С 1945 г. около 180 B-17G переоборудовали в самолеты аварийно-спасательной службы В-17Н. На них не было нижней шаровой турели. Вместо нее под фюзеляжем самолета висела сбрасываемая спасательная лодка типа Хиггинс А-1. После войны все вооружение с них сняли, а под носом смонтировали поисковый радар. Эти машины удержались на вооружении до 1956 г., в тов ремя как В-17 (так же как и В-24) в бомбардировочной авиации США сразу же после войны были вытеснены В-29. В-17Н, с 1948 г. переименованные в SB-17, участвовали в корейской войне, опять получив все свое вооружение (кроме «бороды»). Там ВВС США применяли их до ноября 1950 г., когда по другую сторону фронта появились МиГ-15. В Корее воевали и «Крепости»-разведчики, переименованные в RB-17G. RB-17G из 6204-го картографического звена совершил первый в корейской войне боевой вылет 25 июня 1950 г.
За годы войны американская авиация флота получила 46 B-17G и 2 B-17F. Под обозначением РВ-1 они применялись как патрульные и спасательные самолеты, аналогичные армейским В-17Н. Береговая охрана США до октября 1959 г. эксплуатировала РВ-1 G – это были переделанные B-17G с обтекателем РЛС под носовой частью, часто несущие и спасательные лодки. Один PB-1G превратили в самолет для картографической съемки, поставив на место нижней турели специальную 9-ти объективную камеру.
Авиация американского флота после войны имела на вооружении еще один вариант В-17 – PB-1W, самолет радиолокационного дозора. Это были B-17G с мощным радиолокатором AN/APS-20. Его антенна обычно находилась в большом грибовидном обтекателе в носовой части, но в некоторых случаях она располагалась сверху фюзеляжа самолета, как у современных машин подобного назначения. Флотские мастерские в Джонсвилле в 1945 г. модифицировали таким образом 31 B-17G. Один PB-1W затем переделали в летающий стенд для испытания турбореактивных двигателей (он именовался ХРВ-1), другой носил под фюзеляжем модели новых самолетов: их сбрасывали с высоты, изучая при пикировании обтекание на больших скоростях. Так, например, испытывали модель истребителя F8F «Бэаркэт».
Часть снятых с вооружения бомбардировщиков переоборудовали в радиоуправляемые самолеты-мишени QB-17. Их было два типа: QB-17L с телевизионной системой (телекамера стояла в кабине бомбардира) и QB-17N с обычным радиоуправлением. В сигарообразных контейнерах на концах крыльев у них находились кинокамеры, фиксировавшие повреждения. Впервые их применили при испытании атомной бомбы на атолле Бикини. Военных интересовало воздействие поражающих факторов ядерного взрыва на самолет в полете. В 50-х гг. их использовали для тренировки в воздушной стрельбе, а также для испытания зенитных ракет и ракет класса «воздух-воздух» (в частности, известного типа «Сайдуиндер»),
Самолет-мишень управлялся с самолета наведения DB-17P – такой же переоборудованной «Летающей крепости». Последний QB-17L сбили при испытаниях зенитной ракеты «Бомарк».
Некоторое количество бомбардировщиков переделали также в невооруженные штабные самолеты VB-17G. Этот вариант дольше всех продержался на вооружении ВВС США – до второй половины 50-х гг. Они использовались в Корее (в том числе и машины с восстановленным оборонительным вооружением).
Еще во время второй мировой войны «Крепости» участвовали в многочисленных экспериментах с управляемыми бомбами GB-1, GB-4, GB-9. GB-4 даже сбрасывали на Гавр и Ля-Палис в 1944 г. (но неудачно). В 1947 г. с B-17G запускали самолеты-снаряды JB-2 «Лун» (ко-пию немецких V-1). Каждая «Крепость» несла под консолями по два JB-2.
После окончания И-й мировой войны много B-17G было за дешево распродано, в том числе и за рубеж. По программам военной помощи их передали, в частности, в ряд стран Латинской Америки. B-17G летали с опознавательными знаками Франции, Португалии, Дании. Из ВВС различных стран дольше всего «Крепости» удержались на вооружении в Бразилии. Там 6-я авиагруппа использовала разоруженные B-17G как спасательные самолеты до второй половины 60-х гг. Немало машин попало в частные руки. Их переоборудовала, например, фирма «Фэйрчайлд». В США они эксплуатировались как аэрофотосъемочные, геологоразведочные, пожарные и прочие. Два B-17G в 1946 г. превратили в летающие лаборатории для испытаний двигателей – в их носовой части стояли опытные турбовинтовые двигатели Райт и ХТ-35 Пратт-Уитни ХТ-34 (этот вариант известен как Боинг 299Z и JB-17G). Впоследствии выполнили еще одну такую переделку для испытаний двигателя Т56.
Три самолета через вторые руки попали в Палестину. Там их в мае 1948 г. использовали зарождающиеся израильские ВВС. Правда, боевая эффективность их была невысока, поскольку продали их без вооружения. Тем не менее во время ближневосточной войны 1948 г. они совершили несколько налетов на цели в Египте.