Такой исход дела не был для арестованного случайным подарком судьбы и уж тем более не объяснялся недобросовестностью следствия. Свое «везение» Иосиф Джугашвили подготавливал сам. Осуществляя конспиративную деятельность, он всегда проявлял осторожность и предусмотрительность, не теряя головы в самых критических ситуациях. Л.Б. Красин отмечал, что Сталину были присущи «дьявольская смекалка и хитрость, помноженная на осторожность». Он никогда не совершал опрометчивых и необдуманных шагов и поступков.
В середине сентября Канделаки вышел из тюрьмы, но для Иосифа Джугашвили ничто не изменилось. Тюремное заточение, в котором он находился уже почти три месяца, продолжалось. Когда 20 февраля 1902 года Тифлисское жандармское управление начало расследование («переписку») по делу «О тифлисском кружке РСДРП и образованном им центральном комитете», то список подозреваемых включал 79 фамилий.
21 июня ротмистр Засыпкин представил полковнику Е. Дебилю рапорт по итогам расследования со списком обвиняемых. В тот же день было принято постановление о привлечении к делу Иосифа Джугашвили. Основанием послужили показания жандармских агентов Сергея Кравченко и некоего Кишешьянца (Кешиньяна).
Уже на следующий день помощнику начальника Кутаисского ГЖУ С. Шабельскому было предложено допросить Джугашвили по новому обвинению. Допрос оказался безрезультатным И 30 июля полковник Дебиль информировал Департамент полиции, что «сего 8 июля согласно отдельного требования моего в г. Батуме был допрошен обвиняемый Иосиф Виссарионов Джугашвили, давший полное отрицание своей вины». Допрошенный 4 августа вторично Иосиф Джугашвили «снова не признал себя виновным».
Расследование по делу «О тайном кружке Российской социал-демократической рабочей партии в г. Тифлисе» было завершено 23 августа. К этому времени под арестом оставались лишь 7 человек: Калистрат Гогуа, Иосиф Джугашвили, Севериан Джугели, Георгий Караджев, Аркел Окуашвили, Васо Цабадзе, Захарий Чодри-швили. 29 августа начальник жандармского управления Е. Дебиль направил дело (№ 4602) товарищу (заместителю) прокурора Тифлисской судебной палаты Е. Хлодовскому.
Еще через полтора месяца, 12 октября, тот подписал заключение по результатам дознания, содержащее рекомендации о мерах наказания обвиняемых. Для Иосифа Джугашвили предлагалась высылка на два года в Сибирь. 15 октября Тифлисская судебная палата направила материалы следствия для утверждения главноначальствующему на Кавказе князю Голицыну.
Пересылая 31 октября документы дознания «о тифлисском социал-демократическом кружке рабочей партии» министру юстиции, в сопроводительном письме князь указывал: «Я не встречаю препятствий к разрешению означенного дознания согласно с заключением прокурора палаты». Однако до окончательного вынесения решения в столице прошло еще более полугода.
Царское правосудие осуществлялось медленно. Иосиф Джугашвили находился в тюрьме уже более семи месяцев, и, конечно, медлительность течения времени угнетала его. Однако узник не бездействовал. Он зорко следил за тем, что происходило в социал-демократической среде за тюремными стенами. Поддерживая связь с товарищами, он получал от них информацию, писал листовки и заочно участвовал во фракционных дискуссиях. Его активное и деятельное влияние на события, на состояние умов создало впечатление, будто бы он находится на воле, не только в среде социал-демократов.
В этот период ситуация приобрела почти комический характер. Его деятельная энергичность была столь впечатляюща, что даже сам начальник Тифлисского розыскного отделения ротмистр Лавров пребывал в твердой убежденности, что Иосиф Джугашвили находится на свободе «под особым надзором полиции».
И в начале 1903 года в своих докладах в Департамент полиции ротмистр регулярно сообщает о нем как главе Батумского социал-демократического комитета, инициативно участвующего в работе и активно борющегося со «старыми социалистами». В машине режима произошел какой-то сбой. Как лицо, находящееся на свободе «под особым надзором полиции», он числится даже в самом Департаменте полиции.
Это выглядит почти парадоксально. Кульминацией такого заблуждения стало то, что, когда в апреле 1903 года Тифлисское розыскное отделение переименовали в «охранное отделение» и город Батум был включен в сферу его ведения, ротмистр Лавров направил грозное предписание «обыскать и арестовать И.В. Джугашвили». Такое распоряжение развеселило подполковника С. Шабельского, который 28 апреля информировано уведомил коллегу, что «Иосиф Джугашвили уже год как содержится в тюрьме (ныне Кутаисской)».