер» как целую боевую единицу, командование в полном составе приписало ее к строившейся в то время подводной лодке «Менхейден».
В будущем историки должны будут надлежащим образом проанализировать сражение за залив Лейте — возможно, самое сложное из всех сражений за время войны на Тихом океане — и оценить ту роль, которую сыграли в нем подводные силы. Военные специалисты могут расходиться в оценке тактики американского флота и стратегии японцев. Эксперты могут прийти к выводу, что действия подводных лодок сыграли в сражении большую роль; одно ясно, что действия подводных лодок в юго-западной части Тихого океана в то роковое утро, которое предшествовало знаменательному трехдневному морскому сражению, всегда будут отмечаться в любой дискуссии об этом сражении, положившем конец успешным действиям японского флота.
Выведя из строя четыре самых крупных и самых лучших японских тяжелых крейсера, подводные лодки «Брим», «Дэйс» и «Дартер» оказали значительное влияние на исход сражения. Четыре корабля («Атаго» и «Мая» были потоплены, а «Такао» и «Аноба» повреждены) японского флота были выведены из строя в то время, когда он шел к месту последнего боя. Командующий японским флотом еще утром 23 октября пришел к выводу, что план «Сего» провалится. Но было уже поздно переделывать его. Потеряв свой флагманский корабль, адмирал перебрался со своим флагом и штабом на линейный корабль «Ямато». Если бы крейсер «Атаго» затонул быстрее, японцы не успели бы спасти весь личный состав. Однако торпедированный крейсер оставался на плаву в течение 30 мин.
Переход штаба на линейный корабль не помешал осуществлению планов; напротив, условия управления японским флотом даже улучшились. Это произошло, вероятно, потому, что «Ямато» строился как флагманский корабль я на нем хорошо была организована связь и противовоздушная оборона. Об этом впоследствии заявил вице-адмирал Курита. Если это так и если линейный корабль «Ямато» больше подходил для роли флагманского корабля, то почему же адмирал не поднял на нем свой флаг с самого начала?
Начальник штаба флота, видимо, не разделял точки зрения командующего о том, что переход с крейсера «Атаго» на линейный корабль «Ямато» облегчал условия управления. Вот что он сообщил на допросе после войны: