После вхождения К. в состав России во взглядах представителей демократической (Токтогул Сатылганов, Тоголок Молдо, Барпы Алыкулов и др.) и консервативной (Калыгул, Арстанбек, Молдо Кылыч) идеологии выявились противоречия киргизского общества того времени. Калыгул, Арстанбек и Молдо Кылыч идеализировали патриархально-родовые и феодальные отношения. В творчестве акынов-демократов Токтогула, Тоголока Молдо и Барпы проявились наивно-материалистическая и просветительская тенденции. Выступая против религиозных представлений о загробном мире, они отстаивали ценность земной жизни людей.
Идеи марксизма-ленинизма стали проникать в К. в начале 20 в связи с приобщением киргизского народа к ценностям русской и мировой культуры, но широкое распространение марксизма-ленинизма началось после установления Советской власти. На киргизский язык были переведены произведения К. Маркса, Ф. Энгельса, В. И. Ленина. Однако подготовка местных философских кадров началась лишь после Великой Отечественной войны благодаря развитию учебной и научной работы на философских кафедрах вузов и образованию отдела философии и права (с 1958), а затем института философии и права АН Киргизской ССР (1964).
Философы К. разрабатывают ряд актуальных проблем исторического материализма, в том числе проблему закономерностей построения социализма в республиках Советского Востока, исследуют процесс ускоренного развития от патриархально-феодальной отсталости к социализму. Некапиталистический путь развития К. рассматривается в работах А. Алтмышбаева, М. Джунусова и др. Ряд философов изучает категории исторического материализма (Ю. Ю. Вейнгольд, А. Табалдиев и др.). В работах А. Какеева, С. Джумагулова и др. разрабатывается проблема изменения в психологии киргизского народа, обусловленного взаимовлиянием киргизской и русской культур. А. Чотонов, К. Исмаилов и др. изучают формирование социалистического патриотизма и интернационализма у ранее отсталых народов, а также место и роль прогрессивных национальных традиций в развитии общества. Проводится комплексное исследование современных форм религиозности (С. Мамбеталиев, С. Дорженов, С. Абылдаев и др.). Исследование социальных, гносеологических и культурных факторов формирования материалистического мировоззрения у советских людей связано с проблемами атеистической пропаганды и разработкой методов воспитания подрастающего поколения в духе научного атеизма. В области истории философии значительное внимание уделяется проблемам культурного наследия (А. Алтмышбаев и др.). Философы К. разрабатывают философские вопросы естествознания, главным образом проблемы кибернетики и семантики (А. Брудный, Р. Шералиева). В работах Т. Абдылдаева и др. рассматривается проблема вида и видообразования в философском и естественнонаучном аспектах. В области эстетики изучается природа эстетического отношения, художественного образа, проблемы художественной условности и др. (работы А. Салиева, К. Молдобаева и др.).
Становление и развитие киргизской историографии связано с победой Октябрьской революции. Большую помощь киргизскому народу в первоначальном изучении края, создании научных ячеек, развитии исторической науки, подготовке научных специалистов оказывали учебные и научно-исследовательские учреждения Москвы, Ленинграда, Ташкента и др. научных центров страны. В 1924 основана Киргизская научная комиссия по записи киргизского фольклора, в 1927 создан Центральный музей К., проведён учёт памятников старины и искусства. С 1928 начал работу Киргизский НИИ краеведения. С 1932 центром научной работы стал Киргизский государственный педагогический институт, в котором готовились кадры историков. Историческая тематика разрабатывалась и в учрежденном в 1937 Комитете наук при СНК Киргизской ССР. В состав открытого в 1943 Киргизского филиала АН СССР входил институт языка, литературы и истории, выросший с созданием АН Киргизской ССР (1954) в институт истории. Историческая тематика исследуется также в институте истории партии при ЦК КП К., на исторических кафедрах Киргизского государственного университета и др. вузов. С 1967 функционирует Республиканское общество по охране памятников истории и культуры.