С начала IX века началась борьба Абхазского царства с грузинскими княжествами, умерший в 955 году, и Леон III (955–967 годы) увеличили территорию царства, заняв северную часть Тао-Кладжети и город Самшвилде в Нижней Картли. При царе Дэметре в Абхазии начали внутренние междоусобицы и борьба за власть, что привело к включению Абхазского царства в виде княжества в 975 году в состав Грузии и Имеретии. Последний абхазский царь Феодосий Слепой умер в 982 году.
В начале XII века Абхазия по распоряжению грузинского царя Давида II была передана в удел княжескому роду Шервашидзе. Воспользовавшись нападением на Грузию татаро-монгол Батыя удельные князья Шервашидзе отделились от Грузии и объявили Абхазию независимой.
С 1170 года до XIV века за влияние в Абхазии и других Черноморских государствах велась борьба двух средневековых итальянских республик – Генуи и Венеции. Генуэзцы победили, на абхазском побережье были построены генуэзский факторий – Хакара-Гагра, Санта-София-Пицунда, Себастополис-Сухуми, Санта-Анджеле, у устья реки Ингури. Себастополис был объявлен столицей-резиденцией протектора грузинских колоний на Кавказском побережье. Себастополис стал невольничьим рынком.
К концу XV века Грузия распалась на ряд мелких уделов, а Абхазия в XVI веке с Мингремией и Грузией входила в состав княжества Сабедиана. На рубеже XVI–XVII веков Абхазия сумела создать самостоятельное княжество. Однако захватившая в 1475 году Византию Турция уже давно хозяйничала в Крыму и на Черноморском побережье Кавказа до 1810 года.
В.П. Пачулиа писал:
«Турецкое господство, сопровождавшееся жестоким угнетением, грабежом и насилием над коренным населением, принесло стран большой материальный и моральный урон.
Цветущие когда-то города превратились в невольничьи рынки. Как сообщал французский путешественник Ж. Шарден, посетивший Черноморское побережье в XVII веке, турецкие купцы ежегодно вывозили из приморских городов Закавказья в Малую Азию огромное количество рабов. Озверелая султанская военщина насильственно насаждала ислам, грабила и обращала в развалины созданные трудом многих поколений христианские храмы, дворцы, города и села».
Восстания абхазов против турецкой оккупации в 1725, 1728, 1733, 1771, 1806 годах жестоко подавлялись.
Турецкое владычество закончилось в в 1810 году, когда турков с Черноморского побережья Кавказа выбили русские войска, занявшие прибрежные города и совершившие ряд экспедиций вглубь Абхазии. Владетельный хан Абхазии из рода Шервашидзе Сефир-бей принял подданство России и христианскую веру. Владение абхазскими землями было сохранено за родом князей Шервашидзе.
В первый период русские власти не принимали никаких мер к экономическому росту в Абхазии. Этим захотели, как всегда, воспользоваться англичане, которые через свою торговую базу в Трапезунде попытались распространить свое торговое влияние на Абхазию и Закавказье. Русские власти не допустили английские товары на Черноморское побережье. Отсутствие товаров (русские поставляли только соль) вызвало волнение в регионе.
Во время Крымской войны 1854–1855 годов российский император Николай I обрек на уничтожение русские гарнизоны в Абхазии, объявив, что вывезти их невозможно, так как русский флот в Черном море может встретиться с противником. Когда это русский флот боялся морского боя! Впрочем, от Николая I ждать умного решения было бы несерьезно. Русские офицеры во главе русских солдат сами сумели уйти из Абхазии на купеческих и частных судах. Для русского императора Николая Палкина думать вообще было затруднительно. После войны русские вернулись в Абхазию.
Князь Шервашидзе оставался номинальным владетелем Абхазии до 1864 года, когда он был сослан в Воронеж, где через год умер. В 1864 году в Абхазии было введено русское правление, страна стала называться «Сухумский военный отдел». Начальник отдела был приравнен к военным губернаторам Закавказья.
В 1866 году в Бзыбской Абхазии произошло крупное восстание, вызванное недовольством населения предстоящей аграрной реформой. Восстание началось 26 июля в Гудаутском районе и вскоре охватило многие районы Абхазии. Повстанцев было около 20 000 человек, но Сухуми взять им не удалось. Восстание было подавлено. В начале сентября все повстанцы были разоружены, 30 человек выслали за пределы Абхазии, три человека публично повешены в декабре 1866 года.
В 1867 году цебельдинские и дальские абхазы выселились в Турцию.