Пониженная температура способствует ликвидации покоя зародышей и тормозящего действия семенных покровов. Однако растрескивание перикарпия идет быстрее при повышенной температуре. Поэтому для ускорения прорастания семян необходима предпосевная обработка косточек — стратификация. Предлагается следующий режим стратификации косточек боярышников. Для видов, имеющих семена с глубоким покоем и более толстым перикарпием, стратификацию осуществляют в торфе: косточки перемешивают с влажным торфом в соотношении 1:3 и выдерживают не менее 4 месяцев при температуре +20—
Для сокращения сроков стратификации применяют разные приемы предварительной обработки косточек. Промывание косточек в проточной воде ускоряет ликвидацию покоя семян. А для разрушения перикарпия косточки обрабатывают концентрированной серной кислотой в течение 15—20 мин или скарифицируют, надрезая с вершины секатором. Ускоряет растрескивание воздушно-термическая обработка, при которой косточки намачивают и подсушивают при температуре 40—60 °C или на солнце.
Наступление физиологической зрелости семян происходит до наступления морфологической спелости плодов, когда заканчивается накопление питательных веществ, увеличивается плотность покровов и семя переходит в глубокий покой. Поэтому у древесных пород с длительным семенным покоем скорее прорастают семена из плодов, собранных до наступления их морфологической спелости. У плодов с сочным околоплодником семена приобретают способность прорастать и обладают наиболее коротким периодом покоя, когда околоплодник приобретает присущий ему цвет, но еще тверд. У боярышников наблюдалась аналогичная картина: косточки, взятые из недозревших плодов, прорастают быстрее. Так, по данным Е. 3. Бобореко, у большинства из 14 взятых для опыта видов боярышника косточки зрелых плодов дали входы через две зимы, а недозрелых плодов, посеянные сразу после сбора, — через 8 месяцев.
Многие виды боярышника дают мало всходов из-за отсутствия в косточках семян. Полость таких косточек заполнена склерофицированными клетками перикарпия. В Ботаническом саду МГУ в течение 4 лет проводились исследования косточек более 15 видов боярышника. Было выявлено, что все виды ежегодно содержат бессемянные косточки. У боярышников алмаатинского, Королькова, Арнольда их число достигало 60—80 %, у боярышников даурского и перистонадрезанного — 9—38 и боярышника однопестичного — 1,5—10 %.
В Ботаническом саду АН КиргССР (Фрунзе) у большинства из 21 вида боярышника, наблюдавшихся в течение 4 лет, число бессемянных косточек превысило 50 %. Число таких косточек у дикорастущего боярышника туркестанского в зависимости от места сбора плодов составило 17—66 %, у дикорастущих крымских боярышников — 20—65 %. Было замечено, что крупные плоды содержат меньше бессемянных косточек, чем мелкие с того же растения, и что плоды, созревающие первыми, имеют больше бессемянных косточек.
В плодах боярышника встречаются также косточки, содержащие семена с недоразвитым зародышем или вовсе без зародыша. Число таких косточек у некоторых видов достигает 30 %, а в годы с дождливым, холодным летом — 40—60 %. Часто косточки боярышников поражаются личинками энтомовредителей, которые уничтожают зародыш, остатки запасной ткани, оставляя лишь семенную оболочку. В Ботаническом саду МГУ у боярышников даурского, однопестичного и кроваво-красного наблюдалось ежегодное поражение косточек личинками (до 70—80 %).
У боярышников Арнольда, мягковатого, туркестанского с личинками встречались лишь единичные косточки. Количество их зависит от толщины перикарпия. Сильнее поражаются косточки тех видов, которые имеют толщину перикарпия 0,25—0,4 мм, а у видов с большей толщиной перикарпия (0,5—1 мм) косточки поражаются редко. Для отдельных видов боярышника характерно незначительное количество косточек с нормальными семенами. В Ботаническом саду МГУ доля доброкачественных косточек у боярышника алмаатинского составляла 0—7 %, у боярышника даурского — 4—17, у боярышника кроваво-красного — 3,5—12,5, у остальных видов — менее 50 %. Наибольшее содержание семян отмечено у боярышника перистонадрезанного — 56,5—91 %.