Почвы.
В пустынях Южной К. и полупустынях Северной К. распространены серозёмы (здесь развито орошаемое земледелие), в местах подпитывания грунтовыми водами — лугово-серозёмные, по поймам рек и на приозёрных равнинах Иссык-Куля, Сонкёля, Чатыркёля и др. — аллювиальные, луговые и лугово-болотные почвы. В пустынно-степном поясе Внутреннего и Центрального Тянь-Шаня и западной части Иссык-Кульской котловины развиты бурые почвы: в сухостепном поясе — каштановые, в лугово-степном на увлажнённых склонах — горные чернозёмы. Встречаются разнообразные виды горно-лесных почв: бурые — в еловых, черно-коричневые — в орехово-плодовых и коричнево-бурые — в арчевых лесах. Выше идут разновидности горно-луговых, горных лугово-степных и горно-степных субальпийских почв. У верхних пределов распространения растительности наибольшие площади заняты дерново-полуторфянистыми и высокогорными полигональными, а выше такыровидными пустынными почвами (на сыртах Внутреннего Тянь-Шаня).Растительность
К. насчитывает более 3,5 тыс. видов. Ее распределение зависит от сложности рельефа и определяется расположением хребтов, их высотой и экспозицией склонов. Пустыни и полупустыни занимают небольшие площади. Степи и лугостепи распространены повсеместно и освоены под поливное и богарное земледелие. Высокотравные луга используются под сенокосы, низкотравные — как пастбища. Под лесами 3,3% территории республики; наибольшую площадь занимают еловые, арчевые и орехово-плодовые леса. Леса из тянь-шаньской ели распространены на высотах от 1600 до 3100Животный мир.
В пустынях обитают грызуны: жёлтый суслик, тушканчики, а также песчаный заяц-толай, ушастый ёж; из птиц — саджа, пустынный снегирь, розовый скворец; из пресмыкающихся — степная черепаха, восточный удавчик, желтопузик и др. В степях распространены серый хомячок, обыкновенная и общественная полевки, светлый хорь, кот-манул, золотистая щурка, сизоворонка, водяной уж, узорчатый полоз, стрепет, дрофа-красавка, перепел и др. Разнообразна фауна лесов: из млекопитающих — бурый медведь, рысь, кабан, косуля, горностай, серый волк, лесная куница, марал, гималайская пищуха; из птиц — ястреб-тетеревятник, чеглок, ястреб-перепелятник и др.; имеются и эндемики: грызуны — тянь-шаньская мышовка, тянь-шаньская полёвка, из птиц — тянь-шаньская ореховка. В высокогорьях — горный козёл (теке), снежный барс, улар, каменная куница, реликтовый суслик и др. На озере Иссык-Куль зимуют лебеди, гуси, утки, на озерах Сонкёль и Чатыркёль обитает горный гусь. В водоёмах насчитывается около 40 видов рыб, из них 25 видов промысловые. Акклиматизированы промысловые животные — енот, американская норка, белка-телеутка, ондатра, нутрия.Заповедники
. На территории К. имеютсяВ Памиро-Алайской области выделяются провинции: Алайская (Алайский, Туркестанский хребты) — высокогорные ландшафты, арчевые леса, горные луга и субтропические степи; Северо-Памирская — горно-степная Алайская долина и высокий оледенённый Заалайский хребет.