Киргизская историческая наука развивалась в тесной связи со всей советской исторической наукой. В начале 40-х гг. завершился первый этап становления исторической науки в К., второй — охватывает период 40-х—середины 50-х гг. После 20-го съезда КПСС начался новый этап — изучение истории на более высоком научно-теоретическом уровне, по расширенной проблематике, с охватом всех периодов и важнейших исторических проблем К., с акцентом на современность. Основные научные направления исторических исследований в К. — Октябрьская революция 1917, Гражданская война 1918—20, социалистическое и коммунистическое строительство, закономерность исторического развития общества и переход от одной социально-экономической формации к другой. В 20—40-х гг. опубликованы воспоминания участников революционных событий в К. и первые работы по истории К. современного времени. В монографиях А. Г. Зима, С. Б. Жантуарова, П. П. Никишова и др., изданных в 50—70 гг., показана борьба трудящихся всех национальностей К. за установление и упрочение Советской власти в крае. Проведены исследования о советском, хозяйственном и национально-государственном строительстве, некапиталистическом пути киргизского народа к социализму, торжестве идей дружбы народов и пролетарского интернационализма (М. С. Джунусов, В. П. Шерстобитов, К. К. Каракеев, К. К. Орозалиев, Д. М. Малабаев, С. Т. Табышалиев, М. Я. Сушанло, Т. У. Усубалиев). Опубликован ряд работ, посвященных земельно-водным реформам и переходу кочевников к оседлости (Б. Б. Байбулатов и др.), о колхозно-кооперативном движении, индустриализации и успехах промышленного развития республики (С. Ильясов, Т. Дуйшемалиев, И. Ибраимов). Крупные исследования проведены по вопросам культурной революции в К. (К. К. Каракеев, А. А. Алтмышбаев, А. Э. Измайлов, А. К. Каниметов, С. С. Данияров). Деятельность Коммунистической партии К. по руководству социалистическим и коммунистическим строительством, вопросы развития науки освещаются в трудах К. К. Каракеева, В. М. Петровец, история здравоохранения — в работах А. А. Айдаралнева. В работах киргизских историков отразились процессы формирования новой социальной структуры советского общества: колхозного крестьянства, рабочего класса, интеллигенции, киргизской социалистической нации (С. Т. Табышалиев, Х. М. Мусин, С. К. Керимбаев, Ж. С. Татыбекова и др.). Изданы также сборники документов о победе Советской власти и социалистических преобразованиях в К.
Разработка проблем дореволюционной истории К. началась с труда академика В. В. Бартольда «Киргизы» (1927). Ряд проблем дореволюционной истории был поставлен в трудах Б. Д. Джамгерчинова. В послевоенный период изучались такие вопросы, как процесс присоединения К. к России (Б. Д. Джамгерчинов, А. Х. Хасанов, К. У. Усенбаев), характер общественно-экономического строя К. 19—начала 20 вв. (И. Ильясов, М. П. Вяткин и др.). Работами С. М. Абрамзона, К. И. Петрова и др. значительно продвинуто изучение проблем этногенеза киргизов. Исследования историков и этнографов смыкаются в разработке проблем историко-культурного прошлого киргизского народа, его идеологии и связей с соседями (Д. О. Айтмамбетов, К. И. Антипина). Археологическое изучение К. ведётся с конца 20-х гг., особенно интенсивно с 1946, оно связано с именами А. Н. Бернштама, М. П. Грязнова, А. К. Кибирова, П. Н. Кожемяко и др.
Достижения советской историографии К. обобщены в трёх изданиях «Истории Киргизской ССР» (1956, 1963, 1967—68). В К. глубоко изучаются все периоды истории республики. Особое внимание уделяется проблемам социалистического и коммунистического строительства, достижениям ленинской национальной политики в Советской К.