Пьомбино пал очень быстро, Пьяноза – маленький тосканский островок – тоже не стал долго сопротивляться. Тогда сам понтифик почтил Пьомбино своим посещением, и там его встретили с невероятной пышностью. Все-таки не каждый день, и даже не каждый год в такой маленький город приезжает сам святой отец. Александр VI провел 4 дня в Пьомбино, а потом вместе с сыном и кардиналами они отплыли оттуда на роскошных галерах на остров Эльбу. На острове Борджиа праздновали свою победу над династией Аппиани, ранее правившей Пьомбино и Эльбой. Были организованы банкеты, представления и балы, со всех зданий сбивали гербы Аппиани, а Леонардо да Винчи руководил постройкой двух новых крепостей. На обратном пути суда понтифика попали в шторм. Буря пять дней трепала корабль Папы и его желудок. Все-таки понтифику был уже 71 год, и он плохо переносил морскую качку.
Наконец наступил черед Неаполитанского королевства. Два монарха – Людовик XII и Фердинанд II Арагонский – были заинтересованы в завоевании Неаполя. Испанский и французский послы донесли до Папы весть о секретном трактате, который был заключен в Гранаде в ноябре 1500 года между Людовиком XII и испанскими монархами Фердинандом II и Изабеллой Кастильской. Согласно этому документу сам Неаполь и Абруццо отходили Франции, а Калабрия и Апулия – Испании. 25 июня 1501 года Папа Александр VI лишил трона неаполитанского короля Федерико – Фридрих I Арагонского, обвинив его в том, что король призывал турок напасть на Италию. На самом деле Федерико даже в страшном сне не могло присниться такое, чтобы он вступил в союз с неверными. Настоящая причина лежала на поверхности – отказ его дочери Карлотты выйти замуж за Чезаре. Вот теперь наступил час расплаты. Герцог Валентинуа никогда не забывал и не прощал обиду.
Из Рима на Неаполь двинулось папское войско и французские отряды, а в Калабрию приплыла испанская армия под командованием полководца Гонсало да Кордоба. Федерико II решил просто так не сдаваться и засел в Неаполе, а основная часть его армии заняла оборону в Капуе – небольшом городке в 40 километрах от Неаполя. Именно здесь 4 года назад кардинал Чезаре Борджиа короновал Федерико как короля Неаполя. А теперь, наоборот, он явился как полководец и напал на город, чтобы свергнуть короля с трона. Если в прошлый раз жители Капуи аплодировали кардиналу Борджиа, то на этот раз они его проклинали. Чезаре яростно сражался и сам возглавил отряд французов, который обратил в бегство неаполитанское войско.
Среди тех, кто с ненавистью бился с армией герцога Валентинуа, был молодой человек Этторе Фьерамоска. Однажды в Риме несколько лет назад их пути пересеклись. Чезаре и Этторе влюбились в одну и ту же девушку Джиневру ди Монреаль. Джиневра предпочла Этторе и ответила ему взаимностью. Тогда Чезаре, который не терпел отказа, однажды поймал ее, силой заставил проглотить яд и держал в руках, как в тисках, пока девушка не умерла. С тех пор Этторе поклялся, что он отомстит проклятому убийце его возлюбленной. Но, к его сожалению, ему не удалось на этот раз убить Чезаре Борджиа.
Французы начали обстреливать стены города 17 июля, но только через неделю им удалось пробить в стене брешь. Жители Капуи отчаянно бились с войсками герцога Валентинуа и не сдавали свой город. Но среди них нашелся предатель, которого Чезаре подкупил, чтобы тот ночью открыл армии врага ворота Капуи. После этого последовала страшная резня: около 4 тысяч местных жителей были убиты на месте, солдаты не щадили ни стариков, ни детей. По улицам города текли реки крови, трупы валялись в каждом переулке. Женщины предварительно были изнасилованы все, включая старух и монахинь в монастырях.
Сам Чезаре, по слухам, выбрал себе 30 самых красивых женщин города для того, чтобы развлечься. Многие из них предпочли утопиться в водах реки Волтурно, чтобы не попасть в лапы Валентинуа. Но и это всего лишь слухи. На самом деле около 30 женщин было похищено и вывезено из города. Но куда и кем – никто не знает, и судьба бедных девушек покрыта мраком. А впоследствии слухи увеличили число женщин до 40. На самом деле такой гарем просто не поместился бы ни в палатке, ни в обозе Чезаре Борджиа, несмотря на все его распутство. А в летописях Капуи об этом событии вообще ничего не упоминается. Может, никакого похищения и не было, а был просто обоз куртизанок, которые сопровождали армию? Еще одна загадка истории.
После Капуи французская и папская армии захватили город Гаэта и через неделю достигли Неаполя. Фридрих I сбежал на остров Искья в надежде, что это временно и его спасут испанцы. Но его надежды оказались напрасны. Искья на время стала его новой резиденцией, где он еще мог чувствовать себя королем. Потом Фридрих выпросил у Людовика XII для себя графство Мэн и умер в городе Тур 9 ноября 1504 года в возрасте 53 лет. Его единственный сын Фердинанд был взят в плен и увезен в Испанию, где жил до самой своей смерти в возрасте 62 лет. Он был женат дважды, но не оставил законных потомков. Со смертью принца Фердинанда мужская линия династии Арагон-Неаполь вымерла.