На самолете было две радиостанции. Основная, для связи с землей, находилась у стрелка-радиста. На В-25А и В-25В устанавливалась станция SCR-AL-183, на всех более поздних модификациях — SCR-274N. Вторая радиостанция, поменьше, стоявшая в пилотской кабине, служила для связи между самолетами в группе. Имелось также самолетное переговорное устройство.
Бронезащита (введенная с модификации В-25А) включала бронеспинки у пилотов (толщиной 9,6 мм, первоначально ставилась только командиру самолета) и плиты у бомбардира — вертикальную толщиной 9,6 мм и горизонтальную (на полу) толщиной 10,2 мм. Стрелков прикрывала сзади сплошная стальная перегородка в фюзеляже толщиной 9 мм. В ней имелась дверь для прохода в хвостовой отсек. На модификациях G и Н ставилась дополнительная наружная плита с левого борта под остеклением пилотской кабины, на типе J — такие же плиты по обеим бортам. На штурмовиках бронеспинка монтировалась и на кресле штурмана-заряжающего, устанавливалась броневая плита перед кабиной пилотов, защищалась укладка с 75-мм снарядами. На модификации J две дополнительных бронеплиты располагались перед приборной доской.
Стрелковое вооружение зависело от модификации самолета. На наиболее распространенных в первый период войны машинах ранних серий модификаций С и D устанавливался один 7,62-мм пулемет в «яблоке» у бомбардира (с запасом 600 патронов). При этом установочных гнезд имелось три, а сам пулемет мог быстро перебрасываться из одного в другое, что существенно расширяло поле обстрела. На самолете также монтировали верхнюю турель Бендикс А-5 и нижнюю выдвижную Бендикс А-4. В каждой из них находились по два 12,7-мм пулемета с боезапасом по 400 патронов на ствол. Вращение башен, подъем и опускание стволов осуществлялись электроприводом. Нижняя турель выдвигалась и убиралась вручную. Позднее внедрили усовершенствованные турели типов А-9 (верхнюю) и А-10 (нижнюю), внешне не отличавшиеся от старых. На поздних сериях бомбардировщиков дополнительно устанавливался неподвижный 12,7-мм пулемет с ящиком на 300 патронов в передней кабине, а 7,62-мм пулемет в шаровом гнезде заменили на крупнокалиберный (с запасом в 300 патронов). При этом подвижной пулемет при необходимости мог фиксироваться, и стрельбу из него вел пилот.
На сериях D-30 и D-35 и последующих модификациях нижнюю турель ликвидировали. Но добавили второй неподвижный пулемет спереди (причем боезапас обоих довели до 400 патронов), ввели бортовые установки 12,7-мм пулеметов в окнах за крылом (с запасом по 250 патронов) и кормовую шкворневую установку (тоже с 12,7-мм пулеметом, 400 патронов).
Дополнительно могли монтироваться четыре неподвижных пулемета в контейнерах по бортам (попарно с каждой стороны). Их патронные ящики (на 400 патронов для каждого) ставились внутри самолета, в кабине штурмана.
Машины типа B-25J обычно комплектовались одним неподвижным пулеметом спереди (с ящиком на 400 патронов) и спаренной кормовой установкой фирмы «Белл» (с запасом по 600 патронов на пулемет). На этой модификации верхнюю башню А-9 перенесли вперед и расположили над местом штурмана.
Перезарядка пулеметов турелей у модификаций А, В, С — гидравлическая, у D и G — механическая (тросиками Боудена). У передних пулеметов затвор передергивался механически на всех вариантах. Управление огнем всех пулеметов — электрическое. Стрелковые установки комплектовались оптическими прицелами N-3A или N-3B. У пилотов монтировался оптический прицел N-3 и механический дублирующий (мушка и кольцо).
На всех В-25 до серии С-1 бомбовая подвеска— только внутренняя. Максимальная нагрузка составляла 2000 кг. Допустима была подвеска бомб калибром до 500 кг. Позже ввели наружные съемные бомбодержатели под консолями для бомб весом до 250 кг. Общая бомбовая нагрузка при этом увеличилась до 3000 кг. Начиная с серии D-30 в бомбоотсеке, кроме шестизамковых кассет по бортам, предусмотрели расположенный по оси самолета усиленный держатель под одну бомбу весом до 1000 кг. Бомбовый прицел находился в носовой кабине. На самолетах для ВВС армии США монтировали прицел Норден М-9, на экспортных — Вимперис D-8. В СССР на В-25 устанавливались отечественные бомбовые прицелы ОПБ-1 (дневной) и НКПБ-7 (ночной).
Кабины «Митчелла» отапливались двумя бензиновыми калориферами «Стюарт-Уорнер», работавшими на смеси, отбиравшейся от карбюратора левого мотора. Калориферы обогревали также механизмы турелей, затворы пулеметов. Отходящие газы печи использовались для обогрева карбюраторов. Козырек пилотской кабины и переднее стекло у бомбардира обдувались теплым воздухом от электрической воздуходувки. С помощью гибких шлангов летчики могли оттаять и любое другое окно в пилотской кабине. Предусматривался электрообогрев комбинезонов экипажа, для чего в разных местах самолета находились семь специальных розеток.
При необходимости на бомбардировщиках можно было смонтировать плановый фотоаппарат типа К-7С, К-313 или Т-3А. Он размещался в хвостовой части фюзеляжа. Отверстие под объективом имело съемную крышку.